Diferenca kryesore – Microarray vs Sekuenca e gjeneratës tjetër
Proceset e renditjes së ADN-së përdoren gjerësisht në fushat e bioteknologjisë, virologjisë, diagnozës mjekësore dhe shkencave mjeko-ligjore. Është një proces që përcakton rendin e saktë të nukleotideve, adeninës, guaninës, timinës dhe citozinës të pranishme brenda një molekule të ADN-së. Procedurat e renditjes së ADN-së janë bërë një përshpejtues për zbulimet e mrekullueshme në kërkimet mjekësore dhe biologjike. Këto metoda të renditjes kanë evoluar deri në renditjen e një gjenomi të plotë të organizmave individualë, duke përfshirë njerëzit dhe speciet e tjera të gjalla. Microarrays dhe Sekuenca e Gjeneratës së ardhshme janë procedura moderne të sekuencimit të ADN-së. Teknika Microarray bazohet në mënyrë specifike në hibridizimin i cili përmban një grup objektivash të njohur. Sekuenca e gjeneratës së ardhshme bazohet në sintezë (e cila përdor polimerazën e ADN-së për të inkorporuar nukleotide) dhe ka aftësinë për të renditur të gjithë gjenomin, pavarësisht nga objektivat e zgjedhur më parë. Ky është ndryshimi kryesor midis Microarray dhe Sekuencës së Gjeneratës tjetër.
Çfarë është Microarray?
Microarray i ADN-së përdoret si një mjet laboratorik për të identifikuar mijëra shprehje të ndryshme të gjeneve në të njëjtën kohë. Është një sipërfaqe e ngurtë, d.m.th., rrëshqitje e mikroskopit, e cila përmban një koleksion njollash mikroskopike të ADN-së të shtypura në të. Çdo vend i printuar përmban një sekuencë të njohur gjenike ose një gjen. Këto sonda të njohura të shtypura në slide shërbejnë si sonda për të zbuluar shprehjen e gjeneve. Kjo njihet si një transkriptomë. Hibridizimi midis dy vargjeve të ADN-së është parimi kryesor mbi të cilin bazohen mikrovargjet. Është çiftimi bazë plotësues i sekuencave të acidit nukleik me formimin e lidhjeve hidrogjenore.
Figura 01: Microarray
Fillimisht, molekulat e mARN-së mblidhen nga kampioni eksperimental dhe kampioni referencë i marrë nga një individ i shëndetshëm. Mostrat eksperimentale merren nga individë të sëmurë; për shembull, një individ që vuan nga kanceri. Pasi të merren, të dy mostrat e mARN konvertohen në cDNA (ADN plotësuese). Më pas, çdo mostër është etiketuar duke përdorur një sondë fluoreshente. Sondat fluoreshente janë me ngjyra të ndryshme për të dalluar cDNA-në e mostrës nga cDNA-ja e referencës. Për të filluar lidhjen e molekulave të cADN-së me rrëshqitjen e mikrogrurës, të dy mostrat përzihen së bashku. Hibridizimi është procesi me anë të të cilit molekulat cDNA bashkohen me sondat e ADN-së në rrëshqitjen e mikrovargëve. Pas përfundimit të hibridizimit, zhvillohen një sërë reagimesh për të identifikuar dhe matur shprehjen e secilit gjen me shfaqjen e ngjyrave të ndryshme sipas sasisë së gjenit të shprehur. Rezultatet nga mikrogrumbullimi përdoren në krijimin e një profili të shprehjes së gjeneve që mund të përdoret për të identifikuar kushte të ndryshme sëmundjeje.
Çfarë është Sekuenca e Gjeneratës tjetër?
Next Generation Sequencing (NGS) është një metodë e avancuar e renditjes gjenetike. Parimi i tij është i ngjashëm me atë të Sanger Sequencing, i cili varet nga elektroforeza kapilar. Në NGS, vargu gjenomik është i fragmentuar dhe i lidhur në një varg shabllon. Bazat e secilës fillesë identifikohen nga sinjalet e emetuara gjatë procesit të lidhjes së saj. Në metodën e renditjes Sanger, përfshihen tre hapa të veçantë, renditja, ndarja dhe zbulimi. Për shkak të këtyre hapave të veçantë, automatizimi i përgatitjes së mostrës është i kufizuar në xhiro. Në NGS, teknika është zhvilluar duke përdorur sekuencën e bazuar në vargje me kombinimin e hapave të procedurës së sekuencës Sanger, e cila mund të shkaktojë që miliona seri reagimesh të kryhen paralelisht në të njëjtën kohë; kjo rezulton në shpejtësi të lartë dhe xhiro me një kosto të ulët.
Figura 02: Zhvillimet në NGS
NGS përbëhet nga tre hapa; përgatitja e bibliotekës (krijimi i bibliotekave me përdorimin e fragmentimit të rastësishëm të ADN-së), amplifikimi (amplifikimi i bibliotekës duke përdorur amplifikimin klonal dhe PCR) dhe sekuenca. Proceset e renditjes së gjenomit që kryhen për kohëzgjatje jashtëzakonisht të gjata duke përdorur procedurën e sekuencës Sanger mund të përfundojnë brenda pak orësh duke përdorur NGS.
Cila është ngjashmëria midis Sekuencës së Microarray dhe Gjeneratës tjetër?
Sekuenca e Microarray dhe e Gjeneratës tjetër janë zhvilluar duke përdorur sekuencën e bazuar në vargje
Cili është ndryshimi midis Sekuencës së Microarray dhe Gjeneratës tjetër?
Microarray vs Sekuenca e gjeneratës tjetër |
|
| Microarray është një koleksion njollash mikroskopike të ADN-së të ngjitura në një sipërfaqe të fortë, e cila përdoret për të matur nivelet e shprehjes së një numri të madh gjenesh njëkohësisht. | NGS (Sekuenca e gjeneratës së ardhshme) është një teknologji e renditjes së ADN-së me performancë të lartë jo të bazuar në Sanger, e cila lehtëson sekuencimin paralel të miliona ose miliarda vargjeve të ADN-së. |
| Ndërveprimet me Antigjenin | |
| Microarray bazohet në hibridizimin që përbëhet nga një grup objektivash të njohur. | NGS bazohet në sintezën e cila përdor ADN polimerazën për të inkorporuar nukleotide dhe është e pavarur nga objektivat e zgjedhur më parë. |
Përmbledhje – Microarray vs Sekuenca e gjeneratës tjetër
Në kontekstin e kërkimit, sekuenca e ADN-së është bërë një përshpejtues i rëndësishëm. Përdoret gjerësisht në bioteknologji, diagnozë mjekësore dhe studime mjekoligjore. Ai ka evoluar dhe zhvilluar në procedura më efikase dhe më të shpejta të renditjes. Microarrays dhe NGS janë dy teknika të avancuara të sekuencës së ADN-së të pranishme. Të dyja janë zhvilluar duke përdorur sekuencën e bazuar në grup. Teknika Microarray mbështetet në hibridizimin ndërsa NGS bazohet në sintezë, e cila përdor ADN polimerazën për të inkorporuar nukleotide. Ky është ndryshimi kryesor midis Microarray dhe Sekuencës së Gjeneratës tjetër.
Shkarko versionin PDF të Microarray kundër Sekuencës së Gjeneratës tjetër
Mund të shkarkoni versionin PDF të këtij artikulli dhe ta përdorni për qëllime jashtë linje sipas shënimit të citimit. Ju lutemi shkarkoni versionin PDF këtu Diferenca midis Sekuencës së Microarray dhe Gjeneratës tjetër
