Dallimi kryesor – Gjenotipimi kundrejt renditjes
Genotipizimi dhe sekuenca janë dy teknika që kryhen për të marrë informacion rreth acideve nukleike, kryesisht ADN-së së një organizmi. Dallimi kryesor midis gjenotipizimit dhe sekuencës është se gjenotipizimi është procesi i përcaktimit se cilin variant gjenetik zotëron individi duke përdorur shënues ndërsa sekuenca është përcaktimi i rendit të saktë të sekuencës nukleotide brenda fragmentit të caktuar të ADN-së.
Çfarë është gjenotipizimi?
Genotipizimi është përcaktimi i përbërjes gjenetike të një individi duke përdorur një sekuencë të ADN-së dhe shënuesve dhe krahasimin dhe identifikimin e trashëgimisë së tij. Gjenotipizimi është i rëndësishëm në biologjinë evolucionare, biologjinë e popullsisë, taksonominë, ekologjinë dhe gjenetikën e organizmave. Mund të kryhet me teknika të ndryshme duke përfshirë sekuencën e ADN-së, reaksionin zinxhir të polimerazës, polimorfizmin e gjatësisë së fragmentit kufizues (RFLP), zbulimin polimorfik të përforcuar rastësor, polimorfizmin e gjatësisë së fragmentit të përforcuar (AFLP), mikrovargjet e ADN-së, etj.
Genotipizimi përfshin renditjen e fragmenteve të veçanta të vogla të sekuencave të ADN-së dhe gjetjen e lidhjes së përbërjes gjenetike me individë të tjerë duke përdorur shënues gjenetikë. Ai përcakton polimorfizmat e vetme nukleotide (SNP) midis individëve ose aleleve specifike. Gjenotipizimi është i zbatueshëm për një gamë të gjerë organizmash duke përfshirë njerëzit. Ai është gjithashtu i zbatueshëm për mikroorganizmat si viruset, kërpudhat etj. dhe mund të përdoret për të përcaktuar variantet e tyre gjenetike me profilet e referencës. Në epidemiologjinë molekulare dhe mikrobiologjinë mjekoligjore, kontrolli i patogjenëve, veçanërisht i mikroorganizmave, bëhet nga informacioni i marrë nga gjenotipizimi. Gjenotipizimi është shumë i rëndësishëm në analizën e origjinës. Njerëzit janë gjenotipizuar për të konfirmuar amësinë dhe atësinë. Gjenotipi do të zbulojë alelet dominante dhe recesive të gjeneve që vendosin tipare specifike.
Figura_1: Gjenotipi RFLP
Çfarë është Sekuenca?
Sekuenca është procesi i përcaktimit të rendit të saktë të nukleotidit në një fragment të caktuar të ADN-së ose ARN-së. Pothuajse i gjithë informacioni i nevojshëm për rritjen dhe zhvillimin e një organizmi është i koduar në gjenomin e tij. Disponueshmëria e teknikave për të prodhuar dhe ndarë disa qindra fragmente të acideve nukleike të gjata të nukleotideve çoi në zhvillimin e procedurave për përcaktimin e sekuencës së saktë të nukleotideve të një fragmenti të caktuar të ADN-së ose ARN-së. Lloje të ndryshme të metodave të renditjes janë në dispozicion sot. Këto metoda të renditjes, së bashku me teknologjitë për ndërtimin e bibliotekave të gjenomit që përfaqësojnë të gjithë gjenomin e një organizmi, lehtësojnë renditjen e të gjithë gjenomit të atij organizmi, duke bërë analiza të thella të strukturave të gjeneve, funksioneve të gjeneve, vendndodhjeve të gjeneve, shprehjeve të gjeneve, harta e gjeneve, rajonet rregullatore të gjeneve etj.
Genomet totale të shumë viruseve, disa baktereve, arkebaktereve, majave dhe disa organizmave të tjerë janë renditur dhe hartuar. Projekti i gjenomit njerëzor ka bërë të mundur renditjen dhe hartën e të gjithë gjenomit njerëzor dhe publikimin e draftit të tij të parë në 2003. Është një moment historik i madh në përparimin e biologjisë. Sekuencat e gjenomit njerëzor përdoren tani në sektorin mjekësor për të identifikuar shkaqet gjenetike për sëmundje të rralla, për të kontrolluar rrezikun e sëmundjeve tek të sapolindurit, për të identifikuar detaje gjenetike të kancereve të ndryshme, për të zhvilluar terapi të reja dhe për të zhvilluar mjete të reja diagnostikuese, etj.
Në botën bimore, gjenomi i orizit dhe gjenomi Arabidopsis janë renditur në sekuencë. Njohja e këtyre sekuencave pa dyshim do të revolucionarizojë të kuptuarit tonë se si funksionojnë qelizat dhe organizmat.
Figura_2: Një autoradiograf i renditjes së këngëtarëve
Cili është ndryshimi midis gjenotipizimit dhe sekuencës?
Genotipizimi vs Sekuenca |
|
| Genotipizimi është procesi i përcaktimit të përbërjes gjenetike të një individi dhe kontrollit të grupit ose taksonomisë së atij organizmi. | Sekuenca është procesi i përcaktimit të rendit të saktë të nukleotideve të një fragmenti të caktuar ADN ose ARN. |
| Teknika | |
| RFLP, Sekuenca e gjeneve, PCR, mikrogrumbullimet e ADN-së, AFLP etj. | Sanger sekuencimi, sekuenca e Gilbert, Pyrossekuenca, Sekuenca e gjeneratës tjetër, sekuenca me armë gjahu etj. |
| Shqetësime të mëdha | |
| Kjo është më e shqetësuar nëse ndryshimet e gjenotipit po japin ndryshimet aktuale të fenotipit. | Kjo është më e shqetësuar për rendin e nukleotideve dhe ndryshimet dhe ndryshimet e tyre me organizmat e tjerë. |
Përmbledhje – Gjenotipi kundrejt renditjes
Genotipizimi dhe sekuenca janë të dobishme për studimin e informacionit gjenetik të organizmave. Gjenotipizimi është procesi i përcaktimit të variacioneve të gjenotipit midis individëve dhe gjetjes së kategorive të tyre. Sekuenca është procesi i përcaktimit të rendit të saktë të nukleotideve në fragmentin e interesuar ose rajonin e ADN-së. Të dyja teknikat ofrojnë informacion të rëndësishëm për gjenet dhe gjenomet.
