Dallimi kryesor midis bashkimit cis dhe trans është se bashkimi cis është një mekanizëm intramolekular që heq intronet dhe bashkon ekzonet që janë brenda të njëjtit transkript të ARN-së, ndërsa ndërlidhja është një mekanizëm ndërmolekular që heq intronet ose outronet dhe bashkon ekzonet që nuk janë brenda të njëjtit transkript të ARN-së.
Ndarja ARN është një formë e përpunimit të ARN-së përpara sintezës së proteinave. Në këtë proces, një transkriptim i ARN-së para-messenger i sapo bërë, transformohet në një ARN të pjekur të dërguar. ARN-ja e dërguar e pjekur ndihmon në prodhimin e një molekule proteine. Gjatë bashkimit të ARN-së, intronet (rajonet jo-koduese) hiqen dhe ekzonet (rajonet koduese) bashkohen së bashku për të krijuar mRNA të pjekur. Cis dhe trans splicing janë dy lloje të mekanizmave të bashkimit të ARN-së.
Çfarë është Cis Splicing?
Splicing Cis është një mekanizëm intramolekular që heq intronet dhe bashkon ekzonet që janë brenda të njëjtit transkript të ARN-së. Ngjitja normale cis përpunon një molekulë të vetme ARN. Lidhja Cis është procesi tipik i bashkimit të premARN-së i kryer nga spliceozomet. Në intron, një vend dhurues (fundi 5' i intronit), një vend i degës (afër skajit 3' të intronit) dhe një vend pranues (fundi 3' i intronit) janë shumë thelbësore për bashkimin. Vendi i dhuruesit të bashkimit përfshin një sekuencë të pandryshueshme GU në skajin 5' të intronit. Vendi pranues i bashkimit në skajin 3' të intronit ka një sekuencë AG të pandryshueshme. Në rrjedhën e sipërme nga sekuenca AG, ekziston një rajon i quajtur rajoni i pirimidinës (trakti polipirimidin). Më tej në rrjedhën e sipërme nga trakti i polipirimidinës, ekziston një pikë dege që përfshin një nukleotid adenozine. Ky nukleotid është i përfshirë në formimin e lariatit.
Figura 01: Lidhja Cis dhe Trans
Spliceosomet kryesore janë U1, U2, U4, U5 dhe U6. Midis tyre, U1 dhe U2 janë shumë të rëndësishme. Në bashkimin cis, U1 lidhet me vendin e bashkimit 5' dhe U2 lidhet me pikën e degëzimit pranë vendit të bashkimit 3'. U5/U4/U6 lidh ekzonet në vendin 5’, me U6 që lidhet me U2. Më vonë, U1 lëshohet. U5 zhvendoset nga ekzoni në intron dhe U6 lidhet në vendin e bashkimit 5'. Për më tepër, U4 është lëshuar gjithashtu. U6/U2 katalizon transesterifikimin, duke bërë që fundi 5' i intronit të lidhet me nukleotidin A në intron. Kjo shkakton formimin e lariatit. Në formimin e një lariati, U5 lidh ekzonin në vendin e bashkimit 3' dhe vendi 5' çahet. Në fazën përfundimtare të bashkimit, U2/U5/U6 mbeten të lidhura me lariatin dhe vendi 3' çahet. Përveç kësaj, ekzonet lidhen duke përdorur hidrolizën ATP në këtë fazë.
Çfarë është Trans Splicing?
Trans splicing është një mekanizëm ndërmolekular që heq intronet ose outronet dhe bashkon ekzonet që nuk janë brenda të njëjtit transkript të ARN-së. Në trans-splicing, nuk ka një vend bashkimi 5' në molekulën para mRNA që proteina U1 të lidhet. Në vend të kësaj, ARN-ja e liderit të mbështjelljes me kapak (SL) është trans-splikuar në sekuencë në outron.
Figura 02: Lidhja trans
Outron është një rajon i pre-mARN-së midis kapakut 5' dhe vendit të bashkimit trans. Sidoqoftë, proteina U2 zakonisht lidhet me vendin e bashkimit 3. Pas heqjes së outronit, ekzoni i liderit të bashkimit (SL) lidhet me ekzonin e parë në premARN. Për më tepër, trans-splicing është një mekanizëm që vërehet në mikroorganizma të caktuar si protistët e klasës Kinetoplastae për të shprehur gjenet.
Cilat janë ngjashmëritë midis bashkimit Cis dhe Trans?
- Splikimi Cis dhe trans janë dy lloje të mekanizmave të lidhjes së ARN-së.
- Në të dy mekanizmat, intronet hiqen.
- Gjithashtu, në të dy mekanizmat, ekzonet bashkohen për të formuar mARN të pjekur.
- Të dy mekanizmat gjenden te eukariotët.
- Këto mekanizma mungojnë te prokariotët.
Cili është ndryshimi midis bashkimit Cis dhe Trans?
Splicing Cis është një mekanizëm intramolekular që heq intronet dhe bashkon ekzonet që janë brenda të njëjtit transkript të ARN-së, ndërsa trans-splicing është një mekanizëm ndërmolekular që heq intronet ose outronet dhe bashkon ekzonet që nuk janë brenda të njëjtës ARN. transkript. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis bashkimit cis dhe trans. Për më tepër, në bashkimin cis, intronet hiqen për të formuar mRNA të pjekur. Nga ana tjetër, në ndërlidhjen trans, intronet ose outronet hiqen për të formuar mARN të pjekur.
Infografia e mëposhtme liston ndryshimet midis bashkimit cis dhe trans në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Cis vs Trans Splicing
Ndarja ARN është një formë e përpunimit të ARN-së përpara procesit të sintezës së proteinave. Cis dhe trans splicing janë dy lloje të mekanizmave të bashkimit të ARN-së që gjenden në eukariotët. Cis splicing është një mekanizëm intramolekular që heq intronet dhe bashkon ekzonet që janë brenda të njëjtit transkript të ARN-së, ndërsa trans-splicing është një mekanizëm ndërmolekular që heq intronet ose outronet dhe bashkon ekzonet që nuk janë brenda të njëjtit transkript të ARN-së. Kështu, kjo përfundon diskutimin e ndryshimit midis bashkimit cis dhe trans.
