Dallimi kryesor midis bërthamës së ARN polimerazës dhe holoenzimës është se bërthama e ARN polimerazës është një enzimë që nuk ka një faktor sigma, ndërsa ARN polimeraza holoenzima është një enzimë që përbëhet nga një faktor sigma.
Transkriptimi në baktere është një proces ku një segment i ADN-së bakteriale kopjohet në një varg mRNA të saposintetizuar me përdorimin e një enzime ARN polimerazë. Ky proces ndodh në tre hapa kryesorë: fillimi, zgjatja dhe përfundimi. ARN polimeraza bakteriale përbëhet nga 6 nënnjësi. Bërthama e polimerazës ARN përbëhet nga nënnjësi β, β', α2 dhe ω. Kjo bërthamë e ARN polimerazës shndërrohet në holoenzimë kur faktori σ (sigma) lidhet me enzimën bërthamë. Bërthama e ARN polimerazës dhe holoenzima janë dy forma të enzimës bakteriale të ARN polimerazës.
Çfarë është Bërthama e ARN Polimerazës?
Bërthama ARN polimerazë është një enzimë e përfshirë në transkriptimin bakterial që është e lirë nga faktori sigma. Ai përbëhet nga 5 nënnjësi të përcaktuara si β, β′, α2 dhe ω. Kjo enzimë nuk fillon transkriptimin specifik nga promotorët e ADN-së bakteriale dhe fag. Kjo për shkak se nuk njeh ndonjë promotor specifik të ADN-së bakteriale ose fag. Megjithatë, kjo enzimë ruan aftësinë për të transkriptuar ARN-në nga sekuencat e fillimit jospecifik. Për më tepër, shtimi i faktorit sigma në këtë enzimë i lejon enzimës të fillojë sintezën e ARN-së nga nxitësit specifikë bakterialë dhe fag. Pesha molekulare e enzimës bazë të ARN polimerazës është afërsisht 400 kDa.
Figura 01: Bërthama e ARN polimerazës
Enzima bërthamë përmban veti katalitike të ARN polimerazës. Nën-njësia α është një homodimer me madhësi 36.5 kDa. Ai është i koduar nga gjeni rpoA. Funksionet e kësaj nënnjësie janë montimi i RNAP, ndërveprimet me ADN-në dhe faktorët e transkriptimit për rregullimin e transkriptimit. Nën-njësia Β është 150.4 kDa në madhësi. Ai është i koduar nga gjeni rpoB. Funksionet e kësaj nënnjësie janë lidhja e ADN-së dhe ARN-së, sinteza e ARN-së, lidhja e NTP, vendi i lidhjes së RMP dhe lidhja e faktorit σ. Nën-njësia β' është me madhësi 155 kDa dhe është e koduar nga gjeni rpoC. Funksionet e kësaj nënnjësie janë lidhja e ADN-së, sinteza e ARN-së, koordinimi katalitik Mg2+, vendi i lidhjes ppGpp 1 dhe lidhja e faktorit σ. Për më tepër, faktori ω është 10.2 kDa në madhësi dhe i koduar nga gjeni rpoZ. Funksioni i faktorit ω është palosja RNAP dhe vendi i lidhjes ppGpp 1.
Çfarë është holoenzima e ARN polimerazës?
Holoenzima e polimerazës së ARN-së përbëhet nga një komponent specifik i njohur si faktor sigma, përveç nënnjësive β, β', α2 dhe ω. Për shkak të faktorit sigma, holoenzima e ARN polimerazës mund të njohë nxitësit. Faktori sigma gjithashtu ndihmon në vendosjen e saktë të holoenzimës së ARN polimerazës dhe zbërthimin në vendin e fillimit. Pasi faktori sigma kryen funksionin e tij të kërkuar dhe specifik, ai shkëputet nga holoenzima e ARN polimerazës ndërsa pjesa katalitike (β, β', α2 dhe ω) e ARN polimerazës mbetet në ADN dhe vazhdon transkriptimin.
Figura 02: Holoenzima e ARN polimerazës
Numri i faktorëve sigma ndryshon midis specieve bakteriale. E. coli ka shtatë faktorë sigma. Për më tepër, faktorët sigma dallohen nga pesha e tyre karakteristike molekulare. Për shembull, σ70 është faktori sigma me një peshë molekulare prej 70 kDa. Faktorë të ndryshëm sigma përdoren nga bakteret në kushte të ndryshme mjedisore. Shembuj të faktorëve të ndryshëm σ përfshijnë; σ19, σ24, σ18, σ32, σ38, dhe σ54
Cilat janë ngjashmëritë midis bërthamës së polimerazës ARN dhe holoenzimës?
- Bërthama e polimerazës ARN dhe holoenzima janë dy forma të enzimës bakteriale të ARN polimerazës.
- Të dyja format përfshihen në transkriptimin bakterial.
- Ata kanë nënnjësi.
- Ato janë molekula proteinash të përbëra nga aminoacide.
Cili është ndryshimi midis bërthamës së polimerazës ARN dhe holoenzimës?
Bërthama ARN polimerazë është një enzimë që nuk ka një faktor sigma, ndërsa ARN polimeraza holoenzima është një enzimë që përbëhet nga një faktor sigma. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis bërthamës së polimerazës ARN dhe holoenzimës. Për më tepër, bërthama e polimerazës ARN merr pjesë kryesisht në hapin e zgjatjes së transkriptimit, ndërsa holoenzima e ARN polimerazës katalizon kryesisht në hapin e fillimit të transkriptimit.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis bërthamës së polimerazës ARN dhe holoenzimës në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Bërthama e ARN polimerazës kundër holoenzimës
ARN polimeraza bakteriale është një enzimë e varur nga ADN me shumë nënnjësi. Merr pjesë në transkriptimin e baktereve. Është enzima kryesore e shprehjes së gjeneve dhe një objektiv rregullimi. Bërthama e ARN polimerazës dhe holoenzima janë dy forma të enzimës bakteriale të ARN polimerazës. Bërthama e ARN polimerazës nuk ka një faktor sigma, ndërsa holoenzima e ARN polimerazës përbëhet nga një faktor sigma. Pra, kjo përmbledh ndryshimin midis bërthamës së polimerazës ARN dhe holoenzimës.
