Dallimi kryesor midis introneve të grupit I dhe grupit II është se në intronet e grupit I, reaksioni i bashkimit inicohet nga një kofaktor i guanozinës, ndërsa në intronet e grupit II, reaksioni i bashkimit fillon nga adenozina e brendshme.
Pre-mRNA është transkripti primar që ka si introne ashtu edhe ekzone. Para-mRNA duhet të shndërrohet në mARN para përkthimit. Ndarja e ARN-së ose bashkimi para-mRNA është një modifikim i tillë pas transkriptimit. Në bashkimin e ARN-së, intronet hiqen nga molekula para-mRNA dhe ekzonet bashkohen së bashku. Intronet e grupit I dhe grupit II janë introne vetë-lidhëse. Ato shkëputen nga molekula para-mRNA pa ndihmën e ndonjë enzime tjetër. Prandaj, ato janë enzima të ARN-së ose ribozime që katalizojnë bashkimin e tyre nga para-mRNA. Për më tepër, ata kanë aftësinë të funksionojnë si elementë të lëvizshëm. Gjatë bashkimit, ndodhin një sërë reaksionesh trans-esterifikimi me qëllim të akcizimit të intronit dhe lidhjes së ekzoneve. Këto ribozime janë të pranishme në të tre fushat, duke përfshirë bakteret, arkeat dhe eukariotët.
Çfarë janë Intronet e Grupit I?
Intronet e Grupit I janë një lloj ribozimish vetë-bashkues që gjenden në baktere, bakteriofagë dhe eukariote (gjenome organike dhe bërthamore). Ato gjenden në gjenet thelbësore. Ata janë në gjendje të katalizojnë bashkimin e tyre nga molekula para-mRNA. Intronet e grupit I mund të kenë disa qindra deri në tre mijë nukleotide. Për më tepër, ato shfaqin pak ngjashmëri të sekuencës midis organizmave.
Figura 01: Intronet e Grupit I
Strukturat dytësore janë shumë të ruajtura në katër rajone të shkurtra. Ekzistojnë dy hapa të reagimit të transesterifikimit të bashkimit. Intronet e grupit I inicojnë mekanizmin e lidhjes me sulmin nukleofilik të hidroksilit 3' të një kofaktori Guanosine në vendin e bashkimit 5P.
Çfarë janë Intronet e Grupit II?
Intronet e Grupit II janë një lloj intronesh vetë-lidhëse që gjenden në organizmat që u përkasin të tre domeneve. Ato janë ribozime që katalizojnë reaksionet e tyre të bashkimit nga pre-mRNA. Ato gjenden në rRNA, tARN dhe gjenet koduese të proteinave. Por ato nuk gjenden në gjenomet bërthamore, ndryshe nga intronet e grupit I.
Figura 02: Intronet e Grupit II
Intronet e grupit II katalizojnë bashkimin nëpërmjet dy hapave të transesterifikimit të ngjashëm me intronet e grupit I. Këto enzima inicojnë reaksionin e bashkimit me sulmin nukleofilik të 2' OH të adenozinës së vendit të degës në kryqëzimin 5'. Gjatë reaksioneve të bashkimit, intronet e grupit II formojnë një strukturë të ngjashme me lariatin. Për më tepër, bashkimi i intronit ndodh në mungesë të GTP.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet Introneve të Grupit I dhe Grupit II?
- Intronet e grupit I dhe grupit II janë dy lloje të enzimave të ARN-së, ribozime që katalizojnë bashkimin e tyre me mekanizma të ndryshëm.
- Ato janë ribozime të mëdha.
- Të dyja gjenden në të tre domenet.
- Ata janë elementë celularë.
- Për më tepër, ato gjenden në rARN, tARN dhe gjenet që kodojnë proteinat.
- Të dyja enzimat po përdoren si mjete në bioteknologji dhe mjekësi molekulare për sistemet e shënjestruara të gjeneve të shënjestruara, shpërndarjen e gjeneve ose terapinë e gjeneve.
Cili është ndryshimi midis Introneve të Grupit I dhe Grupit II?
Intronet e grupit I janë ribozime që gjenden në baktere, bakterofag dhe gjenom organelare dhe bërthamore eukariote. Intronet e grupit II janë ribozime që gjenden në baktere, arkea dhe organele eukariote. Për më tepër, intronet e grupit I nisin reaksionin e bashkimit nga sulmi nukleofilik i hidroksilit 3' të një kofaktori guanozine në vendin e bashkimit 5P ndërsa intronet e grupit II nisin reaksionin e bashkimit nga sulmi nukleofilik i 2' OH të adenozinës së zonës së degës në 5′ kryqëzim i bashkimit. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis introneve të grupit I dhe grupit II.
Për më tepër, intronet e grupit II formojnë një strukturë të ngjashme me lariat gjatë bashkimit ndërsa intronet e grupit I nuk formohen. Kështu, ky është një tjetër ndryshim domethënës midis introneve të grupit I dhe grupit II. Përveç kësaj, intronet e grupit I gjenden në gjenomet bërthamore eukariote ndërsa intronet e grupit II nuk gjenden në gjenomet bërthamore eukariote.
Më poshtë infografik rendit ndryshimet midis introneve të grupit I dhe grupit II në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Intronet e Grupit I vs Grupit II
Intronet e grupit I dhe II janë ribozime të mëdha që katalizojnë një reaksion transesterifikimi për të ndarë intronet nga transkripti primar. Ato gjenden në të tre fushat. Të dy janë elementë gjenetikë të lëvizshëm. Për më tepër, ato përdoren si mjete në bioteknologji dhe mjekësi molekulare. Megjithatë, intronet e grupit I nisin reaksionin e bashkimit nga sulmi nukleofilik i 3' OH të një kofaktori guanozine në vendin e bashkimit 5P. Por, intronet e grupit II inicojnë reaksionin e bashkimit nga sulmi nukleofilik i 2' OH të adenozinës së vendit të degës në kryqëzimin 5' të bashkimit. Për më tepër, intronet e grupit II formojnë një strukturë të ngjashme me lariat gjatë bashkimit ndërsa intronet e grupit I nuk formojnë një strukturë të ngjashme me lariat. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis introneve të grupit I dhe grupit II.
