Dallimi kryesor – ADN në rrjedhën e sipërme kundrejt rrjedhës së poshtme
Është e rëndësishme të keni njohuri të përgjithshme rreth përbërjes dhe strukturës së ADN-së në mënyrë që të kuptoni ndryshimin midis ADN-së në rrjedhën e sipërme dhe të poshtme. ADN-ja përbëhet nga vargje polinukleotide. Nukleotidet janë blloqet ndërtuese që krijojnë zinxhirë polinukleotidësh dhe çdo nukleotid përbëhet nga tre përbërës: një sheqer me pesë karbon, një bazë azotike dhe një grup fosfat. Një grup fosfat dhe një grup OH janë të lidhur me karbonin e pozicionit 5' dhe karbonin e pozicionit 3' të molekulës së sheqerit në një nukleotid, përkatësisht. Nukleotidet janë të lidhura së bashku me lidhje fosfodiesterike të formuara midis grupit 5' fosfat të një nukleotidi dhe grupit 3' OH të nukleotidit ngjitur. Nëse një zinxhir polinukleotid ka një grup të lirë 5' fosfat, ai caktohet si fundi 5'; nëse ka një grup OH të lirë 3', caktohet si fund 3'. Prandaj, vargjet e ADN-së zakonisht kanë skajet 5' dhe 3' sipas pozicioneve fundore të vargjeve polinukleotide. ADN-ja ekziston gjithashtu si formë me dy fije. Dy fije janë antiparalele me njëra-tjetrën. Prandaj, ADN-ja ka dy vargje që shkojnë drejt drejtimit 5' deri në 3' dhe drejtimit 3' deri në 5'. ADN-ja në rrjedhën e sipërme dhe në rrjedhën e poshtme referohet duke iu referuar transkriptimit dhe sintezës së vargut mRNA 5' deri në 3'. Nëse ADN-ja konsiderohet drejt fundit të 5-të të vargut kodues nga vendi i fillimit të transkriptimit, ajo njihet si ADN në rrjedhën e sipërme. Nëse ADN-ja konsiderohet drejt skajit 3' nga vargu kodues nga vendi i fillimit të transkriptimit njihet si ADN në rrjedhën e poshtme. Ky është ndryshimi kryesor midis ADN-së në rrjedhën e sipërme dhe të poshtme.
Çfarë është ADN-ja në rrjedhën e sipërme?
Një gjen është një njësi strukturore dhe funksionale e trashëgimisë e cila ndodhet në ADN-në e një organizmi. Ajo ruhet me udhëzime për të ndërtuar një proteinë. Gjeni ka një rajon specifik të një molekule të ADN-së. Kur kërkohet, ai transkriptohet dhe përkthehet në një proteinë nëpërmjet sintezës së një vargu mRNA. Normalisht, një varg kodues i gjenit shkon nga drejtimi 5' në 3'. Kur transkriptohet, ai prodhon një varg mRNA në të njëjtin drejtim 5' deri në 3'. Gjatë transkriptimit, vargu antisens 3' deri në 5' shërbehet si varg shabllon dhe fillon sintezën e mRNA. Ekziston një vend i fillimit të transkriptimit në gjen. Duke iu referuar vendit të fillimit të transkriptimit, rajoni i ADN-së drejt skajit 5' të vargut kodues njihet si ADN në rrjedhën e sipërme. Një promotor i gjenit normalisht ndodhet në rajonin e sipërm të ADN-së. Në gjenet eukariote, ka kuti TATA, elementë proksimal promotor dhe përmirësues në zonën në rrjedhën e sipërme të gjenit. Rajoni në rrjedhën e sipërme të gjenit referohet me numra negativë. ADN-ja në rrjedhën e sipërme të një gjeni ka një rëndësi të madhe për transkriptimin.
Çfarë është ADN në rrjedhën e poshtme?
Vendi i fillimit të transkriptimit njihet si +1 pikë e një gjeni. Rajoni i ADN-së nga pika +1 drejt skajit 3' të vargut kodues njihet si ADN në rrjedhën e poshtme. Me fjalë të tjera, në rrjedhën e poshtme të gjenit është nga vendi i fillimit të transkriptimit drejt skajit 5' të vargut të shabllonit. Prandaj, ADN-ja në rrjedhën e poshtme të një rajoni gjenik përfshin njësinë transkriptuese dhe sekuenca të tjera si sekuenca terminatore. Promotori mund të ndikojë në sekuencën e poshtme të një gjeni. Pjesa e poshtme e një gjeni referohet me numra pozitiv. ADN-ja e poshtme e një gjeni është rajoni aktual që jep produktin proteinik.
Figura 01: ADN-ja e sipërme dhe e poshtme
Cili është ndryshimi midis ADN-së së sipërme dhe të poshtme?
Në rrjedhën e sipërme vs ADN në rrjedhën e poshtme |
|
| Rajoni i ADN-së drejt fundit 5' të sekuencës koduese nga vendi i fillimit të transkriptimit njihet si ADN në rrjedhën e sipërme. | Rajoni i ADN-së drejt skajit 3' të vargut kodues nga vendi i fillimit të transkriptimit njihet si ADN në rrjedhën e poshtme. |
| Elementet | |
| Promotorët dhe përmirësuesit janë të vendosur në ADN-në e sipërme | Njësia e transkriptimit dhe sekuencat e terminatorit ndodhen në ADN-në e poshtme. |
| Numërim | |
| Nukleotidet në rajonin e sipërm referohen me numra negativ | Nukleotidet referohen me numra pozitiv. |
| Funksion | |
| Ky rajon përmban elemente të nevojshme për të rregulluar dhe nisur transkriptimin | Ky rajon përmban udhëzime për të prodhuar një proteinë dhe për të përfunduar transkriptimin |
Përmbledhje – ADN në rrjedhën e sipërme kundrejt rrjedhës së poshtme
Është e lehtë të identifikosh në rrjedhën e sipërme dhe të poshtme të një vargu ARN. Për sa i përket vendit të referencës, rajoni drejt skajit 5' të vargut ARN njihet si ARN në rrjedhën e sipërme ndërsa rajoni drejt fundit të 3' njihet si ARN në rrjedhën e poshtme. Megjithatë, në ADN, ka dy fije që shkojnë në të dy drejtimet 5' në 3' dhe 3' në 5'. Prandaj, ndryshimi midis ADN-së në rrjedhën e sipërme dhe të poshtme është i ndërlikuar. Prandaj, ai diferencohet në lidhje me transkriptimin e një gjeni. Nga vendi i fillimit të transkriptimit drejt skajit të 5-të të vargut shqisor, rajoni i ADN-së njihet si ADN në rrjedhën e sipërme ndërsa nga vendi i fillimit të transkriptimit drejt skajit 3' të vargut shqisor njihet si ADN në rrjedhën e poshtme. Ky është ndryshimi midis rrjedhës së sipërme dhe rrjedhës së poshtme të ADN-së.
