Dallimi kryesor midis motivit dhe domenit është se motivi nuk është i qëndrueshëm në mënyrë të pavarur ndërsa domeni është i qëndrueshëm në mënyrë të pavarur.
Proteinat janë makromolekula të rëndësishme biologjike të pranishme në trupin tonë. Nga ana tjetër, kodi gjenetik i një gjeni do të vendosë sekuencën e aminoacideve të një proteine. Për më tepër, proteinat kanë struktura parësore, dytësore dhe terciare. Struktura primare është sekuenca e aminoacideve të zinxhirit polipeptid. Kur zinxhirët polipeptidë palosen me njëri-tjetrin, ajo formon strukturën dytësore të proteinës. Spiralet alfa, fletët beta dhe strukturat supersekondare i përkasin strukturave dytësore. Disa grupime të elementeve super-sekondarë njihen si motive proteinike. Struktura terciare e një proteine i referohet strukturës së saj tre-dimensionale që vendos funksionin e proteinës. Domeni është një seksion i palosur i një molekule proteine, e cila është globulare dhe ka një funksion diskret. Është struktura themelore funksionale dhe tre-dimensionale e proteinës.
Çfarë është motivi?
Motivi është një grupim i caktuar i elementeve super dytësore të proteinave siç janë helikat alfa dhe strukturat beta. Ato janë një lloj modeli i pranishëm në proteina të ndryshme. Motivet përshkruajnë modelet e palosjes së elementëve strukturorë dytësorë dhe ndërveprimet e tyre. Këto modele të palosshme stabilizohen nga lidhje të ngjashme që janë të pranishme në strukturat terciare. Megjithatë, ato nuk janë aq komplekse sa strukturat terciare.
Figura 01: Motivi
Janë kombinime të thjeshta të strukturave dytësore të proteinave. Motivi nuk është i qëndrueshëm në vetvete. Për më tepër, motivet shpjegojnë strukturën e një proteine, por nuk parashikojnë funksionin e një proteine. Shembuj të motiveve të proteinave janë një motiv beta-alfa-beta, motivi kryesor grek, fuçi beta, motivi beta-meander, etj.
Çfarë është Domain?
Domeni është një njësi themelore, funksionale dhe tredimensionale e një proteine. Kryen një funksion të veçantë. Një proteinë e vetme mund të ketë disa fusha të ndryshme. Çdo domen është një njësi e pavarur. Është një strukturë globulare. Ai është përgjegjës për një funksion ose ndërveprim specifik. Domenet mund të përdoren për të hipotezuar funksionin e një proteine të pakarakterizuar. Kur analizohet një proteinë, është thelbësore të merret parasysh pasi domenet janë njësitë funksionale të proteinës.
Figura 02: Tre fusha të ndryshme të piruvat kinazës
Domenet janë struktura shumë të qëndrueshme dhe kompakte. Ato mund të dallohen lehtësisht nga rajonet e tjera. Piruvat kinaza ka tre domene dalluese siç tregohet në figurën 02. Gjatësia e domenit mund të ndryshojë dhe gjatësia mesatare është 100 aminoacide. Çdo domen përmban një bërthamë hidrofobike të ndërtuar nga njësi strukturore dytësore. Disa fusha së bashku krijojnë strukturën terciare të një proteine.
Cilat janë ngjashmëritë midis motivit dhe domenit?
- Motivi dhe domeni janë njësi të pranishme në vetë molekulat e proteinave.
- Ato janë të dobishme kur klasifikojnë familjet e proteinave.
Cili është ndryshimi midis motivit dhe domenit?
Motivi është një grupim i caktuar i elementeve super dytësore të proteinave si spirale alfa dhe struktura beta ndërsa domeni është njësia funksionale e një proteine. Për më tepër, motivi është një strukturë dytësore ndërsa domeni është përgjegjës për strukturën terciare të proteinës. Për më tepër, domeni është një njësi e pavarur, ndryshe nga një motiv. Gjithashtu, domeni përshkruan funksionin e një proteine ndërsa motivi jo. Këto janë ndryshimet kryesore midis motivit dhe domenit. Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimin midis motivit dhe domenit në formë tabelare.
Përmbledhje – Motiv vs Domain
Motivi është një rregullim i strukturave dytësore të molekulës së proteinës. Zakonisht nuk është i qëndrueshëm në vetvete, ndryshe nga një domen. Domeni është një strukturë e pavarur e qëndrueshme e një proteine. Prandaj, mund të jetë një pjesë ose një molekulë e plotë e proteinave. Është një njësi funksionale themelore tredimensionale e proteinës. Për më tepër, ai ka një funksion dhe është një njësi e pavarur. Motivi mund të jetë pjesë e domenit. Por domeni nuk mund të jetë pjesë e një motivi. Ky është ndryshimi midis motivit dhe domenit.
