Transpozoni vs Retrotranspozoni
Transpozonët dhe retrotranspozonët janë përbërës gjenetikë të ADN-së dhe ka dallime të mëdha midis tyre. Përqindja e pranisë së këtyre materialeve gjenetike ndryshon nga speciet, dhe funksionet e tyre përcaktojnë fatet e organizmit me mutacione dhe ndryshime të tjera fenotipike të rëndësishme. Transpozonët dhe retrotranspozonët janë gjene ose koleksione të gjeneve të caktuara të vendosura në vargjet e ADN-së dhe ndryshimet e vendndodhjes së tyre kanë qenë shkaktarët kryesorë për këto pasoja. Sidoqoftë, ky artikull synon të diskutojë shkurtimisht funksionet e këtyre gjeneve dhe paraqet një krahasim midis transpozonëve dhe retrotranspozonëve.
Çfarë është Transpozoni?
Transpozonët janë fragmente ose segmente interesante të ADN-së me aftësinë për të ndryshuar vendndodhjen e vargut të ADN-së në formën e mekanizmit të prerjes dhe ngjitjes. Për shkak të kësaj natyre të lëvizshme të transpozonëve, këto njihen si gjene kërcyese. Transpozonët janë të dy llojeve kryesore të njohura si transpozonët e klasës I dhe transpozonët e klasës II. Zakonisht, lloji i klasës II referohet si transpozon dhe tipi i klasës I referohet si retrotranspozon. Proceset e prerjes dhe ngjitjes së segmenteve të lëvizshme të ADN-së rregullohen nga enzima transpozaza. Enzima lidhet me të dy skajet e transpozonit dhe pret lidhjet fosfodiesterike të vargut të ADN-së, izolon transpozonin, e zhvendos në vendin e synuar dhe lidhet në vendndodhjen e re. Megjithatë, ky proces është interesant për t'u kuptuar, pasi disa transpozone mund të lëvizin vetëm në vende të caktuara vetëm për shkak të papajtueshmërisë së sekuencave bazë me vendin e synuar. Gjenet me njërin skaj të një vargu të vetëm kanë të njëjtën sekuencë bazë me skajin tjetër të fijes tjetër të vetme janë transpozone me skaje ngjitëse, sepse ato mund të lidhen me vendet e vargut të ADN-së të synuar me të njëjtën sekuencë bazë si në skajet ngjitëse.. Megjithatë, kjo lëvizshmëri e gjeneve mund të shkaktojë ndryshime të gjenotipit si dhe në fenotipin e organizmit. Më pas u vunë në dispozicion shkencëtarët e shpikur rreth transpozonëve dhe ushqimeve dhe organizmave të modifikuar gjenetikisht sipas personalizimeve të preferuara. Të lashtat bujqësore me produktivitet të lartë, antibiotikët me veti mjekësore, kafshët blegtorale ishin disa nga produktet e zhvilluara me avantazhe pas shpikjes së transpozonëve nga Barbara McClintock në vitet 1940.
Çfarë është Retrotranspozoni?
Retrotranspozonët janë transpozonët e Klasit I, dhe këta lëvizin nëpër gjenom përmes mekanizmit të kopjimit dhe ngjitjes. Mekanizmi i lëvizshmërisë së retrotranspozoneve përfshin disa hapa madhorë si kopjimi i segmentit gjenik të vargut të ADN-së në ARN, transferimi i kopjes së ARN-së në vendin e synuar, transkriptimi i sekuencës së ARN-së përsëri në ADN duke përdorur transkriptazën e kundërt dhe futja të gjenit në vendndodhjen e re të vargut të ADN-së të gjenomit. Dy skajet e këtyre retrotranspozonëve zakonisht kanë përsëritje të gjata terminale me rreth 1000 çifte bazash, dhe ato përdoren si tipare identifikuese të këtyre gjeneve. Këto gjene amplifikohen lehtësisht brenda gjenomit, dhe përqindja e retrotranspozoneve në gjenomin e njeriut është rreth 50%. Këto mund të jenë mjaft të rrezikshme pasi virusi shkaktar i AIDS-it, HIV-it dhe virusit të leucemisë së qelizave T kanë retrotranspozonët në gjenomin e tyre të ARN-së. Në fakt, këto viruse mund të lidhin retrotranspozonët në çdo vend të vargjeve të ADN-së njerëzore me përdorimin e transkriptazës së kundërt dhe integrazës. Enzima e integrazës funksionon në të njëjtën mënyrë si transpozaza në transpozonët e klasës II.
Cili është ndryshimi midis Transposonit dhe Retrotransposonit?
• Transpozonët janë gjene kërcyese të klasës II ndërsa retrotranspozonët bien në kategorinë e klasës I.
• Transpozonët funksionojnë me enzimën transpozazë ndërsa retrotranspozonët funksionojnë me përdorimin e dy enzimave kryesore të njohura si transkriptaza e kundërt dhe integraza.
• Fundet e terminalit janë shumë më të gjata në retrotranspozone sesa në transpozone.
• Transpozonët priten nga origjina dhe ngjiten në objektiv; anasjelltas, retrotranspozonët kopjohen nga origjina në ARN dhe transkriptohen në objektiv.
• Lëvizja e retrotranspozonëve përfshin ARN por jo në transpozone.
