Dallimi kryesor midis MLVA dhe MLST është se MLVA përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të përsëritura të njëpasnjëshme për të karakterizuar speciet mikrobike, ndërsa MLST përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të fragmenteve të brendshme të gjeneve të shumta shtëpiake për të karakterizuar speciet mikrobike.
Tiping mikrobial zakonisht përdoret për të përcaktuar burimin dhe rrugët e infeksioneve. Ai konfirmon ose përjashton shpërthimet. Lloji mikrobial gjithashtu gjurmon transmetimin e kryqëzuar të patogjenëve të lidhur me kujdesin shëndetësor dhe njeh shtamet virulente. Për më tepër, tipizimi mikrobial vlerëson efektivitetin e masave të kontrollit të specieve mikrobike patogjene. MLVA dhe MLST janë dy teknika biologjike molekulare të përdorura në tipizimin mikrobial.
Çfarë është MLVA?
Analiza VNTR e lokacioneve të shumëfishta (MLVA) është një metodë biologjike molekulare që përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të përsëritura në mënyrë të njëpasnjëshme për të karakterizuar speciet mikrobike. Është një metodë e përdorur për analizën gjenetike të specieve të veçanta mikrobike.
Gjatë hapit të parë të MLVA, çdo vend i shënjestruar VNTR përforcohet me PCR me primerë të zonës specifike anësore. Pastaj fragmentet e marra ndahen në madhësi me elektroforezë në një sekuencer kapilar. Gjenotipi i secilit vend dhe rezultatet e përpiluara nga çdo mostër lejojnë karakterizimin e një mikroorganizmi, specia e të cilit është e njohur. Ai gjithashtu lejon identifikimin e nëngrupeve përmes shtypjes së aleleve dhe krahasimit me bazat e të dhënave MLVA.
Figura 01: MLVA
Kjo metodë MLVA është më selektive se metoda MLST. Për më tepër, metoda MLVA nuk kërkon një hap të sekuencës së ADN-së. Kështu, bën të mundur diferencimin e nënspecieve të afërta ose specieve klonale.
Çfarë është MLST?
Tipizimi i sekuencës me shumë lokus (MLST) është një teknikë që përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të fragmenteve të brendshme të gjeneve të shumta shtëpiake për të karakterizuar speciet mikrobike. MLST është një teknikë në analizën gjenetike për tipizimin e lokuseve të shumëfishta.
Figura 02: MLST
Është një lloj tipizimi i renditjes që përdoret si teknikë referimi për të dalluar shtamet e ndryshme të specieve mikrobike. Kjo metodë bazohet në renditjen e gjeneve të shtëpisë. Gjenet e ruajtjes së shtëpisë normalisht kodojnë proteinat thelbësore të agjentëve mikrobikë të tillë si një bakter. Këto sekuenca të gjeneve të shtëpisë kanë veçorinë e paraqitjes së një polimorfizmi të qëndrueshëm me kalimin e kohës. Prandaj, dallimet në sekuencat e gjeneve të shtëpisë janë të mjaftueshme për të dalluar shtamet nga njëri-tjetri. Për më tepër, skema e parë MLST që u zhvillua ishte Neisseria meningitidis, agjenti shkaktar i meningjitit meningokokal dhe septicemisë. Që nga prezantimi i tij, MLST është përdorur jo vetëm për patogjenët njerëzorë, por edhe për patogjenët e bimëve.
Cilat janë ngjashmëritë midis MLVA dhe MLST?
- MLVA dhe MLST janë dy teknika biologjike molekulare të përdorura në tipizimin mikrobik.
- Të dyja teknikat mund të përdoren për analizën filogjenetike mikrobike.
- Të dyja teknikat bazohen në polimorfizmin gjenetik.
- Ato mund të përdoren për zbulimin e sëmundjeve njerëzore që shkaktojnë patogjenë mikrobikë.
- Të dyja teknikat duhet të kryhen nga biologë molekularë të aftë.
Cili është ndryshimi midis MLVA dhe MLST?
MLVA është një teknikë që përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të përsëritura të njëpasnjëshme për të karakterizuar speciet mikrobike. Ndërkohë, MLST është një teknikë që përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të fragmenteve të brendshme të gjeneve të shumta shtëpiake për të karakterizuar speciet mikrobike. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis MLVA dhe MLST. Për më tepër, metoda MLVA është më selektive se metoda MLST.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis MLVA dhe MLST në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – MLVA vs MLST
MLVA dhe MLST janë dy teknika biologjike molekulare të përdorura në tipizimin mikrobial. MLVA përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të përsëritura në mënyrë të njëpasnjëshme për të karakterizuar speciet mikrobike, ndërsa MLST përdor polimorfizmin e sekuencave të ADN-së të fragmenteve të brendshme të gjeneve të shumta shtëpiake për të karakterizuar speciet mikrobike. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis MLVA dhe MLST.
