Dallimi kryesor – Proteomics vs Transcriptomics
Teknologjia omike është një trend aktual, ku biomolekulat e ndryshme të një organizmi shikohen si një koleksion i tërë në lidhje me vetitë dhe funksionet e tij. Teknologjia omic ka një gamë të gjerë aplikimesh. Omikat e ndryshme të një kampioni biologjik përfshin gjenomikën, proteomikën, transkriptomikën dhe metabolomikën. Proteomika përfshin studimin e plotë të të gjitha proteinave në një organizëm të gjallë. Përkufizohet si grupi i të gjitha proteinave të shprehura në një organizëm, vetitë e tij strukturore dhe funksionale. Prandaj, grupi i plotë i proteinave formon proteomën. Transkriptomika është studimi i plotë i të gjitha molekulave të ARN-së (mRNA) të dërguara të pranishme në një organizëm të gjallë. Kështu, transkriptomika merret me gjenet që shprehen në mënyrë aktive në një organizëm të gjallë. Grupi total i mARN-së në një organizëm të gjallë quhet transkriptomë. Dallimi kryesor midis Proteomics dhe Transcriptomics bazohet në llojin e biomolekulës. Në proteomikë, grupi i përgjithshëm i proteinave të shprehura në një organizëm të gjallë studiohet ndërsa, në transkriptomikë, studiohet mARN totale e një organizmi të gjallë.
Çfarë është Proteomics?
Termi proteomikë u krijua në vitin 1995 dhe fillimisht u përcaktua si komplementi total i proteinave në një qelizë, ind ose një organizëm. Me përparimin në studimet proteomike, ai u modifikua më pas për t'u konsideruar si një term ombrellë në të cilin përfshiheshin shumë fusha studimi. Aktualisht, nën temën proteomika studiohet struktura, orientimi, funksionet, ndërveprimet e saj, modifikimet, aplikimet e saj dhe rëndësia e proteinave. Prandaj, shumë kërkime janë kryer në fushën e proteomikës aktualisht.
Studimet e para proteomike u bënë për të identifikuar përmbajtjen e proteinave në Escherichia coli. Harta e përmbajtjes totale të proteinave është bërë duke përdorur xhel dydimensionale (2D). Pas suksesit të kësaj, shkencëtarët kaluan në karakterizimin e përmbajtjes totale të proteinave në kafshë të tilla si derrat gini dhe minjtë. Aktualisht, hartëzimi i proteinave njerëzore bëhet duke përdorur elektroforezë xheli 2D.
Aplikimet e Proteomics
Ka shumë përparësi të studimit të proteomikës, pasi proteinat janë molekulat drejtuese të pjesës më të madhe të aktivitetit për shkak të vetive katalizatore të proteinave. Kështu, studimi i proteinave të plota mund të sigurojë informacion në lidhje me gjendjen shëndetësore të një organizmi. Disa aplikacione janë;
- Shënim i gjenomit: Duke studiuar përmbajtjen e proteinave të një organizmi, mund të përcaktohen gjenomet e sakta përgjegjëse për përbërjen aktive të proteinës. Në këtë skenar, rezultatet nga e gjithë gjenomika, transkriptomika dhe proteomika janë të rëndësishme.
- Identifikimi i sëmundjes / Diagnostifikimi: Proteomics përdoret në identifikimin e gjendjes së sëmundjes, duke krahasuar të shëndoshë dhe të sëmurë
- Për të kryer shprehjen e proteinave të studiuar gjatë eksperimentimit.
- Modifikimet e proteinave dhe studimet e ndërveprimit: Për të përdorur proteinat në kushte in vitro ose dhe në kushte in vivo, për të vendosur kushtet e ruajtjes së këtyre proteinave të nxjerra dhe për të studiuar sjelljen e proteinës in vitro, in vivo dhe në – metodat siliko.
Figura 01: Proteomics
Ka teknika të ndryshme të përfshira në proteomikë
- Nxjerrja e proteinës totale dhe ndarja e proteinave duke përdorur elektroforezë xhel 2D. Proteinat mund të ndahen gjithashtu duke përdorur kromatografinë e lëngshme me performancë të lartë (HPLC).
