Dallimi kryesor midis testit LAMP dhe PCR është se LAMP kryhet në temperaturë konstante (60-650C) për të prodhuar kopje të ADN-së përmes amplifikimit, ndërsa PCR kryhet duke përdorur një seri ndryshimesh të temperaturës për të prodhuar kopje të ADN-së përmes amplifikimit.
LAMP dhe PCR janë të dyja teknika të amplifikimit in-vitro që përdoren për të prodhuar mijëra kopje të ADN-së. Sasia e ADN-së e prodhuar në LAMP është shumë më e lartë se sasia e prodhuar në teknikat PCR si RT-PCR. LAMP është një teknikë më e re në krahasim me teknikën PCR. Por është teknikisht e thjeshtë dhe e lehtë për një shkencëtar të trajnuar të kryejë në kushte laboratorike. Kjo e bën atë një teknikë potencialisht të dobishme për zbulimin e COVID-19. Sidoqoftë, RT-PCR është testi standard aktual për COVID-19. Këto teknika, ndonëse janë të njohura për studiuesit dhe mjekët me përvojë në amplifikimin e ADN-së, mund të jenë ende relativisht të panjohura për një komunitet më të gjerë.
Çfarë është Testi LAMP?
Amplifikimi izotermik i ndërmjetësuar nga laku (LAMP) për analizat e COVID-19 fillon me një grumbullim mostrash nga hunda ose fyti duke përdorur një shtupë. Mostrat gjithashtu mund të mblidhen duke përdorur metoda të tjera si p.sh. mukusit nga kollitja e fortë. Ashtu si teknika PCR si RT-PCR, ARN virale në kampion fillimisht konvertohet në ADN, e cila lejon që ajo të kopjohet. Reagimi LAMP kryhet në temperaturë konstante (60-650C).
Amplifikimi i ADN-së virale që përfshin teknologjinë LAMP dhe reagentët mund të zbulohet kur përzierja e reaksionit kthehet e turbullt për shkak të prodhimit të "pirofosfatit të magnezit". Kjo vranësira lejon diagnostikimin e lehtë të COVID-19 nga shkencëtarët dhe mjekët. Saktësia e rezultateve të testit mund të përmirësohet duke përdorur ngjyra të veçanta fluoreshente ose ngjyra që ndryshojnë ngjyrën në përzierjen e reaksionit. Këto ngjyra ndërveprojnë me ADN-në virale dhe intensiteti i ndryshimit të dritës ose ngjyrës mund të matet për të dhënë numrin e molekulave të ARN-së virale afërsisht që ishte fillimisht në mostër.
Çfarë është Testi PCR?
PCR është një teknikë shumë e zakonshme shkencore që është përdorur gjerësisht në kërkime dhe mjekësi për 20-30 vjet për të zbuluar ADN-në. Testet PCR përdoren drejtpërdrejt për të zbuluar një antigjen duke zbuluar ARN virale. Në përgjithësi, ARN virale është e pranishme në trup përpara se të zbulojë antitrupat ose të marrë simptomat e sëmundjes. Prandaj, një test PCR mund të tregojë nëse dikush e ka apo jo virusin herët. Aktualisht, PCR është testi standard për zbulimin e COVID-19. Ekzistojnë lloje të ndryshme të teknikave të PCR si PCR në kohë reale, PCR e vendosur, PCR multiplex, PCR e fillimit të nxehtë dhe PCR me rreze të gjatë, etj. PCR përdor një sërë ndryshimesh të temperaturës për të prodhuar kopje të ADN-së përmes amplifikimit.
RT-PCR është një version i veçantë i teknikës PCR. Përdoret kur zbulohet ARN. Tani përdoret për të testuar COVID-19. RT-PCR është një teknikë mjaft e ndjeshme dhe e besueshme. Në RT-PCR, pasi të mblidhet një mostër, kimikatet përdoren për të hequr proteinat, yndyrnat dhe molekulat e tjera të padëshiruara, duke lënë pas ARN-në. Enzimat e kompletit të testimit fillimisht konvertojnë ARN-në në ADN, e cila më pas amplifikon ADN-në virale në mënyrë që të zbulojë virusin. Ngjyrat fluoreshente përdoren zakonisht për t'u lidhur me ADN-në e përforcuar dhe për të prodhuar dritë. Kjo mund të lexohet nga makina për të prodhuar rezultatin e testit.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet testit LAMP dhe PCR?
- Janë teknika amplifikimi.
- Të dyja prodhojnë ADN të kopjuar.
- Ato janë teknika shumë të ndjeshme dhe të besueshme sesa teknika imune si zbulimi i antitrupave.
- Ato të dyja përdoren për testimin e COVID-19.
Cili është ndryshimi midis testit LAMP dhe PCR?
Dallimi kryesor midis testeve LAMP dhe PCR është se, në LAMP, amplifikimi arrihet duke përdorur një temperaturë konstante (60-650C), ndërsa në PCR, ciklimi i kërkohet temperatura. Aktualisht janë në dispozicion disa lloje të teknikave LAMP. Por më të rëndësishmet për zbulimin e COVID-19 janë teknika izotermike e ndërmjetësuar nga cikli i transkriptimit të kundërt (RT-LAMP) dhe amplifikimi i ndërmjetësuar nga transkripti (TMA). Për më tepër, lloje të ndryshme të teknikave të PCR-së janë gjithashtu të disponueshme aktualisht në praktikën klinike për diagnostikimin e sëmundjeve si PCR në kohë reale, RT-PCR, PCR e vendosur, PCR multipleks, PCR me fillim të nxehtë, PCR me rreze të gjatë, etj.
Infografia e mëposhtme liston ndryshimet midis testit LAMP dhe PCR në formë tabelare.
Përmbledhje – LAMP vs Testi PCR
Amplifikimi izotermik i ndërmjetësuar nga loop është një proces i ngjashëm me testet PCR si RT-PCR, por prodhon më shumë kopje të ADN-së virale në një temperaturë konstante. Testi i reaksionit zinxhir të polimerazës është aktualisht forma më e zakonshme dhe standarde e testimit në botë për diagnostikimin e sëmundjeve, siç është diagnoza e COVID-19. Ajo shihet si mjaft e besueshme. PCR përdor një sërë ndryshimesh të temperaturës për të prodhuar kopje të ADN-së përmes amplifikimit. Kështu, kjo përmbledh ndryshimin midis testit LAMP dhe PCR.
