Dallimi kryesor midis QTL dhe GWAS mbështetet në llojin e sekuencave të përdorura në analizë. QTL përdor lokacionet e gjeneve lidhëse për të analizuar tiparet fenotipike të lidhura me trashëgiminë poligjenike ndërsa GWAS përdor sekuenca të tëra gjenomi për të analizuar polimorfizmat e vetme nukleotide të një gjendjeje të veçantë.
Hartat QTL dhe GWAS luajnë një rol të rëndësishëm në analizat gjenetike për tipare të ndryshme. Për më tepër, ato janë të rëndësishme në analizimin e kushteve të ndryshme të sëmundjes me etiologji të panjohur. Për më tepër, sekuenca luan një rol kyç në të dyja teknikat. Këto teknika mund të shoqërohen më tej me teknika të tjera të xhiros së lartë për saktësi dhe saktësi të shtuar.
Çfarë është QTL?
QTL do të thotë Locus sasior i tipareve. Është një rajon i ADN-së i lidhur me një tipar fenotipik. Në përgjithësi, një QTL shkakton efekte poligjenike. Shpërndarja e QTL-ve ndryshon dhe numri i QTL-ve sugjeron shkallën e variacionit të një tipari të caktuar fenotipik. Për më tepër, ato zakonisht kodojnë për tiparet themelore të vazhdueshme dhe jo tipare diskrete.
Me identifikimin e rajoneve QTL, është e rëndësishme të renditni një zonë të veçantë QTL. Për më tepër, për të lehtësuar hetimet dhe kërkimin, renditja dhe ruajtja e të dhënave të sekuencës së rajoneve të përbashkëta QTL bëhet me përfshirjen e bioinformatikës. Ne e quajmë këtë teknikë hartografike QTL. Më pas, një bazë të dhënash ndërtohet me sekuencat e rajonit QTL.
Figura 01: Skanimi QTL
Për më tepër, aplikimet e sekuencave QTL mbështeten kryesisht në mjetin BLAST, ku mund të përcaktohet ngjashmëria e sekuencës. Është e rëndësishme në deduktimin e marrëdhënieve ndërmjet organizmave. Për më tepër, është e rëndësishme në përcaktimin e kompleksitetit të një fenotipi të veçantë poligjenik. Ai gjithashtu përcakton evolucionin e një tipari të veçantë.
Për momentin, analiza QTL është e kombinuar me teknika të tjera të xhiros së lartë si mikrogrumbullimet e ADN-së. Kjo është e rëndësishme në analizën e shprehjes së fenotipit. Aktualisht, shkencëtarët janë shumë të interesuar në zhvillimin e bazës së të dhënave QTL pasi rajonet QTL janë përgjegjëse për shumë tipare të rëndësishme të specieve të ndryshme.
Çfarë është GWAS?
GWAS qëndron për Studimin e Shoqatës së Gjerë të Gjenomit. Ai gjithashtu i referohet studimeve të të gjithë lidhjes së gjenomit. Këto studime fokusohen kryesisht në studime vëzhguese. Ai analizon variantet gjenetike të individëve të ndryshëm që zakonisht lidhen me një tipar specifik. Për më tepër, i gjithë gjenomi është i rëndësishëm për analizën GWAS.
Figura 02: GWAS
GWAS është një mjet i rëndësishëm në analizën e polimorfizmave të vetme nukleotide të lidhura me kushte të ndryshme sëmundjesh. Ky është gjithashtu një studim krahasues i polimorfizmave të ndryshme të vetme nukleotide në një popullatë të gjerë. Për më tepër, kampioni i studimit të GWAS është shumë i lartë; prandaj, ai gjithashtu merr formatin e një studimi grupor ndërseksional.
Për më tepër, studimi i parë GWAS u zhvillua në lidhje me infarktin e miokardit dhe duke analizuar gjenet që lidhen me infarktin e miokardit. Aktualisht, GWAS luan një rol të rëndësishëm në përcaktimin e sfondit gjenetik të sëmundjeve komplekse me etiologji të panjohur.
Cilat janë ngjashmëritë midis QTL dhe GWAS?
- Ata mbështeten në të dhënat e sekuencave të ADN-së për analizën.
- Të dyja lidhen me prejardhjen gjenetike të karaktereve të ndryshme.
- Për më tepër, ata kërkojnë mjete bioinformatike për të nxjerrë dhe interpretuar rezultatet.
- Ato bëhen në popullata të mëdha.
Cili është ndryshimi midis QTL dhe GWAS?
QTL analizon tiparet fenotipike të lidhura me trashëgiminë poligjenike duke përdorur lokacione të lidhura gjenike ndërsa GWAS analizon polimorfizmat e vetme nukleotide të një gjendjeje të veçantë duke përdorur sekuenca të tëra gjenomi. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis QTL dhe GWAS. Harta QTL është relativisht një teknikë më pak komplekse se GWAS pasi kërkon sekuencë të plotë të gjenomit.
Infografia e mëposhtme përmbledh ndryshimin midis QTL dhe GWAS në formë tabelare.
Përmbledhje – QTL vs GWAS
Harta QTL dhe GWAS luajnë një rol të madh në përcaktimin e sfondit gjenetik të tipareve të ndryshme fenotipike. Ato ndihmojnë gjithashtu në analizimin e sfondit gjenetik të sëmundjeve të ndryshme. Harta QTL harton gjenet e lidhjes përgjegjëse për tiparet e vazhdueshme, dhe gjithashtu përfshin hartën e gjeneve të trashëgimisë poligjenike. GWAS, nga ana tjetër, zhvillohet me analizimin e të gjithë gjenomit për polimorfizma të vetme nukleotide. Përveç kësaj, kjo ndodh në një popullsi më të madhe. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis QTL dhe GWAS.
