Dallimi kryesor midis izoskizomerëve dhe neoshizomerëve është se izoskizomerët janë enzima kufizuese që kanë të njëjtën sekuencë njohjeje dhe çajnë ADN-në në të njëjtat pozicione, ndërsa neoskizomerët janë enzima kufizuese që kanë të njëjtën sekuencë njohjeje, por çajnë ADN-në në pozicione të ndryshme..
Enzimat kufizuese ose endonukleazat kufizuese janë enzima që çajnë ADN-në në fragmente në ose afër zonave specifike të njohjes. Ata prenë ADN-në në vendet e kufizimit. Enzimat kufizuese zakonisht klasifikohen në pesë grupe bazuar në strukturën, nëse ato prenë substratin e ADN-së në vendin e tyre të njohjes dhe nëse vendet e njohjes dhe ndarjes janë të ndara nga njëra-tjetra. Më shumë se 3600 endonukleaza kufizuese janë identifikuar tashmë. Përafërsisht 800 enzima kufizuese janë të disponueshme në treg. Izoskizomerët dhe neoshizomerët janë dy lloje enzimash kufizuese bazuar në vendin e njohjes dhe specifikën e ndarjes.
Çfarë janë izoskizomerët?
Izoskizomerët janë enzima kufizuese që kanë të njëjtën sekuencë njohjeje dhe çajnë ADN-në në të njëjtat pozicione. Këto enzima kufizuese kanë të njëjtin specifikë. Enzima e parë kufizuese e zbuluar që njeh një sekuencë të caktuar njihet si një prototip, ndërsa të gjitha enzimat kufizuese të identifikuara më pas që njohin të njëjtën sekuencë quhen izoskizomerë. Megjithatë, izoskizomerët mund të ndryshojnë në preferencat e vendit, kushtet e reagimit, ndjeshmërinë ndaj metilimit dhe aktivitetin e yllit. Izoskizomerët janë të izoluar nga shtame të ndryshme bakteresh. Prandaj, ata mund të kërkojnë kushte të ndryshme reagimi. Në disa raste, vetëm një nga një çift izoskizomerësh mund të njohë format e metiluara dhe të pametiluara të vendeve kufizuese. Nga ana tjetër, enzima tjetër kufizuese mund të njohë vetëm formën e pametiluar të vendit kufizues. Kjo veçori e veçantë e izoskizomerëve ndihmon në identifikimin e gjendjes së metilimit të vendit kufizues ndërsa e izolon atë nga një gjendje bakteriale.
Për shembull, AgeI dhe BshT1 njohin dhe ndajnë 5'-A↓CCGGT në të njëjtin model. HpaII dhe MSPI janë çifte të tjera izoskizomerësh. Ata të dy e njohin sekuencën 5'-C↓CGG-3' kur është e pametiluar. Por kur C e dytë e sekuencës është metiluar, vetëm MSPI mund ta njohë këtë sekuencë ndërsa HpaII nuk mund ta njohë atë.
Çfarë janë neoskizomerët?
Neoskizomerët janë enzima kufizuese që kanë të njëjtën sekuencë njohjeje, por çajnë ADN-në në pozicione të ndryshme. Në disa aplikacione të veçanta biologjike molekulare, kjo është një veçori shumë e dobishme. Neoskizomerët janë një nëngrup i izoskizomerëve. Shembuj të njohur për neoshizomerët janë SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) dhe XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); të dy njohin sekuencën 5'-CCCGGG-3' por i ndajnë ato në një pozicion të ndryshëm. Kështu, këto dy enzima kufizuese gjenerojnë lloje të ndryshme skajesh. Në këtë rast, SmaI prodhon skajet e hapura dhe XmaI prodhon skajet e spikatura 5'.
Figura 01: Neoskizomerët
Një shembull tjetër është çifti i enzimave kufizuese MaeII dhe Tail. Prototipi MaeII (A↓CGT) prodhon fragmente të ADN-së me një zgjatim 2-bazë 5', dhe Bishti i neoskizomerit (ACGT↓) prodhon fragmente të ADN-së me një shtrirje 4-bazë 3'.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet izoskizomerëve dhe neoshizomerëve?
- Izoskizomerët dhe neoshizomerët janë dy lloje të enzimave kufizuese.
- Ato gjenden kryesisht te prokariotët.
- Ato janë pjesë e sistemit të modifikimit të kufizimit (RM) që gjendet te bakteret dhe arkeat.
- Të dyja janë molekula proteinike.
- Të dy e ndajnë ADN-në në fragmente.
Cili është ndryshimi midis izoskizomerëve dhe neoskizomerëve?
Izoskizomerët janë enzima kufizuese që kanë të njëjtën sekuencë njohjeje dhe çajnë ADN-në në të njëjtat pozicione, ndërsa neoskizomerët janë enzima kufizuese që kanë të njëjtën sekuencë njohjeje, por çajnë ADN-në në pozicione të ndryshme. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis izoskizomerëve dhe neoskizomerëve. Për më tepër, izoskizomerët kanë të njëjtat specifika ndërsa neoskizomerët kanë specifika të ndryshme.
Infografia e mëposhtme liston ndryshimet midis izoskizomerëve dhe neoshizomerëve në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Isoschizomers vs Neoschizomers
Enzimat kufizuese janë enzima prerëse të ADN-së. Ata quhen gjithashtu gërshërë molekulare. Ekzistojnë lloje të ndryshme të enzimave kufizuese. Bazuar në vendin e njohjes dhe specifikën e ndarjes, enzimat kufizuese janë dy lloje si izoskizomerë dhe neoshizomerë. Izoskizomerët kanë të njëjtën sekuencë njohjeje dhe çajnë ADN-në në të njëjtat pozicione ndërsa neoskizomerët kanë të njëjtën sekuencë njohjeje, por çajnë ADN-në në pozicione të ndryshme. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis izoskizomerëve dhe neoshizomerëve.
