Dallimi kryesor midis sintenisë dhe kolinearitetit është se sintenia është bashkëlokalizimi fizik i lokacioneve gjenetike në të njëjtin kromozom në specie, ndërsa kolineariteti është bashkëlokalizimi fizik i vendndodhjeve gjenetike në të njëjtin kromozom në specie të ndryshme që ruajnë i njëjti renditje.
Sintenia dhe kolineariteti janë dy terma që përdoren në mënyrë të ndërsjellë në gjenomikë. Të dy termat përshkruajnë modelet e lokalizimit të gjeneve në kromozomet në specie të ndryshme. Këto rregullime të lidhura gjenesh midis taksave janë informacion i vlefshëm kur nxirret përfundimi i prejardhjes së përbashkët të gjeneve. Synteny i referohet bashkëlokalizimit fizik të lokacioneve gjenetike në të njëjtin kromozom në specie. Kolineariteti i referohet bashkëlokalizimit fizik të lokacioneve gjenetike në të njëjtin kromozom në specie të ndryshme që ruajnë të njëjtin rend. Prandaj, është një formë e sintenisë.
Çfarë është Synteny?
Në specie të ndryshme, ekziston një grup gjenesh të vendosura në të njëjtin kromozom. Dhe, ky bashkëlokalizimi fizik i gjeneve në të njëjtin kromozom në specie të ndryshme njihet si sinteni. Gjithashtu, këto gjene gjenden shumë afër njëri-tjetrit në një kromozom të vetëm. Rendi i gjeneve mund të mos jetë domosdoshmërisht i njëjtë. Por, lokalizimi i gjeneve pranë njëri-tjetrit në të njëjtin kromozom bëhet në sintenizëm. Prandaj, synteny kryesisht përshkruan modelin e shpërndarjes së gjeneve në një kromozom. Këto modele të bashkëlokalizimit të gjeneve tregojnë marrëdhëniet midis specieve të ndryshme dhe evolucionit të tyre. Megjithatë, sintenia mund të ndërpritet për shkak të rirregullimeve kromozomale të tilla si zhvendosjet, përmbysja dhe shkrirja e kromozomeve, etj. dublikime, humbje dhe rikombinim homolog të pabarabartë.
Figura 01: Synteny
Besohet se të gjitha gjenet e lidhura janë sintenike. Megjithatë, jo të gjitha gjenet sintenike janë domosdoshmërisht të lidhura. Ata posedojnë sekuenca të përbashkëta kromozomesh. Njerëzit kanë shumë gjene sintenike me gjitarët e tjerë. Për më tepër, shumë drithëra kanë gjene sintenike.
Çfarë është Kolineariteti?
Kolineariteti është një formë më specifike e sintenisë në të cilën një grup gjenesh ndodhen në të njëjtin kromozom të specieve të ndryshme në të njëjtin rend si në speciet stërgjyshore. Prandaj, nëse ka një devijim nga kolineariteti, ai do të jetë një karakter filogjenetik më i besueshëm pasi kolineariteti shpjegon prejardhjen e përbashkët të gjeneve.
Figura 02: Kolineariteti
Analiza e kolinearitetit me shumë rrugë ofron informacion shumë më të besueshëm për speciet e lidhura dhe filogjeninë e tyre.
Cilat janë ngjashmëritë midis Synteny dhe Kolinearitetit?
- Si në sinteninë dhe në kolinearitet, një grup lokacionesh në dy lloje të ndryshme ndodhet në të njëjtin kromozom.
- Këto terma përshkruajnë bashkëlokalizimin fizik të lokacioneve gjenetike në të njëjtin kromozom.
- Kolineariteti është një formë më specifike e sintenisë.
- Ndonjëherë të dy termat përdoren në mënyrë të ndërsjellë në gjenomikë.
- Nëse dy rajone kanë kolinearitet, ato janë padyshim sintenike.
- Ato janë të dobishme në nxjerrjen e filogjenisë.
Cili është ndryshimi midis sintenisë dhe kolinearitetit?
Sintenia dhe kolineariteti janë dy terma që përdoren në mënyrë të ndërsjellë në gjenomikë. Synteny i referohet bashkëlokalizimit fizik të një grupi gjenesh në të njëjtin kromozom në specie të ndryshme. Kolineariteti është një formë e sintenisë në të cilën grupi i gjeneve bashkë-lokalizohet në të njëjtin rend midis specieve të ndryshme. Prandaj, ky është ndryshimi kryesor midis sintenisë dhe kolinearitetit.
Përmbledhje – Synteny vs Kolineariteti
Termat sinteni dhe kolinearitet i referohen një grupi gjenesh që ndodhen në të njëjtin kromozom në specie të ndryshme. Në fakt, këto gjene janë të bashkë-lokalizuara në të njëjtin kromozom në specie të ndryshme. Synteny përshkruan bashkëlokalizimin fizik të gjeneve të grupit në të njëjtin kromozom në specie të ndryshme, ndërsa kolineariteti është një formë më specifike e sintenisë në të cilën grupi i gjeneve bashkë-lokalizohet në të njëjtin rend. Kështu, kjo përmbledh ndryshimin midis sintenisë dhe kolinearitetit.
