Diferenca kryesore – VNTR vs STR
Studimet e ADN-së kanë dobi të jashtëzakonshme në kuptimin dhe përcaktimin e marrëdhënieve filogjenetike, diagnostikimin e sëmundjeve gjenetike dhe hartografimin e gjenomave të organizmit. Disa teknika të lidhura me analizën e ADN-së përdoren për identifikimin e një gjeni të veçantë ose të një sekuence ADN-je në një grup ADN-je të panjohur. Ata njihen si shënues gjenetikë. Markuesit gjenetikë përdoren në biologjinë molekulare për të identifikuar ndryshimet gjenetike midis individëve dhe specieve. Përsëritja e njëpasnjëshme e numrave të ndryshueshëm (VNTR) dhe përsëritja e shkurtër e radhës (STR) janë dy lloje të shënuesve gjenetikë që tregojnë polimorfizëm midis individëve. Të dy llojet janë ADN përsëritëse jokoduese të cilat janë përsëritje të njëpasnjëshme. Ato janë të renditura në kromozome në mënyrë kokë më bisht. VNTR është një seksion i gjenomit ku sekuenca e shkurtër nukleotide përsëritet disa herë. STR është një seksion tjetër i ADN-së brenda gjenomit i cili është i organizuar si njësi përsëritëse të përbërë nga dy deri në trembëdhjetë nukleotide në njëqind herë. Dallimi kryesor midis VNTR dhe STR është numri i nukleotideve në një sekuencë të përsëritur. Njësitë përsëritëse të VNTR përbëhen nga 10 deri në 100 nukleotide ndërsa njësia përsëritëse e STR përbëhet nga 2 deri në 13 nukleotide. VNTR dhe STR përdoren gjerësisht në studimet mjekoligjore.
Çfarë është VNTR?
Një përsëritje tandem është një sekuencë e shkurtër e ADN-së që përsëritet kokë më bisht në një vend të caktuar kromozomik. Nuk ka asnjë sekuencë ose nukleotid tjetër brenda përsëritjes së bashku. Ekzistojnë disa lloje të përsëritjeve të njëpasnjëshme në gjenom. VNTR është një lloj përsëritjeje tandem midis tyre që ka njësi përsëritëse që përbëhen nga 10 deri në 100 nukleotide. VNTR është një lloj minisateliti. Këto përsëritje tandem mund të gjenden në shumë kromozome. Ato janë të ndërthurura brenda gjenomit njerëzor dhe janë të vendosura kryesisht në rajonet nëntelomerike të kromozomeve.
VNTR tregojnë polimorfizëm të përsëritur të dyfishtë midis individëve. Gjatësia e VNTR në një vendndodhje të veçantë të kromozomit është shumë e ndryshueshme midis individëve për shkak të ndryshimit në numrin e njësive përsëritëse të organizuara në atë seksion të ADN-së. Prandaj, VNTR mund të përdoret si një mjet i fuqishëm në identifikimin e individëve dhe analiza VNTR përdoret në shumë fusha duke përfshirë gjenetikën, kërkimin e biologjisë, mjekësinë ligjore dhe shtypjen e gishtave të ADN-së. VNTR-të ishin shënuesit e parë gjenetikë të përdorur për të përcaktuar sasinë e transplantimit të palcës kockore. VNTR-të ishin gjithashtu shënuesit e parë polimorfikë të përdorur në profilizimin e ADN-së në mjekësi ligjore.
Figura 01: Variacioni i VNTR-ve në gjashtë individë
Analiza VNTR kryhet nëpërmjet polimorfizmit të gjatësisë së fragmentit kufizues të ndjekur nga hibridizimi jugor. Prandaj, ajo ka nevojë për një mostër të madhe të ADN-së. Interpretimi i profilit VNTR është gjithashtu problematik. Për shkak të këtyre kufizimeve, përdorimi i VNTR në gjenetikën mjeko-ligjore është kufizuar dhe është zëvendësuar nga analiza STR.
Çfarë është STR?
