Dallimi kryesor midis kutisë TATA dhe CAAT është se kutia TATA është një rajon nukleotidi i konservuar i cili ka një sekuencë konsensusi të TATAWAW ndërsa kutia CAAT është një rajon nukleotid i konservuar me një sekuencë konsensusi të GGCCAATCT.
Kutia TATA dhe kutia CAAT janë dy rajone të nukleotideve që ndikojnë në transkriptimin e gjeneve eukariote. Ato janë sekuenca të ADN-së jo-koduese që gjenden në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Në fakt, ato gjenden në rajonin rregullator, i cili njihet si promotor. Si kutia TATA ashtu edhe kutia CAAT janë përgjegjëse për efikasitetin e transkriptimit. Ato janë sekuenca konsensusi që nuk kanë ndryshuar gjatë gjithë procesit evolucionar.
Çfarë është TATA Box?
Kutia TATA ose kutia Goldberg-Hogness është një sekuencë konsensusi që gjendet në rajonin promotor të gjeneve eukariote. Kutia TATA është një element thelbësor i promotorit. Ndodhet 25 çifte bazash në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Ai ruhet gjatë gjithë procesit evolucionar. Sekuenca konsensus e kutisë TATA është TATAWAW, ku W është ose A ose T. Është një sekuencë e ADN-së jo-koduese. Sidoqoftë, kutia TATA është e rëndësishme për transkriptimin e gjenit. Është vendi i lidhjes së proteinës lidhëse TATA (TBP) dhe faktorëve të tjerë të transkriptimit. Pasi ato lidhen në kutinë TATA, rekrutimi i ARN polimerazës II dhe rregullimi i duhur i transkriptimit ndodh në gjenet eukariote.
Figura 01: Kutia TATA
Meqenëse kutia TATA është e përfshirë në rregullimin e transkriptimit, mutacionet e kutisë TATA mund të rezultojnë në ndryshime fenotipike që çojnë në sëmundje të tilla si kanceri i stomakut, ataksia spinocerebelare, sëmundja e Huntington-it, verbëria, β-talasemia, imunosupresioni, sindroma e Gilbert, dhe HIV-1, etj.
Çfarë është CAAT Box?
Kutia CAAT është një rajon i nukleotideve me sekuencën konsensus të GGCCAATCT. Ngjashëm me kutinë TATA, kutia CAAT ndodhet gjithashtu në rajonin promotor të gjenit. Prandaj, ndodhet rreth 75-80 çifte bazash në rrjedhën e sipërme të vendit të transkriptimit.
Figura 02: Kutia CAAT
Faktorë specifikë të transkriptimit lidhen me kutinë CAAT. Kjo lidhje stabilizon kompleksin e parafillimit për lidhjen më të lehtë të enzimës ARN polimerazë. Po kështu, kutia CAAT funksionon si një sekuencë rregullatore. Mutacionet në rajonin e kutisë CAAT ndikojnë shumë në përgjigjen e promotorit dhe rregullimin e transkriptimit.
Cilat janë ngjashmëritë midis TATA dhe CAAT Box?
- TATA dhe CAAT janë dy rajone të nukleotideve që gjenden në sekuencën rregullatore të gjeneve eukariote.
- Ato gjenden në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit.
- Të dyja janë sekuenca të ADN-së me konsensus.
- Ato janë thelbësore për rregullimin e transkriptimit, prandaj janë sekuenca rregullatore.
Cili është ndryshimi midis TATA dhe CAAT Box?
Kutia TATA është një zonë nukleotide e konservuar e gjetur rreth 25-30 çifte bazash në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Nga ana tjetër, kutia CAAT është një rajon i konservuar i nukleotideve të gjetura rreth 75-80 çifte bazash në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis kutisë TATA dhe CAAT. Përveç kësaj, kutia TATA ka një sekuencë konsensusi të TATAWAW ndërsa GGCCAATCT është sekuenca konsensus e kutisë CAAT.
Për më tepër, një ndryshim tjetër domethënës midis kutisë TATA dhe CAAT është se kutia TATA siguron një vend lidhës për TBP dhe faktorët e transkriptimit dhe merr pjesë në rregullimin e transkriptimit ndërsa kutia CAAT sinjalizon vendin e lidhjes për faktorin e transkriptimit të ARN-së.
Infografika më poshtë përmbledh ndryshimet midis kutisë TATA dhe CAAT.
Përmbledhje – TATA vs CAAT Box
Kutia TATA dhe kutia CAAT janë dy pjesë të rajonit të konservuar të promotorëve të gjeneve eukariote. Ato janë të vendosura në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Të dyja ndikojnë në transkriptimin e gjeneve duke siguruar vende për lidhjen e proteinave që lidhen me TATA dhe faktorët e fillimit të transkriptimit. Kutia TATA ndodhet 25-35 çifte bazash në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit ndërsa kutia CAAT ndodhet 75-80 çifte bazë në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Sekuenca konsensus e kutisë TATA është TATAWAW ndërsa sekuenca e konsensusit e kutisë CAAT është GGCCAATCT. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis kutisë TATA dhe CAAT.