Dallimi kryesor – Exome vs Transcriptome
Një gjen përmban rajone koduese dhe jokoduese brenda tij. Sekuencat koduese njihen si ekzone, dhe sekuencat jo-koduese njihen si introne. Sekuenca nukleotide e ekzoneve të një gjeni përfaqëson kodin gjenetik të gjenit për sintetizimin e proteinës specifike. Prandaj, ekzonet mbeten në molekulën e mRNA. Regjioni total i ekzonit i gjenomit njihet si exome, dhe është një pjesë e rëndësishme e gjenomit. Kodi gjenetik i gjeneve shndërrohet në kodin gjenetik të molekulës mRNA, e cila është e nevojshme për prodhimin e proteinave. Të gjitha molekulat e mRNA të transkriptuara në një qelizë ose një popullatë qelizore në një kohë njihen si një transkriptomë. Dallimi kryesor midis ekzomit dhe transkriptomit është se ekzomi përfaqëson sekuencat e rajoneve të ekzonit të gjenomit ndërsa transkriptomi përfaqëson mARN-në totale të një qelize ose një indi në një kohë të caktuar.
Çfarë është Exome?
Gjenet përbëhen nga ekzone, introne dhe sekuenca rregullatore. Eksonet janë rajonet e gjeneve të cilat transkriptohen në sekuencën e mRNA gjatë transkriptimit. Intronet dhe rajonet e tjera jo-koduese hiqen gjatë transkriptimit. Sekuenca nukleotide e ekzoneve përcakton kodin gjenetik të gjenit që sintetizon proteinën specifike që kodon. Vetëm ekzonet mbeten brenda mARN-së së një proteine. Mbledhja e ekzoneve në gjenom njihet si ekzom i një organizmi. Ai përfaqëson një pjesë të gjenomit e cila shprehet në gjene. Tek njerëzit, eksomi përbën 1% nga gjenomi. Është pjesa koduese e proteinave të gjenomit njerëzor.
Figura 01: Exome
Çfarë është Transkriptomi?
Transkriptomi është koleksioni i të gjitha transkripteve (ARN) koduese dhe jokoduese të proteinave në një ind të caktuar. Transkriptomi përfaqëson grumbullimin e molekulave totale të mRNA të shprehura nga gjenet në një qelizë ose në një ind. Transkriptomi i një qelize mund të ndryshojë me transkriptomin e një lloji tjetër qelize. Transkriptomi është gjithashtu dinamik - ai ndryshon me kalimin e kohës si përgjigje ndaj stimujve të brendshëm dhe të jashtëm. Edhe brenda të njëjtit ind ose brenda të njëjtit lloj qelize, transkriptomi mund të ndryshojë pas disa minutash.
Transkriptomi ndryshon nga ekzomi i një organizmi. Transkriptomi përfshin vetëm sekuencat e ekzomeve të shprehura. Megjithëse ekzomi i një qelize mbetet i njëjtë, transkriptomi ndryshon midis qelizave pasi shprehja e gjeneve nuk është e njëjtë për të gjitha qelizat ose indet. Vetëm gjenet thelbësore shprehen në qeliza dhe inde të ndryshme. Shprehja e gjeneve është një proces specifik i llojit të indit ose qelizës. Ai rregullohet nga faktorë të ndryshëm duke përfshirë faktorët mjedisorë. Prandaj, transkriptomi mund të ndryshojë me kushtet e jashtme mjedisore.
Transkriptomi përdoret si pararendës për studimet e proteomikës. Të gjitha proteinat rrjedhin nga sekuencat e mRNA. Modifikimet përkthimore mund të rezultojnë në ndryshime në proteina. Megjithatë, transkriptomi ofron informacion bazë të rëndësishëm për studimet proteomike.
Figura 02: Transkriptimi i qelizave staminale embrionale
Cili është ndryshimi midis Exome dhe Transcriptome?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome është koleksioni i rajonit kodues të proteinave të gjeneve. | Transkriptomi është grumbullimi i të gjithë ARN-së së transkriptuar duke përfshirë mARN-në. |
| Sample | |
| Exome studiohet duke përdorur mostrën e ADN-së. | Transkriptomi studiohet duke përdorur një kampion ARN. |
| Metoda e studimit | |
| Radhitja e të gjithë eksomeve është metoda e studimit të ekzomit. | Sekuenca e ARN-së është metoda e studimit të transkriptomës. |
Përmbledhje – Exome vs Transcriptome
Eksonet janë sekuencat koduese të gjeneve dhe përcaktojnë sekuencat e mRNA të proteinave. Mbledhja e këtyre sekuencave koduese (eksoneve) njihet si ekzom i një organizmi. Gjenet transkriptohen në molekula mRNA përpara se të prodhohen proteina. Molekulat totale të mRNA të një qelize ose të një indi në çdo kohë të caktuar njihen si transkriptomë. Transkriptomi përfaqëson gjenet që janë duke u shprehur në mënyrë aktive në mRNA në çdo kohë të caktuar. Transkriptomi është specifik i qelizave dhe indeve dhe ndikon në kushtet mjedisore. Ky është ndryshimi midis eksomit dhe transkriptomës.