STR është një seksion shumë i përsëritur i ADN-së i cili përbëhet nga dy deri në trembëdhjetë njësi përsëritëse nukleotide të organizuara në mënyrë të dyfishtë. STR është e ngjashme me VNTR. Por ndryshon nga VNTR nga numri i nukleotideve në një sekuencë të përsëritur dhe numri i përsëritjeve. STR është një lloj mikrosateliti.
Analiza STR përfshihet në matjen e numrit të saktë të njësive të përsëritura. STR-të janë shumë të ndryshueshme midis individëve, të ngjashëm me VNT-të. Profilet e STR ndryshojnë nga personi në person. Prandaj, analiza STR përdoret në biologjinë molekulare për të krahasuar vendndodhjet specifike në ADN nga dy ose më shumë mostra. Prandaj STR-të konsiderohen si shënues të fuqishëm gjenetikë në biologjinë molekulare. Ai siguron një mjet të shkëlqyer për identifikimin e individëve për shkak të shkallës së tyre të lartë të polimorfizmit dhe gjatësisë relativisht të shkurtër.
Për momentin, STR-të janë mjeti më i zakonshëm i analizuar i polimorfizmit gjenetik në gjenetikën mjeko-ligjore. Shumica e rasteve mjeko-ligjore përfshijnë analizën polimorfike të STR. Locitë STR janë të përhapura në të gjithë gjenomin. Ka mijëra STR të vendosura në kromozome të cilat mund të përdoren në analizat mjeko-ligjore. Analiza STR nuk përfshin polimorfizmin e gjatësisë së kufizimit si analiza VNTR. Analiza STR nuk e pret ADN-në me enzimat kufizuese. Sondat specifike përdoren për të bashkangjitur rajonet e dëshiruara në ADN dhe duke përdorur teknikën PCR, përcaktohen gjatësitë e STR.
Figura 02: Variacioni i STR midis mostrave
Cilat janë ngjashmëritë midis VNTR dhe STR?
- VNTR dhe STR janë ADN jokoduese.
- Të dyja janë përsëritje të njëpasnjëshme.
- Të dy tregojnë polimorfizëm midis individëve për shkak të ndryshimit në gjatësinë e seksionit të ADN-së.
- Të dyja përdoren si shënues gjenetikë të fuqishëm në shtypjen e gishtave të ADN-së dhe në studimet mjeko-ligjore.
Cili është ndryshimi midis VNTR dhe STR?
VNTR vs STR |
|
| VNTR është një ADN përsëritëse jokoduese e cila ka një sekuencë të shkurtër nukleotide të përsëritur në mënyrë të njëpasnjëshme. | STR është një seksion shumë i përsëritur i ADN-së i cili përbëhet nga dy deri në trembëdhjetë njësi përsëritëse nukleotide të organizuara në mënyrë të njëpasnjëshme. |
| Madhësia | |
| VNTR janë më të mëdha se STR. | STR janë më të vogla se VNTR. |
| Numri i nukleotideve në sekuencën e përsëritur | |
| Njësia përsëritëse e VNTR përbëhet nga 10 deri në 100 nukleotide. | Njësia përsëritëse e STR përbëhet nga 2 deri në 13 nukleotide. |
Përmbledhje – VNTR vs STR
VNTR dhe STR janë dy shënues të fuqishëm gjenetikë të përdorur në biologjinë molekulare, veçanërisht në fushën e gjenetikës mjeko-ligjore. VNTR është një lloj minisateliti dhe STR është një mikrosatelit. VNTR dhe STR janë ADN jokoduese, shumë të përsëritura. Ato janë përsëritje të njëpasnjëshme. Struktura e përgjithshme e VNTR dhe STR janë të njëjta. Megjithatë, numri i nukleotideve në sekuencën e përsëritur dhe gjatësia janë të ndryshme. VNTR ka sekuenca të përsëritura që përbëhen nga 10 deri në 100 nukleotide. STR ka sekuenca të përsëritura të përbëra nga 2 deri në 13 nukleotide. Ky është ndryshimi midis VNTR dhe STR.
Shkarko versionin PDF të VNTR vs STR
Mund të shkarkoni versionin PDF të këtij artikulli dhe ta përdorni për qëllime jashtë linje sipas shënimeve të citimit. Ju lutemi shkarkoni versionin PDF këtu Dallimi midis VNTR dhe STR.
