Agarozë vs Polyakrilamid
Agaroza dhe Polyakrilamidi janë të dyja polimere të tretshme në ujë, por, midis tyre, mund të shihen shumë dallime, duke filluar nga origjina e tyre. Të dy Agarose dhe Polyacrylamide kanë diçka të përbashkët në aftësinë e tyre për të formuar matrica xhel poroze. Përkundër kësaj, ekzistojnë një sërë dallimesh të dallueshme midis të dyve. Dallimet kryesore midis të dy këtyre polimerëve qëndrojnë në natyrën e tyre të origjinës, strukturën kimike, përdorimet e tyre të ndryshme dhe performancën e tyre për sa i përket elektroforezës së xhelit.
Çfarë është Agarose?
Agaroza është një polimer linear natyral që rrjedh nga një polimer kompleks i quajtur agar që gjendet në alga deti. Agaroza nxirret nga agari duke hequr përbërësin e tij proteinik të quajtur agaropektinë. Agaroza është ajo që i jep agarit aftësinë e tij për të formuar xhel.
Përdorimi kryesor i agarozës është në studimet biologjike mikrobiologjike dhe molekulare. Në studimet mikrobiologjike, agaroza, kur plotësohet me lëndë ushqyese të përshtatshme, siguron një bazë solide për kultivimin e mikroorganizmave si bakteret dhe kërpudhat. Kur përdoret në përqendrime gjysmë të ngurta, mund të jetë i dobishëm në vlerësimin e lëvizshmërisë së këtyre mikroorganizmave. Në biologjinë molekulare, ai shërben si një mjet i rëndësishëm për një nga proceset më themelore të zgjidhjes të quajtur "elektroforeza e xhelit" ose "elektroforeza e xhelit të agarozës" (AGE). Elektroforeza me xhel është një proces që lejon zgjidhjen ose ndarjen e acideve nukleike ose proteinave bazuar në madhësinë dhe ngarkesën e tyre. Këtu, agaroza shërben si një xhel poroz në formë sitë përmes të cilit ndodh ndarja.
Struktura e Agarozës
Çfarë është poliakrilamid?
Polyacrylamide është një polimer sintetik dhe përdoret në një shumëllojshmëri të gjerë industrish. Siç u përmend më parë, përdorimi i tij mbështetet në aftësinë e tij për të formuar xhel. Megjithatë, përveç kësaj, aftësia e tij për të mbajtur dhe kulluar ujin në përqendrime të ndryshme është shfrytëzuar edhe në industri të ndryshme.
Përdorimi më i përhapur dhe i zakonshëm i poliakrilamidit është në trajtimin e ujërave të zeza. Këtu, përdoret si një agjent flokulues për të hequr çdo material organik të pezulluar; pra, duke përmirësuar turbullirën dhe duke pastruar ujin. Një përdorim tjetër i poliakrilamidit është në industrinë e letrës. Këtu, përdoret për të mbajtur ose për të kulluar ujin nga pulpa e letrës sipas nevojës. Në mënyrë të ngjashme, në industrinë bujqësore dhe të ndërtimit, përdoret si kondicioner i tokës për të parandaluar erozionin e tokës dhe për të përmirësuar cilësinë e saj.
Ashtu si agaroza, edhe poliakrilamidi përdoret në biologjinë molekulare si një mjet i rëndësishëm për zgjidhjen në një proces të ngjashëm të quajtur "Elektroforeza e xhelit të poliakrilamidit" (PAGE). Përveç gjithë kësaj, Polyakrilamidi përdoret gjithashtu në përpunimin e xehes dhe prodhimin e agjentit flokulues për të hequr çdo material organik të pezulluar; pra, duke përmirësuar turbullirën dhe duke pastruar ujin. Një përdorim tjetër i poliakrilamidit është në industrinë e letrës. Këtu, përdoret për të mbajtur ose për të kulluar ujin nga pulpa e letrës sipas nevojës. Në mënyrë të ngjashme, në industrinë bujqësore dhe të ndërtimit, përdoret si kondicioner i tokës për të parandaluar erozionin e tokës dhe për të përmirësuar cilësinë e saj. Përveç gjithë kësaj, Polyakrilamidi përdoret gjithashtu në prodhimin e aditivëve ushqimorë, lenteve të buta të kontaktit dhe tekstileve.
Struktura poliakrilamide
Cili është ndryshimi midis Agarozës dhe Polyakrilamidit?
Origjina e agarozës dhe poliakrilamidit:
Agaroza: Agaroza është një polimer me origjinë natyrore. Rrjedh nga alga deti.
Polyacrylamide: Polyacrylamide është me origjinë sintetike dhe nuk gjendet në asnjë rrethanë natyrore.
Formula molekulare e agarozës dhe poliakrilamidit:
Agarozë: formula molekulare e agarozës është C24H38O19..
Poliakrilamid: formula molekulare e poliakrilamidit është (C 3H5JO)n.
Struktura kimike e agarozës dhe poliakrilamidit:
Agaroza: Agaroza është një polisaharid linear. Ai përbëhet nga njësi disakaride të përsëritura të quajtura agrobiozë të mbajtura së bashku nga lidhjet hidrogjenore.
Poliakrilamid: Polyakrilamidi është një polimer i ndërlidhur kimikisht. Ai përbëhet nga monomere akrilamide dhe një agjent ndërlidhës N, N’-metilenbisakrilamid.
Toksiciteti i agarozës dhe poliakrilamidit:
Agaroza: Si agaroza, ashtu edhe njësia e saj monomere agrobioza janë jotoksike në natyrë.
Polyacrylamide: Njësia monomere e poliakrilamidit, akrilamide, është një kancerogjen i supozuar dhe neurotoksin i njohur ndërsa forma e polimerizuar e tij është jo toksike në natyrë.
Karakteristikat e xhelit të agarozës dhe poliakrilamidit:
AGE dhe PAGE:
Agarozë: Përgatitja e xhelit të agarozës për AGE është më pak kohë, e lehtë dhe e thjeshtë dhe nuk kërkon një katalizator iniciues ose polimerizues.
Poliakrilamid: Përgatitja e xhelit të poliakrilamidit për PAGE kërkon kohë dhe të mundimshme dhe gjithashtu kërkon një iniciator (persulfat amoniumi) dhe katalizator polimerizues (N, N, N', N'-tetrametilendiamine - TEMED)..
Natyra:
Xhelët poliakrilamid janë kimikisht më të qëndrueshëm se xhelët e agarozës.
Madhësia e poreve:
Duke pasur parasysh të njëjtin përqendrim, matricat e xhelit të poliakrilamidit priren të kenë madhësi pore më të vogla në krahasim me atë të një matrice xhel agaroze.
Ndryshimi i madhësisë së poreve:
Madhësia e poreve të xhelit të poliakrilamidit mund të ndryshohet në një mënyrë më të kontrolluar se ajo e xhelit të agarozës.
Fuqia zgjidhëse:
Xhelët poliakrilamid kanë fuqi të lartë zgjidhëse ndërsa xhelët e agarozës kanë fuqi të ulët zgjidhëse.
Acidi nukleik akomodues:
Xhelët poliakrilamid mund të strehojnë sasi më të mëdha të acidit nukleik sesa xhelët e agarozës për zgjidhjen.
