Dallimi kryesor midis proteomikës dhe metabolomikës është se proteomika është studimi i të gjitha proteinave të një organizmi ndërsa metabolomika është studimi i të gjithë metabolitëve të një organizmi.
Gjenomika është studimi i përbërjes gjenetike të një organizmi. Proteomika dhe metabolomika janë dy shkenca omike që lidhen me gjenomikën. Proteome i referohet të gjitha proteinave në një qelizë ose një organizëm. Metaboloma, nga ana tjetër, i referohet të gjithë metabolitëve të një organizmi. Kështu, studimi i proteomës është proteomika ndërsa studimi i metabolomit është metabolomika. Si proteomika ashtu edhe metabolomika janë të rëndësishme në diagnostikimin e sëmundjeve dhe në karakterizimin dhe shqyrtimin e organizmave. Për më tepër, të dyja janë të lidhura në shumë aspekte të biologjisë qelizore, veçanërisht në sinjalizimin e qelizave, degradimin dhe gjenerimin e proteinave dhe modifikimin pas përkthimit.
Çfarë është Proteomics?
Proteome është komplementi total proteinik në një qelizë, ind ose organizëm. Prandaj, proteomika është studimi i proteomës së një organizmi. Në proteomikë analizohen karakteristika të ndryshme të proteinave. Prandaj, proteomika fokusohet kryesisht në strukturën, orientimin, funksionet, ndërveprimet e proteinave, modifikimet, aplikimet dhe rëndësinë e proteinave. Kjo është arsyeja pse shumë projekte kërkimore janë kryer aktualisht në fushën e proteomikës.
Studimet e para proteomike u bënë për të identifikuar përmbajtjen e proteinave në Escherichia coli. Harta e përmbajtjes totale të proteinave është bërë duke përdorur xhel dydimensionale (2D). Pas suksesit të këtij projekti, shkencëtarët kaluan në karakterizimin e përmbajtjes totale të proteinave në kafshë të tilla si derrat gini dhe minjtë. Aktualisht, hartëzimi i proteinave njerëzore bëhet duke përdorur elektroforezë xheli 2D.
Ka shumë përparësi të studimit të proteomikës pasi proteinat janë molekulat drejtuese të shumicës së aktivitetit për shkak të vetive katalizatore të proteinave. Kështu, studimi i proteinave të plota mund të sigurojë informacion në lidhje me gjendjen shëndetësore të një organizmi. Për më tepër, proteomika ka shumë aplikime në shënimin e gjenomit, identifikimin dhe diagnostikimin e sëmundjeve, kryerjen e studimeve të shprehjes së proteinave gjatë eksperimenteve dhe modifikimeve të proteinave dhe studimeve të ndërveprimit, etj.
Figura 01: Proteomics
Ka teknika të ndryshme të përfshira në proteomikë, duke përfshirë nxjerrjen e proteinës totale, ndarjen e tyre duke përdorur elektroforezë xheli 2D, renditjen e proteinave të nxjerra duke përdorur metoda të tilla si metoda e renditjes së Edmundit ose spektrometria e masës dhe analiza e strukturës dhe funksionale. vetitë e proteinës duke përdorur softuer të bazuar në kompjuter dhe mjete bioinformatike.
Çfarë është Metabolomika?
Metabolomika është studimi i të gjithë metabolitëve në një qelizë, ind ose organizëm. Ai përfshin identifikimin dhe përcaktimin sasior të metabolitëve qelizorë duke përdorur mjete të ndryshme të avancuara analitike dhe statistikore. Metabolomika është një studim i rëndësishëm pasi zbulon informacione në lidhje me metabolizmin e një organizmi.
Figura 02: Metabolomika
Për të studiuar substratet dhe produktet e reaksioneve metabolike, metabolomika përdor spektrometrinë e masës si një platformë analitike. Spektrometria e masës rezulton në metabolitët dhe përqendrimet e tyre, duke reflektuar gjendjen aktuale biokimike të qelizave ose indeve. Prandaj, metabolomika mund të konsiderohet si përfaqësimi më i mirë i fenotipit molekular të një organizmi. Përveç këtyre, metabolomika mund të konsiderohet si një zgjatim i proteomikës sepse shumica e metabolitëve krijohen për shkak të aktiviteteve të enzimave që janë proteina.
Cilat janë ngjashmëritë midis Proteomikës dhe Metabolomikës?
- Proteomika dhe metabolomika janë dy shkenca omike që lidhen me gjenomikën.
- Metabolomika mund të konsiderohet si një zgjatim i proteomikës.
- Proteoma dhe metabolomi janë të ndërthurura ngushtë me shumë studime.
Cili është ndryshimi midis Proteomikës dhe Metabolomikës?
Proteomics është studimi në shkallë të gjerë i proteinave duke përfshirë strukturën dhe funksionin e tyre, brenda një qelize ose një organizmi. Ndërkohë, metabolomika është studimi i profileve të metabolitëve në një qelizë, ind ose organizëm në një grup të caktuar kushtesh. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis proteomikës dhe metabolomikës. Për më tepër, proteomika kryesisht ka të bëjë me grupin e plotë të proteinave ndërsa metabolomika kryesisht ka të bëjë me grupin e plotë të metabolitëve, duke përfshirë një grup të larmishëm molekulash të vogla si peptidet, karbohidratet, lipidet, nukleozidet dhe produktet katabolike të komponimeve ekzogjene, etj. Prandaj, ky është një tjetër ndryshim midis proteomikës dhe metabolomikës.
Infografia e mëposhtme përmbledh ndryshimin midis proteomikës dhe metabolomikës.
Përmbledhje – Proteomics vs Metabolomics
Organizmat e gjallë mund të studiohen duke përdorur gjenomin, proteinat dhe metabolitët e tyre. Gjenomika, proteomika dhe metabolomika janë tre fushat që studiojnë përbërjen gjenetike, proteinat dhe metabolitët e një qelize ose një organizmi, përkatësisht. Proteomika është e rëndësishme pasi është një reflektim dinamik i gjeneve dhe i mjedisit. Metabolomika është shumë e rëndësishme pasi pasqyron drejtpërdrejt statusin aktual të reaksionit biokimik të qelizave ose statusin metabolik të një organizmi. Kështu, kjo përmbledh ndryshimin midis proteomikës dhe metabolomikës.
