Diferenca kryesore – RNASE A vs RNASE H
Ribonukleazat janë nukleaza që degradojnë në mënyrë specifike ARN-në në njësi më të vogla. Ato mund të ndahen në dy kategori; endoribonukleazat dhe ekzoribonukleazat. Endoribonukleaza është një endonukleazë që mund të degradojë ARN me një zinxhir ose me dy zinxhirë. Ai shkëput lidhjet fosfodiesterike brenda një zinxhiri polinukleotid ARN. Shembujt janë RNaza A, RNaza III, RNaza T1, RNaza P dhe RNaza H. Exoribonukleaza është një ekzonukleazë që degradoi ARN-në duke hequr nukleotidet terminale nga fundi 5' ose 3' i molekulës së ARN-së. Shembujt janë RNase R, RNase II, RNase D dhe RNase PH. Dallimi kryesor midis RNASE A dhe RNASE H është se RNaza A është një ribonukleazë pankreatike që degradon në mënyrë specifike ARN me një fije floku në komponentë më të vegjël ndërsa RNaza H është një enzimë jo specifike që copëton ARN-në në hibridin ARN-ADN në njësi më të vogla nëpërmjet mekanizmi hidrolitik.
Çfarë është RNASE A?
RNaza A është një ribonukleazë pankreatike që copëton në mënyrë specifike mbetjet e paçiftuara të citozinës dhe uracilit në fundin 3' të ARN-së me një zinxhir. RNaza H funksionon në një përqendrim më të lartë të kripës (0.3M ose më i lartë përqendrim NaCl). Reaksioni hidrolitik është në dy hapa. Ai formon një produkt 3' të fosforiluar nëpërmjet një ndërmjetësi ciklik monofosfat 2', 3'. Edhe pse është specifike për ARN me një fije floku në përqendrim më të lartë të kripës, ajo gjithashtu mund të degradojë ARN dhe ARN me dy zinxhirë në hibridin ARN-ADN në përqendrim më të ulët të NaCl (më i ulët se 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield së pari sintetizoi këtë enzimë. RNase A është një enzimë shumë e njohur në kërkimin molekular. RNaza A e pankreasit të gjedhit është një shembull i RNazës A. Dhe është një nga enzimat më të forta që përdoret në laborator. Kjo enzimë nuk ka nevojë për një kofaktor për aktivitetin e saj. Është një enzimë shumë e qëndrueshme termike. RNaza A është enzima e parë dhe proteina e tretë tek e cila u zbulua sekuenca e saktë e aminoacideve. Kjo enzimë është shumë e vogël me 124 aminoacide dhe masë molekulare prej 12600da. Dhe ka katër mbetje histidine (His 12 dhe His 119 të cilat përfshijnë reaksionin katalitik).
Figura 01: RNase A
RNaza A mund të izolohet duke zier një mostër të papërpunuar. Kur zien, të gjitha enzimat e tjera degradojnë RNazën A të mbetur. RNaza A është një enzimë jashtëzakonisht e qëndrueshme. Kjo enzimë frenon me proteinën frenuese të ribonukleazës, komplekset e metaleve të rënda dhe uridinës vanadate.
Çfarë është RNase H?
RNase H është një enzimë ribonukleazë jospecifike që mund të degradojë ARN-në në hibrid ARN-ADN nëpërmjet reaksionit hidrolitik. RNaza H copëton lidhjen 3'- O-P të ARN-së në një hibrid ARN-ADN. Në fund të fundit prodhon produkte me 3'OH dhe 5' fosfate. Në replikimin e ADN-së, ajo luan një rol kryesor duke hequr primerin e ARN-së pasi të formohen vargjet e reja të ADN-së. Në kushte laboratorike, ai degradon në mënyrë specifike ARN-në në hibrid ARN-ADN, por jo ADN-në dhe ARN-në e pahibridizuar. Dhe kjo enzimë zakonisht përdoret për të shkatërruar shabllonin e ARN-së pasi të formohet vargu i parë plotësues i ADN-së gjatë sintezës së cDNA.
