Dallimi kryesor midis gjenit kandidat dhe GWAS është se qasja e gjenit kandidat heton variacionin gjenetik brenda një numri të vogël gjenesh të paracaktuara me interes ndërsa GWAS heton të gjithë gjenomin për një variacion gjenetik të përbashkët pas një gjendjeje të veçantë sëmundjeje.
Qasja e gjeneve kandidate dhe studimet e asociimit në të gjithë gjenomin (GWAS) janë dy metoda që janë të rëndësishme për të zbuluar ndjeshmërinë gjenetike ndaj sëmundjeve. Qasja e gjenit kandidat bazohet në një numër të vogël të gjeneve të paracaktuara ndërsa GWAS bazohet në testimin e të gjithë gjenomit. Prandaj, qasja e gjenit kandidat kërkon njohuri paraprake të gjeneve me rëndësi për sëmundjen, ndryshe nga GWAS.
Çfarë është Geni Kandidat?
Qasja e gjeneve kandidate është një nga teknikat që heton lidhjen midis variacionit gjenetik brenda gjeneve të paracaktuara të interesit dhe fenotipeve ose gjendjeve të sëmundjes. Në këtë qasje, është e nevojshme të kemi njohuri paraprake për ndikimin funksional biologjik të gjenit në tiparin ose sëmundjen në fjalë. Bazuar në këtë njohuri, një numër i vogël gjenesh përzgjidhen dhe analizohen për variacionin gjenetik.
Figura 01: Qasja e Gjenit Kandidat
Përzgjedhja e gjeneve bëhet në bazë të rëndësisë biologjike, fiziologjike dhe funksionale për sëmundjen në fjalë në këtë qasje. Kjo qasje është projektuar shpesh si një studim rast-kontroll.
Çfarë është GWAS?
GWAS qëndron për Studim të Shoqatës së Gjerë të Gjenomit. Ai gjithashtu i referohet studimeve të lidhjes së gjenomit të plotë. Këto studime fokusohen kryesisht në studime vëzhguese. Ata analizojnë variantet gjenetike të individëve të ndryshëm që zakonisht lidhen me një tipar specifik. I gjithë gjenomi është i rëndësishëm për analizën GWAS.
GWAS është një mjet i rëndësishëm në analizën e polimorfizmave të vetme nukleotide të lidhura me kushte të ndryshme sëmundjesh. Është një studim krahasues i polimorfizmave të ndryshme të vetme nukleotide në një popullatë të gjerë. Mostra e studimit të GWAS është shumë e lartë; prandaj, ai gjithashtu merr formatin e një studimi grupor ndërseksional.
Figura 02: GWAS
Studimi i parë GWAS u zhvillua në lidhje me infarktin e miokardit dhe duke analizuar gjenet që lidhen me infarktin e miokardit. Aktualisht, GWAS luan një rol të rëndësishëm në përcaktimin e sfondit gjenetik të sëmundjeve komplekse me etiologji të panjohur.
Cilat janë ngjashmëritë midis Genit Kandidat dhe GWAS?
- Të dyja qasja e gjenit kandidat dhe GWAS janë teknika që analizojnë lidhjen gjenetike midis gjenotipit dhe fenotipit të sëmundjes.
- Të dyja qasjet ndihmojnë për të kuptuar bazën gjenetike të ndjeshmërisë ndaj sëmundjeve.
Cili është ndryshimi midis gjenit kandidat dhe GWAS?
Qasja e gjenit kandidat bazohet në gjenet kandidate ose gjenet e paracaktuara, ndërsa GWAS bazohet në të gjithë gjenomin. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis gjenit kandidat dhe GWAS. Gjithashtu, në qasjen e gjeneve kandidate, përzgjedhja e gjeneve është e nevojshme ndërsa nuk është e nevojshme në GWAS.
Për më tepër, qasja e gjenit kandidat kërkon njohuri paraprake mbi gjenet që lidhen me sëmundjen, ndërkohë që nuk është e nevojshme për GWAS.
Infografika e mëposhtme ofron një krahasim më të detajuar në lidhje me ndryshimin midis gjenit kandidat dhe GWAS.
Përmbledhje – Gjeni i Kandidatit kundër GWAS
Geni kandidat dhe GWAS janë dy studime të lidhjes së gjeneve. Qasja e gjenit kandidat fokusohet në variacionin gjenetik të lidhur me sëmundjen brenda një numri të vogël gjenesh të paracaktuara. Në të kundërt, GWAS heton variacionin gjenetik të lidhur me sëmundjen brenda të gjithë gjenomit. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis gjenit kandidat dhe GWAS. Të dyja metodat janë të rëndësishme për të kuptuar bazën gjenetike të ndjeshmërisë ndaj sëmundjes.
