Dallimi kryesor midis retrotranspozonëve LTR dhe jo-LTR është se retrotranspozonët LTR janë një lloj retrotranspozonësh që kanë përsëritje të gjata terminale në strukturën e tyre, ndërsa retrotranspozonët jo-LTR janë një lloj retrotranspozonësh që nuk kanë përsëritje të gjata terminale. në strukturën e tyre.
Retrotranspozonët (elementet e transpozueshme të klasës I ose transpozonët nëpërmjet ndërmjetësve të ARN-së) janë një lloj komponenti gjenetik që mund të kopjojë dhe ngjitë veten në vende të ndryshme gjenomike. Ata e kryejnë këtë duke e kthyer ARN-në përsëri në ADN përmes një procesi të quajtur transkriptim i kundërt duke përdorur një ndërmjetës transpozimi ARN. Ekzistojnë dy lloje kryesore të retrotranspozonëve si retrotranspozonët LTR dhe jo-LTR
Çfarë janë retrotranspozonët LTR?
Retrotranspozonët LTR janë një lloj retrotranspozonësh që kanë përsëritje të gjata terminale në strukturën e tyre. Fijet e gjata të ADN-së përsëritëse mund të gjenden në çdo skaj të një retrotranspozoni LTR. Këto njihen si përsëritje të gjata terminale (LTR). Çdo LTR është i gjatë disa qindra çifte bazash. Retrotranspozonët LTR janë zakonisht mbi 5 kilobazë të gjatë. Për më tepër, midis përsëritjeve të gjata terminale, ka gjene që mund të transkriptohen ekuivalente me gjenet e retrovirusit gag dhe pol. Këto gjene mbivendosen në mënyrë që ato kodojnë një proteazë që normalisht përpunon transkriptin që rezulton në produkte funksionale të gjeneve.
Figura 01: Retrotranspozoni LTR
Gjeni Gag i retrotranspozonëve krijon një produkt që lidhet me transkriptet e tjera të retrotranspozonëve për të formuar grimca të ngjashme me virusin. Gjeni Pol prodhon produkte që përfshijnë enzima të tilla si domenet e transkriptazës së kundërt, integrazës dhe ribonukleazës H. Enzima e transkriptazës së kundërt kryen transkriptimin e kundërt të ADN-së së retrotranspozonit. Enzima e integrimit integron ADN-në e retrotranspozonit në ADN-në e gjenomit eukariotik. Domenet e ribonukleazës H janë të dobishme në ndarjen e lidhjeve fosfodiesterike midis ndërmjetësve të ARN-së. Retrotranspozonët LTR gjithashtu kodojnë transkriptet me vendet e lidhjes së tRNA në mënyrë që ato të mund t'i nënshtrohen transkriptimit të kundërt mjaft lehtë. Për më tepër, duke qenë se retrotranspozoni përmban informacione të gjenomit eukariotik, ai mund të fusë kopje të tij në vende të tjera gjenomike brenda një qelize eukariote.
Çfarë janë retrotranspozonët jo-LTR?
Retrotranspozonët jo-LTR janë një lloj retrotranspozonësh që nuk kanë përsëritje të gjata terminale në strukturën e tyre. Ashtu si retrotranspozonët LTR, retrotranspozonët jo-LTR përmbajnë gjithashtu gjene për transkriptazën e kundërt, proteinat lidhëse të ARN-së, nukleazën dhe nganjëherë domenet e ribonukleazës H. Por atyre u mungojnë përsëritjet e gjata të terminalit; në vend të kësaj, ata kanë përsëritje të shkurtra që mund të kenë një rend të përmbysur të bazave pranë njëra-tjetrës. Proteinat lidhëse të ARN-së lidhen me ndërmjetësin e transpozimit të ARN-së dhe nukleazat thyejnë lidhjet fosfodiesterike ndërmjet nukleotideve në acidet nukleike.
Figura 02: Retrotranspozonët LTR dhe Jo-LTR
Megjithëse janë retrotranspozone, ata nuk mund të kryejnë transkriptimin e kundërt duke përdorur një ndërmjetës ARN në të njëjtën mënyrë si retrotranspozonët LTR. Kjo ndodh sepse retrotranspozonët jo-LTR nuk përmbajnë sekuenca që lidhin tARN. Prandaj, një retrotranspozon jo-LTR i transkriptuar në mRNA dhe i përkthyer në proteina vepron si transkriptazë e kundërt. Transkriptaza e kundërt bën një kopje të ADN-së të ARN-së së retrotranspozonit jo-LTR që mund të integrohet në gjenom në një vend të ri. Për më tepër, retrotranspozonët jo-LTR ndahen në dy lloje: LINE (elementë bërthamorë të ndërthurur gjatë) dhe SINE (elementë bërthamorë të ndërthurur të shkurtër).
Cilat janë ngjashmëritë midis retrotranspozonëve LTR dhe jo-LTR?
- Retrotranspozonët LTR dhe jo-LTR janë dy llojet kryesore të retrotranspozonëve.
- Të dy llojet përmbajnë gjene për enzima të tilla si transkriptaza e kundërt, proteina lidhëse e ARN-së, nukleaza dhe domenet ribonukleaza H.
- Ato mund të gjenden në gjenomin e njeriut.
- Të dy llojet janë të rëndësishme evolucionare.
Cili është ndryshimi midis retrotranspozonëve LTR dhe jo-LTR?
Retrotranspozonët LTR kanë përsëritje të gjata terminale në strukturën e tyre, ndërsa retrotranspozonëve jo-LTR u mungojnë përsëritjet terminale të gjata në strukturën e tyre. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis retrotranspozonëve LTR dhe jo-LTR. Për më tepër, retrotranspozonët LTR kanë përsëritje të gjata të drejtpërdrejta që janë vetëm një sekuencë e bazave që përsëriten. Nga ana tjetër, retrotranspozonët jo-LTR kanë përsëritje të shkurtra që mund të kenë një renditje të përmbysur bazash pranë njëra-tjetrës.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis retrotranspozonëve LTR dhe jo-LTR në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – LTR vs Retrotranspozonët jo-LTR
Retrotranspozonët LTR dhe jo-LTR janë dy llojet kryesore të retrotranspozonëve. Retrotranspozonët LTR kanë përsëritje të gjata terminale në strukturën e tyre, ndërsa retrotranspozonët jo-LTR nuk kanë përsëritje të gjata terminale në strukturën e tyre. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis retrotranspozonëve LTR dhe jo-LTR.