Figura 02: RNase H
RNase H përdoret gjithashtu në analizat e mbrojtjes së nukleazës. Ajo gjithashtu mund të përfshihet në heqjen e bishtit poli A nga mARN. RNaza H ka aftësinë të shkatërrojë ARN-në jo-koduese brenda dhe jashtë qelizës. Jonet metalike kërkohen si kofaktorë për këtë aktivitet proteinik. Një chelator (EDTA) mund të përdoret për të frenuar enzimën RNase H.
Cilat janë ngjashmëritë midis RNASE A dhe RNASE H?
- Të dyja janë proteina në natyrë.
- Të dyja janë endoribonukleazë
- Të dyja mund të degradojnë ARN.
- Të dyja kryejnë reaksione hidrolitike.
- Laboratorët molekularë përdorin të dyja këto.
Cili është ndryshimi midis RNASE A dhe RNASE H?
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNaza A është një ribonukleazë pankreatike që çan në mënyrë specifike skajin 3' të mbetjeve të paçiftuara të citozinës dhe uracilit të ARN-së me një fije floku në përqendrim më të lartë të kripës. | RNaza H është një enzimë ribonukleazë jospecifike që mund të degradojë ARN në hibrid ARN-ADN nëpërmjet reaksionit hidrolitik. |
| Natyra e ndarjes së ARN-së | |
| RNaza A çan në mënyrë specifike ARN-në me një zinxhir në përqendrim më të lartë të kripës. | RNaza H copëton ARN në hibridin ARN-ADN. |
| Nevoja për bashkëfaktorë për aktivitet | |
| RNaza A nuk ka nevojë për kofaktorë për aktivitetin e saj. | RNaza H ka nevojë për jone metalike si kofaktorë për aktivitetin e saj. |
| Frenuesit e aktivitetit proteinik | |
| Proteina frenuese e ribonukleazës, komplekset e metaleve të rënda dhe uridinës vanadate frenojnë aktivitetin e ARNazës A. | Një kelator (EDTA) pengon aktivitetin e RNazës H. |
| Heqja e primerit të ARN-së në replikimin e ADN-së | |
| RNaza A nuk përdoret për heqjen e primerit të ARN-së në replikimin e ADN-së. | RNaza H përdoret për heqjen e primerit të ARN-së në replikimin e ADN-së |
| Heqja e shabllonit të ADN-së në sintezën plotësuese të ADN-së (C-DNA) | |
| RNaza A nuk përdoret për heqjen e shabllonit të ARN-së gjatë sintezës plotësuese të ADN-së (C-DNA). | RNase H përdoret për heqjen e shabllonit të ARN-së gjatë sintezës plotësuese të ADN-së (C-DNA). |
| Heqja e Poly-A-Tail në mRNA të hibridizuar në Oligo (dt) | |
| RNaza A nuk përdoret për të hequr "bishtin poli-A" në mRNA të hibridizuar me oligo (dt). | RNaza H përdoret për të hequr "bishtin poli-A" në mRNA të hibridizuar me oligo (dt) |
Përmbledhje – RNASE A vs RNASE H
Ribonukleazat janë enzima nukleaza që kanë aftësinë për të ndarë ARN-në në njësi më të vogla. Ato janë dy llojesh; endoribonukleazat dhe ekzoribonukleazat. Endoribonukleaza është një endonukleazë e cila ka aftësinë të degradojë ARN me një fije ose me dy fije. Dhe shkëput lidhjen fosfodiesterike brenda një zinxhiri polinukleotid ARN. RNaza A dhe RNaza H janë dy endoribonukleaza. RNaza A është një ribonukleazë pankreatike që copëton në mënyrë specifike mbetjet e citozinës dhe uracilit të paçiftuar në fundin 3' të ARN-së me një fije floku në përqendrim më të lartë të kripës. RNaza H është një enzimë ribonukleazë jospecifike që mund të degradojë ARN-në në hibrid ARN-ADN nëpërmjet reaksionit hidrolitik. Ky është ndryshimi midis RNase A dhe RNase H.
Shkarko PDF RNASE A vs RNASE H
Mund të shkarkoni versionin PDF të këtij artikulli dhe ta përdorni për qëllime jashtë linje sipas shënimit të citimit. Ju lutemi shkarkoni versionin PDF këtu Dallimi midis RNASE A dhe RNASE H
