Dallimi kryesor midis crRNA tracrRNA dhe gARN është se crRNA është një nga dy llojet e ARN të CRISPR, e cila është plotësuese me sekuencën e synuar të ADN-së, ndërsa tracrRNA është lloji i dytë i ARN-së së CRISPR, i cili shërben si një skelë lidhëse për nukleazën Cas dhe gARN është një nga dy komponentët kryesorë të sistemit CRISPR-Cas9 të baktereve dhe arkeave, i cili njeh ADN-në e synuar dhe udhëzon proteinat Cas për të bërë ndarje të dyfishtë në ADN-në e synuar.
CRISPR do të thotë përsëritje të shkurtra palindromike të grumbulluara të rregullta të ndërthurura. Është një nga sistemet imunitare në baktere dhe arkea. Bakteret dhe arkeat e përdorin këtë sistem për të mbrojtur veten nga patogjenët viralë. Është një nga mekanizmat më të mahnitshëm që përfshin një modifikim gjenetik të suksesshëm. Ky mekanizëm (CRISPR-Cas9) përdoret si një mjet i ri për modifikimin e gjeneve në Bioteknologji. Ajo ka sjellë përparime të reja në bioteknologji, veçanërisht në fushën e inxhinierisë gjenetike.
Ka dy komponentë kryesorë të sistemit CRISPR-Cas9. Ato janë ARN udhëzuese (gRNA) dhe nukleaza të lidhura me CRISPR (Cas). ARN-ja udhëzuese është një sekuencë specifike e ARN-së që udhëzon proteinat Cas për të çarë ADN-në e synuar. ARN udhëzuese përbëhet nga dy lloje të ARN-së. Ato janë ARN krispr (crRNA) dhe tracrARN. Nukleazat e lidhura me CRISPR (Cas) janë endonukleaza jo specifike që bëjnë thyerje të dyfishtë në ADN-në e synuar. Duke bërë thyerje të dyfishtë në ADN-në e synuar, bakteret dhe arkeat drejtojnë mekanizmat e tyre endogjen të riparimit për të çaktivizuar ADN-në virale.
Çfarë është crRNA?
crRNA ose Crispr ARN është një nga dy llojet e ARN-së udhëzuese. Strukturisht, është një sekuencë nukleotide 17-20. Tipari më i vlefshëm i crRNA është se ai është plotësues me ADN-në e synuar. Prandaj, crRNA përputhet me sekuencën e ADN-së virale. Specifikimi i sistemit CRISPR-Cas 9 varet nga crARN. Në bakteret, crRNA ekziston e shkrirë me sekuencën tracrRNA, e cila është lloji i dytë i ARN-së CRISPR. Prodhimi i crRNA nxitet nga riekspozimi i baktereve ndaj një virusi. Kur ekspozohet, bëhet transkriptimi i gjenit që kodon për crRNA. Më pas, mekanizmi mbrojtës fillon kundër virusit.
Figura 01: Sistemi CRISPR-Cas9
Çfarë është tracrARN?
CrRNA trans-aktivizuese ose tracrRNA është pjesa e dytë e ARN-së udhëzuese ose CRISPR ARN. Ajo shqiptohet si ARN gjurmuese. tracrARN shërben si skelë lidhëse për proteinën endonukleazë Cas 9. Me fjalë të tjera, tracrRNA funksionon si dorezë për të drejtuar Cas9 drejt ADN-së së synuar. Strukturisht, tracrRNA ka 42 nukleotide. Ekziston i kombinuar me crRNA.
Çfarë është gARN?
ARN udhëzuese ose gARN është një nga dy komponentët kryesorë të sistemit imunitar CRISPR-Cas9. Është një sekuencë specifike e ARN-së e përbërë nga dy elementë: crRNA dhe tracrARN. gARN njeh ADN-në e synuar dhe drejton proteinat Cas për të bërë ndarje të dyfishta në ADN-në e synuar. Për ta bërë këtë, crRNA përbëhet nga një sekuencë plotësuese e ADN-së së synuar ndërsa tracrARN udhëzon proteinat Cas që punojnë si një dorezë.
Figura 02: gARN
Dizajnimi i gARN-së së saktë është një hap kritik në mjetin e modifikimit të gjeneve CRISPR-Cas9. Prandaj, suksesi dhe efikasiteti i redaktimit të sistemit CRISPR varen nga sekuenca e saktë e gARN. gARN mund të shprehet në qeliza nga një plazmid i transfektuar. Kur plazmidet e klonuara futen në qeliza, qelizat pritëse gjenerojnë gARN. GARN e gjeneruar më së shpeshti përfshin 100 çifte bazash.
Cilat janë ngjashmëritë midis crRNA tracrRNA dhe gARN?
- crRNA, tracrRNA dhe gARN janë sekuenca ARN që gjenden në baktere dhe arkea.
- Të gjithë i përkasin sistemit CRISPR.
- gARN është bërë nga crARN dhe tracrARN.
- Ata janë të përfshirë në njohjen e ADN-së së bakteriofagut dhe drejtimin e endonukleazave drejt ADN-së së synuar.
- Prandaj, të tre llojet e ARN-së janë të përfshirë në drejtimin e nukleazës Cas9 për të bërë thyerje të dyfishtë në materialet gjenetike të huaja pushtuese.
- Suksesi i eksperimentit CRISPR varet nga të tre llojet e ARN.
Cili është ndryshimi midis crRNA tracrRNA dhe gARN?
crRNA është një pjesë e gARN-së së CRISPR që është plotësuese me ADN-në e synuar, ndërsa tracrRNA është pjesa e dytë e gARN-së, e cila shërben si një skelë lidhëse për nukleazën Cas.gARN është kombinimi i crRNA dhe tracrRNA, dhe është një nga dy komponentët e sistemit CRISPR-Cas9, i cili njeh ADN-në e synuar dhe udhëzon nukleazat për të bërë ndarje të dyfishtë në ADN-në e synuar. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis crRNA tracrRNA dhe gARN.
Tabela e mëposhtme përmbledh ndryshimin midis crRNA tracrRNA dhe gARN.
Përmbledhje – crRNA vs tracrRNA vs gARN
Sistemi CRISPR-Cas9 është një sistem imunitar i baktereve dhe arkeave. Ky sistem përdoret si një mjet për modifikimin e gjeneve në Bioteknologji. CRISPR përbëhet nga dy lloje të ARN-së, përkatësisht CRISPR ARN (crRNA) dhe CRISPR ARN transaktive (tracrRNA). Ato njihen kolektivisht si ARN udhëzuese ose gARN. Kjo ARN njeh sekuencat e synuara të patogjenëve pushtues dhe udhëzon endonukleazat për të bërë thyerje të dyfishtë në ADN-në e synuar. Pasi bëhen thyerje të dyfishta në materialin gjenetik të huaj, mekanizmi endogjen i riparimit (bashkimi johomolog i skajit; NHEJ) çaktivizon ADN-në e huaj duke futur mutacione. Kështu, kjo përmbledh ndryshimin midis crRNA tracrRNA dhe gARN.
