Dallimi kryesor midis sekuencës së konservuar dhe konsensusit është se sekuenca e konservuar i referohet sekuencave të ngjashme të acideve nukleike ose aminoacideve që ndodhin në specie të ndryshme ose të njëjta gjatë brezave, ndërsa sekuenca konsensus është një sekuencë nukleotidesh ose sekuencë aminoacide e hasur zakonisht. në një rajon shumë të konservuar të ADN-së ose ARN-së ose proteinës.
Organizmat ndajnë karakteristika të ngjashme si dhe të ndryshme. Gjatë studimit të marrëdhënieve ndërmjet organizmave dhe klasifikimit të tyre, gjenomi ose përbërja gjenetike e organizmave është shumë e rëndësishme. Ekzistojnë disa sekuenca nukleotide ose aminoacide që janë të zakonshme midis organizmave të ndryshëm. Një sekuencë e konservuar është një sekuencë e acidit nukleik ose aminoacideve që është e qëndrueshme midis specieve. Prandaj, ato janë filogjenetike të rëndësishme kur gjenerojnë pemë filogjenetike. Në sekuencat e konservuara, ka sekuenca specifike nukleotide që gjenden më shpesh. Ato njihen si sekuenca konsensusi.
Çfarë është sekuenca e ruajtur?
Një sekuencë e ruajtur është një sekuencë e acidit nukleik ose sekuencë aminoacide që është e ngjashme midis specieve. Prandaj, ajo është e qëndrueshme në të gjithë speciet gjatë evolucionit. Në përgjithësi, këto sekuenca mbahen nga seleksionimi natyror. Ato mbeten të pandryshuara shumë prapa pemës filogjenetike. Prandaj, sekuencat e konservuara janë të rëndësishme në ndërtimin e pemëve filogjenetike. Besohet se sekuencat shumë të ruajtura shpesh kanë një vlerë të rëndësishme funksionale. Ato janë të dobishme edhe në identifikimin e sëmundjeve gjenetike. Megjithatë, sekuencat e konservuara mund të jenë sekuenca koduese ose jokoduese të acidit nukleik. Përveç kësaj, sekuencat e konservuara tregojnë ritme më të ngad alta të mutacionit. Prandaj, ato shfaqin ndryshime shumë minimale në përbërjen e tyre; ndonjëherë, ato nuk shfaqin ndryshime gjatë gjithë brezave.
Figura 01: Sekuenca e ruajtur
Përbërësit ARN të ribozomeve janë të pranishëm në të gjitha fushat e jetës, sekuencat homeobox në eukariotët dhe tmARN në baktere janë disa shembuj të sekuencave shumë të konservuara. Identifikimi i sekuencave të konservuara është i lehtë kur përdoren qasjet e bioinformatikës, veçanërisht mjeti i shtrirjes së sekuencave. Për më tepër, rreshtimi i shumëfishtë i sekuencave lehtëson vizualizimin e sekuencave të konservuara.
Çfarë është Sekuenca e Konsensusit?
Një sekuencë konsensusi është një sekuencë që zakonisht gjendet në një rajon të caktuar të konservuar të ADN-së ose ARN-së. Është një sekuencë nukleotide shumë specifike. Si shembull, ekziston një sekuencë konsensusi në -10 si TATAAT (kutia Pribnow) në promotorët E. coli, të cilat janë sekuenca shumë të ruajtura. Në mënyrë të ngjashme, ekziston një sekuencë tjetër konsensusi: TTGACA në promotorët E. coli në -35 gjithashtu. Sekuencat e konsensusit njihen gjithashtu si "kuti".
Figura 02: Sekuenca konsensusi
Përveç ADN-së dhe ARN-së, proteinat kanë gjithashtu sekuenca konsensusi të aminoacideve. Vendet e lidhjes së proteinave shpesh përfaqësohen nga sekuenca konsensusi. Enzimat kufizuese kanë gjithashtu sekuenca konsensusi. Për më tepër, vendet e bashkimit janë gjithashtu sekuenca konsensusi. Ngjashëm me sekuencat e konservuara, sekuencat e konsensusit mund të llogariten dhe vizualizohen nga mjetet e bioinformatikës.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet sekuencës së konservuar dhe konsensusit?
- Sekuencat e konservuara dhe të konsensusit janë sekuenca të acideve nukleike ose aminoacideve që janë të zakonshme në të gjithë speciet.
- Si sekuencat e konservuara ashtu edhe ato të konsensusit mund të vizualizohen nga mjetet e bioinformatikës.
- Ato përdoren gjerësisht në biologjinë molekulare.
Cili është ndryshimi midis sekuencës së konservuar dhe konsensusit?
Sekuenca e konservuar është një sekuencë e acidit nukleik ose aminoacid që është e qëndrueshme midis specieve ndërsa sekuencat e konsensusit janë baza ose aminoacide shumë specifike dhe që gjenden zakonisht në një rajon të caktuar të konservuar. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis sekuencës së konservuar dhe konsensusit. Për më tepër, një ndryshim tjetër midis sekuencës së konservuar dhe konsensusit është se sekuencat e konservuara janë filogjenetikisht të rëndësishme ndërsa sekuencat e konsensusit janë shpesh vende lidhëse të proteinave, vende bashkimi, vende të prerjes së enzimës kufizuese, etj.
Përmbledhje – Sekuenca e konservuar kundër konsensusit
Sekuencat e konservuara janë sekuencat e acideve nukleike ose proteinave që janë të ngjashme midis specieve të gjalla. Një promotor, vend i lidhjes së ribozomeve, një origjinë e replikimit dhe sekuenca aminoacide e proteinës së histonit janë disa shembuj të sekuencave të konservuara. Në të kundërt, sekuencat e konsensusit janë baza specifike ose aminoacide të cilat gjenden më shpesh në një sekuencë të caktuar të konservuar. -10 kuti, -35 kuti e promotorit E. coli, vendet e lidhjes së proteinave, vendet e bashkimit dhe enzimat kufizuese që njohin vendet janë disa shembuj të sekuencave të konsensusit. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis sekuencës së konservuar dhe konsensusit.