- Sekuenca e proteinave të nxjerra duke përdorur metoda të tilla si metoda e renditjes së Edmundit ose spektrometria e masës.
- Pasi të identifikohen sekuencat, vetitë strukturore dhe funksionale të përmbajtjes së proteinave analizohen duke përdorur softuer të bazuar në kompjuter dhe mjete bioinformatike.
Çfarë është Transcriptomics?
Termi i transkriptimit është krijuar kohët e fundit. Transcriptomics është studimi i përmbajtjes totale të mRNA të një organizmi. MARN-ja totale është ADN-ja e shprehur në një organizëm të gjallë ose një qelizë. Koleksioni i plotë i ARN-së referohet si një transkriptomë.
Hapat drejt analizimit të transkriptomit përfshijnë,
- Nxjerrja e ARN-së, ndarja e mRNA duke përdorur kromatografinë me xhel kolone me rruaza poli DT.
- Radhitja e mARN-së është bërë.
Teknologjia mikroarray është një mënyrë e zakonshme për të identifikuar transkriptomin e një organizmi. Teknika e mikroarresë përfshin një pllakë sondë me fillesat plotësuese të transkriptomës. Pas hibridizimit, mARN e pranishme në organizëm ose qeliza mund të karakterizohet.
Figura 02: Teknika transkriptomike
Transkriptomika tani përdoret gjerësisht në fushën mjekësore. Diagnostifikimi i sëmundjeve dhe profilizimi i sëmundjeve janë fushat kryesore në të cilat përdoret Transcriptomics. Duke analizuar një transkriptomë të një organizmi, mRNA e huaj mund të identifikohet dhe nëse ka ndonjë infeksion, mund të identifikohet. ARN jo-koduese mund të ndahet duke përdorur teknologji transkriptomike. Dhe gjithashtu shprehja e gjeneve nën strese të ndryshme mjedisore mund të monitorohet.
Cilat janë ngjashmëritë midis Proteomikës dhe Transkriptomikës?
- Të dyja përbëjnë një pjesë të konceptit të teknologjisë omike.
- Të dyja përdoren në diagnostikimin e sëmundjeve dhe karakterizimin e sëmundjeve të një organizmi.
- Të dyja fushat e studimit përfshinin nxjerrjen e biomolekulës, ndarjen e biomolekulës dhe hapat e renditjes.
Cili është ndryshimi midis Proteomikës dhe Transkriptomikës?
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Proteomics përfshin studimin e plotë të të gjitha proteinave në një organizëm të gjallë. | Transkriptomika është studimi i plotë i të gjitha molekulave të ARN-së (mRNA) të dërguara të pranishme në një organizëm të gjallë. |
| Lloji i Molekulës Bio të studiuar | |
| Proteinat studiohen në proteomikë. | mRNA janë studiuar në transkriptomikë. |
| Faktorët e Studuar | |
| Struktura, funksioni, ndërveprimet, modifikimet dhe aplikimet e proteinave janë studiuar në proteomikë. | Struktura e sekuencës, ndërveprimet me mjedisin dhe aplikimet e mRNA janë studiuar në transkriptomikë. |
Përmbledhje – Proteomics vs Transcriptomics
Omics luajnë një rol të rëndësishëm në fushën e shkencave të jetës. Proteomika i referohet studimit të proteomës që formon koleksionet e plota të proteinave në një qelizë ose një organizëm. Transkriptomika i referohet studimit të transkriptomës i cili është grupi i plotë i ADN-së së shprehur që është në formën e mARN-së. Dy fushat e studimit, proteomika dhe transkriptomika, janë nxjerrë pas prezantimit të gjenomikës dhe aktualisht përdoren gjerësisht në diagnostikimin mjekësor dhe në karakterizimin dhe shqyrtimin e organizmave. Ky është ndryshimi midis proteomikës dhe transkriptomikës.
Shkarkoni PDF-në e Proteomics vs Transcriptomics
Mund ta shkarkoni versionin PDF të këtij artikulli dhe ta përdorni për qëllime jashtë linje sipas shënimit të citimit. Ju lutemi shkarkoni versionin PDF këtu: Dallimi midis Proteomics dhe Transkriptomikës
