Dallimi kryesor midis elementëve të transpozueshëm të klasës I dhe klasës II është se elementët e transpozueshëm të klasës I janë retrotranspozone, ndërsa elementët e transpozueshëm të klasës II janë transpozone të ADN-së.
Një element i transpozueshëm është një sekuencë e ADN-së që mund të ndryshojë pozicionin e saj brenda gjenomit. Ndonjëherë krijon dhe kthen mutacione. Ai gjithashtu mund të ndryshojë identitetin gjenetik dhe madhësinë e gjenomit të qelizës. Ky proces shpesh rezulton në dyfishimin e të njëjtit material gjenetik. Elementi i transpozueshëm u zbulua për herë të parë nga Barbara McClintock, dhe ajo fitoi çmimin Nobel për zbulimin e saj në 1983. Elementet e transpozueshme mund të kategorizohen në dy klasa bazuar në mekanizmin e tyre të transpozimit: elementë të transpozueshëm të klasës I dhe të klasës II.
Cilat janë elementet e transpozueshme të klasës I?
Elementët e transpozueshëm të klasës I janë retrotranspozone. Retrotranspozoni është një lloj komponenti gjenetik që kopjon dhe ngjit veten në vende të ndryshme gjenomike duke e kthyer ARN-në përsëri në ADN përmes një procesi të quajtur transkriptim i kundërt. Ky proces katalizohet nga enzima e transkriptazës së kundërt. Retrotranspozoni zakonisht përdor një ndërmjetës të transpozimit të ARN-së. Elementet e transpozueshme të klasës I zakonisht kopjohen në dy faza. Së pari, ato transkriptohen nga ADN në ARN. Pastaj ARN-ja e prodhuar më pas transkriptohet anasjelltas në ADN. Më vonë, kjo ADN e kopjuar futet përsëri në gjenom në një pozicion të ri. Karakteristikat e retrotranspozonëve janë shumë të ngjashme me retrovirusin si HIV.
Figura 01: Elementi i transpozueshëm i klasës I
Retrotranspozonët mund të ndahen në tre lloje.
- Retrotranspozone me përsëritje të gjata terminale (LTR), që kodojnë për transkriptazën e kundërt,
- Retrotranspozone me elementë bërthamorë të ndërthurur gjatë (LINE) të cilët kodojnë për transkriptazën e kundërt, por nuk kanë LTR dhe transkriptohen nga ARN polimeraza II,
- Retrotranspozone me elementë bërthamorë të ndërthurur të shkurtër (SINE) të cilët nuk kodojnë për transkriptazën e kundërt dhe transkriptohen nga ARN polimeraza III.
Për më tepër, për shkak të një mekanizmi të ngjashëm me retrotranspozonët, retrovirusi mund të konsiderohet gjithashtu si elementë të transpozueshëm.
Cilat janë elementet e transpozueshme të klasës II?
Elementët e transpozueshëm të klasës II janë transpozone të ADN-së. Elementët e transpozueshëm të klasës II kanë një mekanizëm transpozimi të prerë dhe ngjitur që nuk përfshin një ndërmjetës ARN. Transpozimi katalizohet nga disa enzima të transpozazës. Këto enzima mund të lidhen në mënyrë specifike ose jo specifike me ADN-në. Transpozaza bën një prerje të lëkundur në vendin e synuar të ADN-së që prodhon skajet ngjitëse. Më pas këto ndërpresin lidhjet e transpozonit të ADN-së në vende të tjera të synuara.
Figura 02: Elemente të transpozueshme të klasës II
Zakonisht, ADN polimeraza mbush boshllëqet që rezultojnë nga skajet ngjitëse dhe ADN ligaza mbyll shtyllën kurrizore të sheqer-fosfatit. Për më tepër, ky transpozim rezulton në dyfishimin e faqes së synuar. Vendet e futjes së transpozonëve të ADN-së mund të identifikohen me përsëritje të shkurtra, të drejtpërdrejta të ndjekura nga përsëritje të përmbysura. Por jo të gjithë transpozonët e ADN-së tregojnë një mekanizëm transpozimi të prerë dhe ngjitur. Për shembull, disa transpozone tregojnë transpozim replikativ në të cilin transpozonët replikohen në një vend të ri të synuar.
Ngjashmëritë ndërmjet elementeve të transpozueshme të klasës I dhe klasës II
- Elementët e transpozueshëm të klasës I dhe të klasës II janë elementë gjenetikë të lëvizshëm ose gjene kërcyese.
- Të dy mund të ndryshojnë pozicionin e tyre në gjenom.
- Ato përbëhen nga sekuenca të ADN-së.
- Ata janë elementë gjenetikë egoistë.
- Ato janë shumë të rëndësishme në funksionin gjenomik dhe evolucionin.
Dallimi midis elementeve të transpozueshme të klasës I dhe klasës II
Elementët e transpozueshëm të klasës I janë retrotranspozonët, ndërsa elementët e transpozueshëm të klasës II janë transpozone të ADN-së. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis elementeve të transpozueshme të klasës I dhe klasës II. Për më tepër, elementët e transpozueshëm të klasës I përdorin ndërmjetës të ARN-së në mekanizmin e transpozimit. Nga ana tjetër, elementët e transpozueshëm të klasës II përdorin ndërmjetës të ADN-së në mekanizmin e transpozimit.
Infografia e mëposhtme përmbledh ndryshimet midis elementeve të transpozueshme të klasës I dhe klasës II në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Klasa I vs Elemente të Transpozueshme të Klasës II
Elementet e transpozueshme njihen si elemente gjenetike të lëvizshme ose gjene kërcyese. Ato janë sekuenca të ADN-së. Elementet e transpozueshme kategorizohen në dy klasa bazuar në mekanizmin e tyre të transpozimit si elementë të transpozueshëm të klasës I dhe të klasës II. Elementët e transpozueshëm të klasës I janë retrotranspozonët, ndërsa elementët e transpozueshëm të klasës II janë transpozone të ADN-së. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis elementëve të transpozueshëm të klasës I dhe klasës II.