shRNA vs siRNA
Gjatë procesit të ndërhyrjes në ARN (ARNi), shprehja e një gjeni të synuar rrëzohet me specifikë dhe selektivitet të lartë. ARNi është një proces natyror dhe përfshin ARN të vogla ndërhyrëse (siRNA) dhe ARN të shkurtra flokësh (shRNA) dhe shRNA dyfunksionale. Aktualisht, RNAi përdoret gjerësisht si një mjet për terapinë e personalizuar të kancerit. Aplikimet e ARNi në thelb kryhen me molekulat e siRNA me dy vargje të sintetizuara kimikisht dhe me molekulat shRNA me bazë vektori. Edhe pse këto dy molekula kanë rezultate të ngjashme funksionale, ato ndryshojnë në strukturën e tyre; Kështu, mekanizmat molekularë të veprimit, rrugët e ARN-së dhe efektet jashtë objektivit të këtyre dy molekulave ndryshojnë gjithashtu.
shRNA
shARN është një sekuencë e molekulës së vogël të ARN-së e cila bën një kthesë të ngushtë flokësh që mund të përdoret për të heshtur një shprehje të gjenit të synuar gjatë ARNi. Shprehja e shARN-së arrihet nga një vektor, i cili mund të jetë ose një virus ose një bakter ose nga shpërndarja e plazmideve. Ato sintetizohen në bërthamën e qelizave dhe transportohen në citoplazmë për procese të mëtejshme. Këto molekula kanë rrugë të ngjashme maturimi të miRNA; kështu sinteza e miARN-së ka ofruar bazën për të kuptuar sintezën e shARN-së. Ose ARN polimeraza II ose III mund të transkriptojnë shRNA përmes promotorëve të ARN polimerazës II ose III. Avantazhi i përdorimit të shARN-ve është se ato kanë shkallë relativisht të ulët të degradimit dhe qarkullimit. Disavantazhi është se ai ka nevojë për një vektor shprehjeje, i cili mund të shkaktojë disa probleme sigurie.
siRNA
siARN-të janë molekula të ARN-së me dy zinxhirë të përbëra nga 20-25 çifte bazash në gjatësi. Këto përdoren për shtypjen e gjeneve duke heshtur çdo gjen me sekuencë nukleotide plotësuese në rrugën ARNi. Shkatërrimi i gjenit nga transfektimi i siRNA është shpesh i pasuksesshëm për shkak të efektit kalimtar; sidomos në qelizat që ndahen me shpejtësi dhe shtypja nuk zgjat më shumë. Për të kapërcyer këtë problem, siRNA modifikohet duke futur një strukturë të shkurtër flokësh. Kjo molekulë e modifikuar e njohur më pas si shARN. shRNA duhet të konvertohet në siRNA nga një Dicer në mënyrë që të vazhdojë funksionin e tij normal.
Cili është ndryshimi midis shRNA dhe siRNA?
• Ndryshe nga siRNA, shARN ka një strukturë shtesë flokësh. shRNA është një version i modifikuar i siRNA.
• shRNA kërkon një vektor shprehjeje, ndërsa siRNA jo.
• shARN-ja mund të përdoret për eliminim afatgjatë ndërsa siRNA mund të përdoret vetëm për kokdaun afatshkurtër të gjeneve.
• Ndryshe nga shtypja e gjeneve të siRNA, shtypja e shRNA është afatgjatë dhe nëse futet nëpërmjet një vektori të përshtatshëm viral, mund të prodhojë efekte të përhershme të heshtjes së gjeneve.
• Dicer kërkohet të kthejë shRNA në molekulë siRNA në mënyrë që të ekzekutojë funksionet e saj normale.
