Dallimi kryesor midis CRISPR dhe CRISPR Cas9 është se CRISPR (përsëritje e shkurtër palindromike e grumbulluar rregullisht e ndërthurur) është një mekanizëm mbrojtës imunitar prokariotik natyral, ndërsa CRISPR cas9 është një nukleazë Cas9 e drejtuar nga ARN, e cila është pjesë e CRISPR adaptive. sistemi imunitar.
CRISPR është një sistem imunitar mbrojtës antiviral që gjendet në baktere dhe arkea. Është një familje e sekuencave të ADN-së që gjenden në gjenomin bakterial. Ai përbëhet nga sekuenca ndarëse të cilat rrjedhin nga fragmentet e ADN-së të bakteriofagëve që i kishin infektuar më parë. Në infeksionet e mëvonshme virale, bakteret përdorin këto sekuenca për të shkatërruar ADN-në virale. Sekuencat CRISPR kanë përsëritje të shkurtra palindromike dhe sekuenca ndarëse. Për më tepër, sekuencat e përsëritura të ndarjes CRISPR shpesh kanë gjene të lidhura që kodojnë për proteinat Cas. Cas9 është një endonukleazë e drejtuar nga ARN. Së bashku me sekuencat CRISPR, proteina Cas9 vepron si një sistem imunitar adaptiv në baktere kundër bakterofagëve.
Çfarë është CRISPR?
CRISPR do të thotë Përsëritje të shkurtra palindromike të grumbulluara rregullisht me hapësirë. Është një grup i sekuencave të ADN-së që gjenden në gjenomin bakterial. Ai funksionon si një mekanizëm natyror mbrojtës në bakteret dhe u identifikua për herë të parë në E. coli. Në bakteret, ajo vepron si mbrojtje adaptive imune, veçanërisht kundër bakteriofagëve. Prandaj, është një mekanizëm specifik për sekuencën.
Figura 01: CRISPR
Sistemi CRISPR përmban disa sekuenca të përsëritura të ADN-së me segmente të shkurtra. Këto përsëritje janë palindromike, kanë të njëjtën sekuencë bazë kur lexojmë nga 5' në 3' ndërsa tjetra jep të njëjtën sekuencë kur lexon nga 3' në 5'. Për më tepër, përsëritjet janë identike. Ato janë të vendosura midis sekuencave të shkurtra të ADN-së “hapësirë” që nuk janë identike. Por këto sekuenca të ADN-së ndarëse janë të ngjashme ose përputhen me ADN-në e huaj të bakteriofagut. Gjenet e lidhura me CRISPR njihen si gjenet e lidhura me CRISPR ose gjenet Cas. Gjenet Cas kodojnë për proteinat Cas të cilat janë helikaza ose nukleaza. Helikazat zbërthejnë ADN-në ndërsa nukleazat e prenë ADN-në. Në përgjithësi, kur merret parasysh CRISPR, ai është një sistem imunitar bakteresh që punon kundër bakterofagëve (bakteret që infektojnë viruset).
Çfarë është CRISPR Cas9?
Cas9 ose proteina 9 e lidhur me CRISPR është një endonukleazë bakteriale e drejtuar nga ARN. Prandaj, është një enzimë që njeh dhe pret ADN-në e synuar (veçanërisht ADN-në e bakteriofagut) komplementare me ARN-në udhëzuese. Kryen ndarje specifike të fillesë. Proteina Cas9 kodohet nga një gjen i lidhur me CRISPR. CRISPR cas9 është sistemi i nukleazës CRISPR-Cas9 i drejtuar nga ARN, i cili mund të përdoret si një platformë shënjestrimi dhe redaktimi i ADN-së i programueshëm nga ARN për redaktimin e gjenomit, shqetësimin transkriptues, modulimin epigjenetik dhe imazhin e gjenomit. Ky sistem CRISPR cas9 është shumë i popullarizuar në sistemet aktuale të redaktimit të gjenomit.
Figura 02: CRISPR Cas9
Për momentin, sistemi CRISPR/Cas9 përdoret për të ndryshuar ose modifikuar gjenomin e gjitarëve ose me shtypjen e transkriptimit ose me aktivizimin. Qelizat e gjitarëve mund t'i përgjigjen thyerjeve të ADN-së të ndërmjetësuara nga CRISPR/Cas9 duke adoptuar një mekanizëm riparimi. Mund të bëhet ose duke përdorur metodën e lidhjes fundore jo-homologe (NHEJ) ose riparimin e drejtuar nga homologjia (HDR). Të dy këta mekanizma riparimi ndodhin duke futur thyerje me dy fije. Kjo rezulton në modifikimin e gjeneve të gjitarëve. NHEJ mund të çojë në heqje të mutacioneve të gjeneve dhe mund të përdoret për të krijuar një humbje të efekteve të funksionit. HDR mund të përdoret për futjen e mutacioneve pika specifike ose futjen e segmenteve të ADN-së me gjatësi të ndryshme. Aktualisht, sistemi CRISPR/ Cas përdoret në fushat e aplikimeve terapeutike, biomjekësore, bujqësore dhe kërkimore.
Cilat janë ngjashmëritë midis CRISPR dhe CRISPR Cas9?
- Cas9 është pjesë e sistemit CRISPR Cas.
- Sistemi Crisper cas9 është një sistem imunitar që gjendet natyrshëm te bakteret.
Cili është ndryshimi midis CRISPR dhe CRISPR Cas9?
CRISPR është një grup i sekuencave të ADN-së që gjenden në gjenomin bakterial, i cili funksionon si një sistem mbrojtës natyror kundër bakterofagëve. Ai përbëhet nga përsëritje të shkurtra palindromike të ndërthurura rregullisht, ndarës dhe gjene të lidhur. Në të kundërt, cas9 është një proteinë 9 e lidhur me CRISPR, e cila është një enzimë endonukleazë e drejtuar nga ARN. Ai njeh dhe këput fijet e dyfishta të ADN-së të viruseve. Në fakt, është pjesë e sistemit të mbrojtjes CRISPR. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis CRISPR dhe CRISPR cas9.
Përmbledhje – CRISPR vs CRISPR Cas9
Sistemi CRISPR Cas është një sistem mbrojtës mikrobik. CRISPR është një grup i sekuencave të ADN-së i përbërë nga përsëritje të shkurtra palindromike, sekuenca ndarëse dhe gjene të lidhur. Cas9 është një proteinë Cas e cila është një endonukleazë e drejtuar nga ARN. CRISPR dhe proteina Cas9 krijojnë një sistem imunitar që punon kundër infeksioneve bakteriofag në baktere. Proteina Cas9 është në gjendje të copëtojë ADN-në e huaj virale dhe t'i prishë ato. CrRNA udhëzon cas9 për të njohur ADN-në virale. Prandaj, sistemi CRISPR cas9 është një sistem imunitar natyral që gjendet te bakteret kundër viruseve. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis CRISPR dhe CRISPR cas9.
