Dallimi kryesor midis ITS1 dhe ITS2 është se ITS1 është një ADN ndarëse e vendosur midis gjeneve rRNA 18S dhe 5.8S te eukariotët, ndërsa ITS2 është një ADN ndarëse e vendosur midis gjeneve të rRNA 5.8S dhe 28S te eukariotët.
Spaceri i brendshëm i transkriptuar (ITS) është ADN-ja ndarëse e vendosur zakonisht midis ARN-së ribozomale të njësisë së vogël dhe gjeneve të ARN-së ribozomale të nën-njësive të mëdha në kromozom ose në rajonin përkatës të transkriptuar në molekulën e transkriptit pararendës policistronik rRNA. Në bakteret dhe arkeat, ekziston vetëm një ITS i vetëm midis gjeneve 16S dhe 23S rRNA. Por te eukariotët, ekzistojnë dy ADN ndarëse të ITS: ITS1 (midis 18S dhe 5.gjenet 8S rRNA) dhe ITS2 (midis 5.8S dhe 28S rRNA). Prandaj, ITS1 dhe ITS2 janë dy ADN ndarëse të gjetura midis gjeneve rRNA në eukariotët.
Çfarë është ITS1?
ITS1 është një ADN ndarëse e vendosur midis gjeneve 18S dhe 5.8S rRNA në eukariotët. ITS i referohet një pjese të ADN-së ndarëse jofunksionale të vendosur midis gjeneve rRNA. ITS1 ka një variacion më të madh të gjatësisë se ITS2. Variacioni i gjatësisë së ITS1 është afërsisht (200-300 bp). Shënuesit e ITS si ITS1 kanë vërtetuar efikasitetin e tyre në sqarimin e marrëdhënieve filogjenetike midis taksave të ndryshme. Për më tepër, ADN-ja ndarëse ITS1 është më pak e konservuar se ADN-ja e ndarësit ITS2. Strukturat ITS1 ruhen vetëm në njësi taksonomike shumë më të vogla. Çdo grup ribozomik eukariotik përmban gjithashtu rajone të quajtura ndarës të jashtëm të transkriptuar (5' dhe 3' ETS).
Figura 01: Rajoni ITS1
DNJ-ja ndarëse ITS1 është shumë afër ndarësit 5'të jashtëm të transkriptuar (5' ETS). Për më tepër, nëse dikush dëshiron të amplifikojë rajonin ITS1 për studimet e marrëdhënieve filogjenetike, ai duhet të përdorë një çift primer specifik (primera të kundërt dhe përpara) për këtë qëllim. Për të përforcuar rajonin ITS1, zakonisht përdoren dy grupe primerash në protokollet PCR të laboratorëve. Ato janë ITS1 përpara dhe ITS2 mbrapa ose ITS1 përpara dhe ITS4 mbrapa.
Çfarë është ITS2?
ITS2 është një ADN ndarëse e vendosur midis gjeneve 5.8S dhe 28S rRNA në eukariotët. Rajoni ITS2 ka një variacion gjatësi më të shkurtër se rajoni ITS1. Variacioni i gjatësisë së ITS2 është afërsisht (180-240 bp). Megjithatë, rajoni ITS2 është më i ruajtur se rajoni ITS1 në shumë njësi taksonomike. Ai identifikon se të gjitha sekuencat ITS2 ndajnë një bërthamë të përbashkët të strukturës dytësore. Për më tepër, 40% e rajonit ITS2 ruhet në mesin e të gjitha angiospermave, ndërsa është e mundur të përafrohet 50% e rajonit ITS2 përgjatë familjes dhe nivelit më të lartë.
Figura 02: Rajoni ITS2
Pavarësisht nga qëllimi i ruajtjes, përdorimi i rajonit ITS2 është gjithashtu shumë i popullarizuar si rajoni ITS1 në studimet e marrëdhënieve filogjenetike, veçanërisht në barkodimin e ADN-së kërpudhore. Për të përforcuar rajonin ITS2, një grup specifik primerësh përdoret përgjithësisht në protokollet PCR të laboratorëve. Kjo është përpara ITS1 dhe anasjelltas ITS4. Por kur protokolli PCR përdor këtë grup primer, ai gjithashtu përforcon rajonin ITS1 së bashku me rajonin ITS2. Më tej, ADN-ja e ndarësit ITS2 është shumë afër 3'ndarësit të jashtëm të transkriptuar (3' ETS).
Ngjashmëritë midis ITS1 dhe ITS2
- ITS1 dhe ITS2 janë dy ADN ndarëse të vendosura midis gjeneve të rRNA.
- Ato janë të pranishme vetëm në eukariotët.
- Të dyja mund të përforcohen duke përdorur çifte specifike primerash.
- Ato të dyja janë hequr në maturimin e rRNA si nënprodukte jofunksionale.
- Të dyja janë shumë të rëndësishme për studimet e marrëdhënieve filogjenetike, veçanërisht në barkodimin e ADN-së kërpudhore.
Diferenca midis ITS1 dhe ITS2
ITS1 është një ADN ndarëse e pranishme midis gjeneve 18S dhe 5.8S rRNA te eukariotët ndërsa ITS2 është një ADN ndarëse e vendosur midis gjeneve 5.8S dhe 28S rRNA te eukariotët. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis ITS1 dhe ITS2. Për më tepër, ITS1 ka variacion më të madh të gjatësisë në krahasim me ITS2. Nga ana tjetër, ITS2 ka një variacion gjatësi më të shkurtër në krahasim me ITS1. Ky është një tjetër ndryshim midis ITS1 dhe ITS2.
Infografia e mëposhtme liston ndryshimet midis ITS1 dhe ITS2 në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – ITS1 vs ITS2
Rajoni i transkriptuar i brendshëm (ITS) është një pjesë jofunksionale e ADN-së ndarëse e vendosur midis gjeneve rRNA. Në bakteret dhe arkeat, ekziston vetëm një rajon i vetëm ITS. Por në eukariotët, ekzistojnë dy rajone të ITS: ITS1 dhe ITS2. ITS1 është një ADN ndarëse që ndodhet midis gjeneve 18S dhe 5.8S rRNA te eukariotët, ndërsa ITS2 është një ADN ndarëse që ndodhet midis gjeneve të rRNA 5.8S dhe 28S te eukariotët. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis ITS1 dhe ITS2.
