Dallimi kryesor midis sekuencës Shine Dalgarno dhe Kozak është se sekuenca Shine Dalgarno është një vend lidhës ribozomal në ARN-në e dërguar bakteriale dhe arkeale, ndërsa sekuenca Kozak është një vend i fillimit të përkthimit të proteinave në shumicën e ARN-ve eukariote.
Shine Dalgarno dhe sekuenca Kozak janë dy sekuenca konsensusi që janë shumë të rëndësishme për fillimin e përkthimit. Në biologjinë molekulare, përkthimi është procesi me të cilin ribozomet në citoplazmë sintetizojnë proteinat pas procesit të transkriptimit. Në përkthim, një mARN (ARN lajmëtare) deshifrohet në një ribozom për të prodhuar një zinxhir specifik aminoacid jashtë bërthamës. Në mënyrë tipike, një ribozom nxit procesin e dekodimit duke lehtësuar lidhjen e sekuencave plotësuese të antikodonit tARN me kodonet mARN. Përkthimi vazhdon në tre faza: fillimi, zgjatja dhe përfundimi.
Çfarë është Sekuenca Shine Dalgarno?
Sekuenca Shine Dalgarno është një vend lidhës ribozomik në ARN-në e dërguar bakteriale dhe arkeale. Zakonisht ndodhet rreth 8 baza në rrjedhën e sipërme të kodonit fillestar AUG. Kjo sekuencë e ARN-së ndihmon në rekrutimin e ribozomeve në ARN-në e dërguar duke e lidhur ribozomin me një kodon fillestar mRNA. Kështu, ajo fillon sintezën e proteinave. Pasi pas rekrutimit, tARN mund të shtojë aminoacide në sekuencë siç diktohet nga kodonet mARN. Kjo sekuencë e veçantë është e zakonshme në bakteret, por më e rrallë në arkea. Për më tepër, ajo është gjithashtu e pranishme në transkriptet e kloroplastit dhe mitokondriale. Sekuenca e Shine Dalgarno u propozua për herë të parë nga shkencëtarët australianë John Shine dhe Lynn Dalgarno. Sekuenca e konsensusit me gjashtë bazë është AGGAGG. Për shembull, në Escherichia coli sekuenca është AGGAGGU.
Figura 01: Sekuenca e Shkëlqimit Dalgarno
Zgjedhja e vendit të fillimit (AUG) varet nga ndërveprimi midis nën-njësisë 30S të ribozomit dhe shabllonit të mRNA. Rajoni i pasur me pirimidinë në përbërësin 16srRNA të nën-njësisë 30S lidhet me rajonin e pasur me purinë të njohur si sekuenca Shine Dalgarno në rrjedhën e sipërme të kodonit të fillimit AUG në mRNA. Për më tepër, gjatë formimit të kompleksit fillestar, këto sekuenca nukleotide plotësuese çiftëzohen për të formuar një strukturë të ARN-së me dy vargje. Kjo lehtëson lidhjen e ARN-së me një ribozom në mënyrë të tillë që kodoni fillestar të vendoset në vendin P të ribozomit.
Çfarë është Sekuenca Kozak?
Sekuenca Kozak është një vend i fillimit të përkthimit të proteinave në shumicën e mARN-së eukariote. Kjo sekuencë quhet edhe sekuenca e konsensusit Kozak. Sekuenca Kozak është sekuenca optimale për fillimin e përkthimit në eukariotët. Kjo sekuencë është një aspekt integral i rregullimit të proteinave. Është gjithashtu shumë i rëndësishëm për shëndetin e përgjithshëm qelizor. Ndihmon në korrigjimin e përkthimit të proteinave nga mesazhet gjenetike duke ndërmjetësuar grumbullimin e ribozomit dhe fillimin e përkthimit.
Figura 02: Sekuenca Kozak
Kjo sekuencë u emërua pas shkencëtares që e zbuloi, Marilyn Kozak. Ajo e zbuloi atë përmes një analize të detajuar të sekuencave gjenomike të ADN-së. Sekuenca Kozak është 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Shkronjat e mëdha tregojnë bazat e konservuara, ndërsa shkronjat e vogla tregojnë bazat e zakonshme të variablave. R tregon një purinë (adeninë ose guaninë) që është gjithmonë e pozicionuar në këtë vend.
Cilat janë ngjashmëritë midis sekuencës Shine Dalgarno dhe Kozak?
- Shine Dalgarno dhe sekuenca Kozak janë dy sekuenca konsensusi që janë shumë të rëndësishme në fillimin e përkthimit.
- Të dyja janë sekuenca ARN.
- Nën-njësia më e vogël e ribozomit lidhet me të dy sekuencat.
- Të dyja sekuencat ndërmjetësojnë montimin e duhur të ribozomit dhe fillimin e përkthimit.
- Ato janë aspekte integrale të rregullimit të proteinave dhe shëndetit të përgjithshëm qelizor.
Cili është ndryshimi midis sekuencës Shine Dalgarno dhe Kozak?
Sekuenca Shine Dalgarno është një vend lidhës ribozomik që gjendet në ARN-në e dërguar bakteriale dhe arkeale, ndërsa sekuenca Kozak është një vend i fillimit të përkthimit të proteinave që gjendet në shumicën e ARN-së eukariote. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis sekuencës Shine Dalgarno dhe Kozak. Për më tepër, sekuenca Shine Dalgarno është 5'AGGAGGU3' ndërsa, sekuenca Kozak është 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
Infografia e mëposhtme liston ndryshimet midis sekuencës Shine Dalgarno dhe Kozak në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Sekuenca Shine Dalgarno vs Kozak
Sekuencat Shine Dalgarno dhe Kozak janë dy sekuenca konsensusi të ARN-së që janë shumë të rëndësishme për montimin e ribozomit dhe fillimin e përkthimit. Sekuenca e Shine Dalgarno është një vend lidhës ribozomik në ARN-në e dërguar bakteriale dhe arkeale, ndërsa sekuenca Kozak është një vend i fillimit të përkthimit të proteinave në shumicën e ARN-së eukariote. Kështu, kjo përmbledh ndryshimin midis sekuencës Shine Dalgarno dhe Kozak.
