Dallimi kryesor midis izoskizomerëve dhe izokaudomerëve është se izoskizomerët njohin dhe çajnë të njëjtin vend kufizimi ose njohjeje ndërsa izokaudomerët njohin vende paksa të ndryshme kufizimi dhe çahen në të njëjtin vend.
Enzimat kufizuese ose endonukleazat kufizuese janë një lloj nukleazash që çajnë ADN-në me dy zinxhirë. Ata janë në gjendje të njohin sekuenca specifike të quajtura vende kufizuese, të cilat kanë origjinë palindromike. Bakteret prodhojnë enzima kufizuese kundër patogjenëve të huaj, veçanërisht kundër viruseve. Është një formë e mekanizmit mbrojtës të treguar nga bakteret. Në varësi të strukturës së enzimës dhe natyrës së prerjeve, ekzistojnë tre lloje të enzimave kufizuese si enzimat kufizuese të tipit I, enzimat kufizuese të tipit II dhe enzimat kufizuese të tipit II. Për më tepër, në varësi të aktivitetit biokimik dhe burimit të izolimit, ekzistojnë tre lloje të enzimave kufizuese si izoskizomerët, neoskizomerët dhe izokaudomerët.
Çfarë janë izoskizomerët?
Izoskizomerët janë një lloj enzime kufizuese që vjen nga burime të ndryshme, por që njohin dhe çajnë të njëjtin vend kufizues në ADN. Prandaj, dy izoskizomerë kanë të njëjtin vend njohjeje. Ata çahen në të njëjtin vend, kështu që ato janë specifike për të njëjtën sekuencë njohjeje. Për shembull, enzimat kufizuese SphI dhe BbuI janë dy izoskizomerë që njohin dhe çahen në CGTAC/G.
Figura 01: Enzima kufizuese
Një palë tjetër izoskizomerësh është HpaII dhe MspI. Ata të dy njohin sekuencën 5'-CCGG-3' dhe çajnë ADN-në. Për më tepër, Bsp EI dhe Acc III janë gjithashtu izoskizomerë që janë nga një specie Bacillus dhe Acinetobacter calcoaceticus, përkatësisht. Izolimi i izoskizomerëve mund të bëhet nga baktere të ndryshme. Meqenëse ato vijnë nga baktere të ndryshme, kushtet e tyre të kufizimit mund të jenë të ndryshme nga njëra-tjetra.
Çfarë janë Isocaudomers?
Izokaudomerët janë një lloj enzime kufizuese që njeh sekuenca paksa të ndryshme, por ato çahen në të njëjtin vend për të prodhuar të njëjtat skaje. Izokaudomerët vijnë gjithashtu nga baktere të ndryshme. Sau3a dhe BamHI janë një palë izokaudomerësh. Ata prodhojnë fund ngjitës 5'-GATC-3' pas ndarjes së të njëjtit vend. Një palë tjetër izokaudomerësh është NcoI nga Nocardia corallina dhe PagI nga Pseudomonas alcaligenes. Këto dy enzima lidhen gjithashtu në sekuenca të ndryshme njohjeje, por priten në të njëjtin vend dhe prodhojnë të njëjtat skaje ngjitëse. Prandaj, skajet e prodhimit të prerjes janë të pajtueshme me njëri-tjetrin dhe ato mund të lidhen me njëri-tjetrin. XhoI, PspXI dhe SalI janë gjithashtu izokaudomerë.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet izoskizomerëve dhe izokaudomerëve?
- Izoskizomerët dhe izokaudomerët janë dy lloje të enzimave kufizuese.
- Dy izoskizomerë kanë të njëjtin vend tretjeje, të ngjashëm me dy izokaudomerë që kanë të njëjtën zonë tretjeje.
- Kanë origjinë prokariote.
- Të dyja kanë një vend për njohjen e kufizimeve si dhe një vend tretjeje.
- Ato prodhojnë skaje që janë të pajtueshme me njëri-tjetrin.
- Përveç kësaj, këto enzima janë mjete të dobishme në teknologjinë rekombinante të ADN-së.
Cili është ndryshimi midis izoskizomerëve dhe izokaudomerëve?
Izoskizomerët janë enzima kufizuese që njohin të njëjtën sekuencë të ADN-së dhe çahen në të njëjtin vend kufizues, ndërsa izokaudomerët janë enzima kufizuese që njohin sekuenca paksa të ndryshme të ADN-së, por prodhojnë të njëjtat skaje ngjitëse duke prerë në të njëjtin vend. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis izoskizomerëve dhe izokaudomerëve.
Infografia e mëposhtme pasqyron ndryshimin midis izoskizomerëve dhe izokaudomerëve.
Përmbledhje – Isoschizomers vs Isocaudomers
Izoskizomerët janë enzima kufizuese që njohin të njëjtën sekuencë të ADN-së dhe çahen në të njëjtin vend. Nga ana tjetër, izokaudomerët janë enzima kufizuese që njohin sekuencat paksa të ndryshme dhe çahen në të njëjtin vend duke prodhuar të njëjtat skaje. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis izoskizomerëve dhe izokaudomerëve. SphI, BbuI, HpaII dhe MspI janë disa shembuj të izoskizomerëve ndërsa Sau3a dhe BamHI janë dy shembuj të izokaudomerëve. Të dy izoskizomerët dhe izokaudomerët prodhohen natyrshëm nga bakteret.