Dallimi kryesor midis SF1 dhe SF2 është aftësia e tyre për të zbërthyer acidet nukleike. Ndërsa SF1 shpalos vetëm ADN-në, SF2 zbërthen si ADN-në ashtu edhe ARN-në.
Helikaza është një nga enzimat kryesore që merr pjesë në procesin e replikimit të ADN-së, si dhe në proceset e riparimit të ADN-së. Roli kryesor i helikazës është të marrë pjesë në procesin e shthurjes në mënyrë që të lehtësojë ndarjen e molekulave të ADN-së me dy fije. Aktiviteti i enzimës është thelbësor gjatë fazës së fillimit të replikimit të ADN-së. Helikazat ndahen si Super Familja 1 dhe Super Familja 2, kryesisht bazuar në dallimet e tyre strukturore. Brenda çdo Super Familje, ka lloje më të ndryshme të helikazave.
Çfarë është SF1?
Helikaza Super Family 1 është një lloj helikaze që përfshin një strukturë heksamerike së bashku me proteinën e brendshme të bërthamës, e cila përshkruan aktivitetin e helikazës. Helikaza SF1 është një nga klasat më të mëdha të helikazave dhe mund të kategorizohet më tej si helikaza SF1A dhe helikaza SF1B. Proteinat si PcrA, Rep dhe UvrD, i përkasin klasës së helikazave SF1A. Në krahasim, proteinat si RecA dhe Dda i përkasin klasës së helikazave SF1B. Funksionet e helikazave SF1 ndryshojnë shumë. Disa nga funksionet vitale të helikazave SF1 përfshijnë replikimin e ADN-së, rikombinimin e ADN-së, përpunimin e fragmenteve Okazaki, formimin e telomereve dhe riparimin e heqjes së nukleotideve të dëmtimit të ADN-së. Në disa specie bakteriale, helikazat e tipit SF1 gjithashtu marrin pjesë në ndihmën e transferimit horizontal të gjeneve nëpërmjet konjugimit. Për më tepër, te viruset, helikazat SF1 ndihmojnë në riprodhimin viral.
Figura 01: Veprimi i helikazës
Ka shumë motive të ndryshme që lidhen me strukturën e helikazave SF1. Ato përmbajnë të paktën 7 motive të konservuara midis të gjitha llojeve të ndryshme të helikazave SF1 (Q, I, Ia, II, III, IV, V dhe VI). Struktura e helikazës SF1 është një kristal, ku motivet janë të grumbulluara së bashku. Ekziston një xhep karakteristik i lidhjes ATP midis motiveve dhe vendit të lidhjes së ADN-së. Domenet jo të konservuara shpërndahen për të ruajtur integritetin strukturor të molekulës së helikazës. Këto domene mund të ndryshojnë midis helikazave SF1A dhe helikazave SF1B.
Çfarë është SF2?
Helikaza e superfamiljes 2 është një nga grupet më të larmishme të superfamiljeve të helikazave. Ka shumë lloje të helikazave SF2 si helikazat e ngjashme me RecQ, helikazat RecG-si, helikazat Rad3/XPD dhe NS3. Disa enzima kufizuese, të tilla si enzimat kufizuese të tipit I, gjithashtu bien në këtë kategori. Funksioni i përgjithshëm i helikazave SF2 është zbërthimi i ADN-së me dy zinxhirë. Megjithatë, disa lloje të helikazave SF2 nuk kanë aftësinë të veprojnë plotësisht si enzima helikaze. Helikazat SF2 përdoren gjerësisht edhe në përpunimin e ARN-së. Familja DEAD-box e helikazave SF2 merr pjesë në përpunimin e ARN-së, duke përfshirë transkriptimin, bashkimin, përpunimin e përkthimit dhe montimin e kompleksit ARN-proteinë.
Figura 02: Helikaza
Struktura e helikazës SF2 gjithashtu përmban motive të konservuara. Megjithatë, disa fusha ndryshojnë pak nga ajo e helikazës SF1. Ato përmbajnë gjithashtu një domen lidhës ATP përveç domenit të lidhjes së ADN-së.
Cilat janë ngjashmëritë midis SF1 dhe SF2?
- SF1 dhe SF2 tregojnë aktivitet helikase.
- Për më tepër, të dy marrin pjesë në replikimin dhe rikombinimin e ADN-së.
- SF1 dhe SF2 përbëhen nga motive të konservuara.
- Të dyja kanë një domen lidhës ATP dhe një domen lidhës të ADN-së.
- Këto forma janë proteina me shumë domene.
- Për më tepër, nëse ndodhin mutacione në secilin lloj, do të rezultojë në efekte të dëmshme.
- Të dyja SF1 dhe SF2 janë thelbësore për të siguruar vazhdimësinë e ciklit qelizor.
- SF1 dhe SF2 gjenden te prokariotët si dhe te eukariotët.
Cili është ndryshimi midis SF1 dhe SF2?
SF1 dhe SF2 janë dy super familje të helikazave. Ato tregojnë një larmi të gjerë. Dallimi kryesor midis SF1 dhe SF2 është se SF1 është i përfshirë kryesisht në zbërthimin e ADN-së, ndërsa SF2 gjithashtu merr pjesë në përpunimin e ARN-së gjatë transkriptimit dhe përkthimit. Kur krahasohen motivet e ndryshme të proteinës, SF1 dhe SF2 kryesisht ndryshojnë në bazë të motivit III dhe motivit IV. Edhe pse ato kanë një ngjashmëri strukturore, helikazat SF1 formojnë struktura heksamerike toroidale ndërsa SF2 nuk i formon këto rregullime strukturore.
Një tjetër ndryshim midis SF1 dhe SF2 është se helikazat SF1 preferojnë më shumë nukleotidet e adeninës, ndërsa helikazat SF2 preferojnë të pesë nukleotidet për t'u shtrirë. Kur krahasojmë drejtimin e shthurjes, helikazat SF1 zhvendosen vetëm në drejtimin 5' deri në 3', ndërsa helikazat SF2 kanë aftësinë të zhvendosen së bashku me acidet nukleike në të dy drejtimet.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis SF1 dhe SF2 në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – SF1 vs SF2
Helikazet janë një grup shumë i rëndësishëm dhe i larmishëm i enzimave që marrin pjesë në replikimin e ADN-së. Megjithatë, për shkak të diversitetit të lartë, enzimat kategorizohen në superfamilje. SF1 dhe SF2 janë dy super familjet më të mëdha të helikazave. Ndërsa SF1 lidhet kryesisht me përpunimin e lidhur me ADN-në, SF2 lidhet me përpunimin e ADN-së dhe ARN-së. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis SF1 dhe SF2. Për më tepër, SF1 dhe SF2 ndryshojnë gjithashtu në rregullimin e tyre strukturor pasi SF2 nuk formon struktura heksamerike. Mutacionet në helikazat SF1 dhe SF2 do të çojnë në zhvillimin e kancerit pas disrregullimit të ciklit qelizor dhe mekanizmave të tjerë jetësorë si riparimi i ADN-së.
