Dallimi kryesor midis CGH dhe grupit CGH është se CGH është një metodë citogjenetike molekulare tradicionale për analizimin e variacionit të numrit të kopjeve në ADN të një kampioni testues që ka një rezolucion më të ulët, ndërsa grupi CGH është një metodë citogjenetike molekulare plotësisht e automatizuar për duke analizuar variacionin e numrit të kopjeve në ADN-në e një kampioni testues që ka një rezolucion më të lartë.
CGH dhe grupi CGH janë dy teknika për të zbuluar variacionet e numrit të kopjeve tek individët. Variacioni i numrit të kopjeve i referohet seksioneve të gjenomit që përsëriten. Numri i kopjeve ndryshon ndërmjet individëve. Variacioni i numrit të kopjeve zakonisht kategorizohet në dy grupe: përsëritje të shkurtra dhe përsëritje të gjata. Një nga shembujt më të njohur për një variacion të shkurtër të numrit të kopjeve është përsëritja e trinukleotidit CAG në gjenin huntingtin. Kjo shkakton një çrregullim neurologjik të quajtur huntingtin. Shembulli më i mirë për variacionet e numrit të kopjeve të përsëritura të gjata është gjeni alfa amilazë, i cili shkakton rezistencë ndaj insulinës. Variacioni i numrit të kopjeve mund të zbulohet me teknika të tilla si FISH, CGH dhe grup CGH.
Çfarë është CGH?
CGH është një metodë citogjenetike tradicionale molekulare për analizimin e variacionit të numrit të kopjeve në ADN-në e një kampioni testues në krahasim me një mostër referencë. Ka një rezolucion më të ulët në krahasim me teknikat e automatizuara. Objektivi i kësaj teknike është të krahasojë shpejt dhe me efikasitet dy mostra të ADN-së gjenomike që dalin nga burime të ndryshme.
Figura 01: CGH
Procedura përfshin izolimin e ADN-së nga dy burime: testi dhe referenca. Pastaj hapi tjetër është etiketimi i pavarur i mostrave të ADN-së testuese dhe referuese me fluorofore me ngjyra të ndryshme. Më vonë, dy mostrat e ADN-së u denatyruan për të marrë mostrat e ADN-së me një fije floku. Së fundi, u krye hibridizimi i dy mostrave rezultante të ADN-së në një raport 1:1 me një përhapje normale të metafazës së kromozomeve. Dallimet kromozomale mund të identifikohen midis dy burimeve duke përdorur një mikroskop fluoreshent dhe softuer kompjuterik. Për më tepër, teknika CGH është në gjendje të zbulojë vetëm anomalitë kromozomale të pabalancuara.
Çfarë është Array CGH?
Array CGH është një metodë citogjenetike molekulare plotësisht e automatizuar për analizimin e variacionit të numrit të kopjeve në ADN-në e një kampioni testues në krahasim me një mostër referencë. Ka një rezolucion më të lartë dhe është zhvilluar për të minimizuar kufizimet e CGH tradicionale. Array CGH kombinon parimet e CGH me përdorimin e mikrovargjeve. Në vend që të përdorë përhapjen e kromozomeve metafazë, kjo metodë përdor rrëshqitje të renditura me segmente të vogla të ADN-së si objektiva. Këto mikrovargje u bënë duke depozituar dhe imobilizuar një sasi të vogël të ADN-së (sonda) në një suport xhami të ngurtë. Madhësia e sondave mund të ndryshojë nga oligonukleotidi në një kromozom artificial bakterial.
Figura 02: Array CGH
Pavarësisht nga sondat, metoda bazë e grupit CGH është e ngjashme me CGH. Pasi të përgatiten sondat që përmbajnë mikrovarg, dy mostrat e ADN-së (testi dhe referenca) të etiketuara me fluorofore të ngjyrave të ndryshme përzihen së bashku dhe shtohen në mikrovarg. Meqenëse ADN-ja në kampione është me një fije floku për shkak të denatyrimit, kjo ADN hibridizohet me sonda njëvargëshe të renditur. Duke përdorur një sistem imazhi dixhital, është e mundur të identifikohen ndryshimet kromozomale midis dy burimeve.
Cilat janë ngjashmëritë midis CGH dhe Array CGH?
- CGH dhe grupi CGH janë dy teknika për të zbuluar variacionet e numrit të kopjeve.
- Ato janë metoda molekulare citogjenetike.
- Të dyja metodat diagnostikojnë anomalitë kromozomale të çekuilibruara.
- Fluoroforet përfshihen në të dyja metodat.
- Të dyja metodat mund të përdoren për të zbuluar çrregullimet gjenetike për shkak të variacioneve të numrit të kopjeve.
- Ato përdoren gjerësisht në analizën gjenomike krahasuese.
Cili është ndryshimi midis CGH dhe Array CGH?
CGH është një metodë citogjenetike molekulare tradicionale për analizimin e variacionit të numrit të kopjeve në ADN-në e një kampioni testues që ka një rezolucion më të ulët, ndërsa grupi CGH është një metodë citogjenetike molekulare plotësisht e automatizuar për analizimin e variacionit të numrit të kopjeve në ADN-në e një kampioni testues. që ka një rezolucion më të lartë. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis CGH dhe grupit CGH. Për më tepër, në CGH, mostrat e testit dhe të ADN-së së referencës hibridizohen me një përhapje normale metafaze të kromozomeve, por në grupin CGH, mostrat e testit dhe të ADN-së referuese hibridizohen me sondat e ADN-së të imobilizuara që përmbajnë mikroarresë.
Infografia e mëposhtme liston ndryshimet midis CGH dhe grupit CGH në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – CGH vs Array CGH
CGH dhe grupi CGH janë dy teknika molekulare citogjenetike për të zbuluar anomalitë kromozomale të pabalancuara. Ato përdoren gjerësisht në analizat gjenomike krahasuese. CGH është një metodë citogjenetike tradicionale molekulare për analizimin e variacionit të numrit të kopjeve në ADN të një kampioni testues që ka një rezolucion më të ulët. Në të kundërt, grupi CGH është një metodë citogjenetike molekulare plotësisht e automatizuar për analizimin e variacionit të numrit të kopjeve në ADN-në e një kampioni testues që ka një rezolucion më të lartë. Kështu, kjo përmbledh ndryshimin midis CGH dhe grupit CGH.
