Dallimi kryesor midis profilizimit të polisomeve dhe profilizimit të ribozomeve është se profilizimi i polisomeve analizon sjelljen e ribozomit duke përdorur si ribozomin ashtu edhe mARN (polizom) gjatë përkthimit, ndërsa profilizimi i ribozomit analizon sjelljen e ribozomit vetëm duke përdorur sekuencën e mRNA gjatë përkthimit.
Përkthimi është faza e dytë e sintezës së proteinave që konverton informacionin në mRNA në një sekuencë aminoacide. Translatomics është një studim i ORF-ve (korniza të hapura të leximit) që përkthehen në mënyrë aktive në një qelizë të një organizmi. Teknikat e profilizimit të polizomit dhe ribozomit janë dy lloje teknikash në fushën e biologjisë molekulare për të vlerësuar dhe konkluduar parametra të ndryshëm në kontekstin e analizimit të përkthimit.
Çfarë është profilizimi i polizomit?
Profilizimi i polizomit është një teknikë që konstaton statusin e përkthimit të një ARN-je specifike duke analizuar sjelljen e ribozomeve dhe të mARN-së (polizome). Me fjalë të tjera, kjo teknikë ofron të dhëna dhe përfundime mbi lidhjen e mARN-ve me ribozomet. Polizoma i referohet grupit të ribozomeve të lidhur me një mARN që është e pranishme gjatë fazës së zgjatjes së përkthimit.
Figura 01: Profilizimi i polizomit
Profilizimi i polizomit kërkon lizatin e qelizave, i cili më pas centrifugohet. Mostra e centrifuguar më pas ndahet në bazë të densitetit të tyre për të karakterizuar nën-njësitë e vogla dhe të mëdha të ribozomeve dhe mARN-në përkatëse të përfshirë në formimin e polisomes. Për më tepër, procesi përfshin gjithashtu matjen e densitetit optik. Ekspertëve u kërkohet të kryejnë profilizimin e polisomeve.
Teknika e profilizimit të polizomit është një mjet i rëndësishëm për shumë aplikacione. Shkencëtarët përdorin këtë teknikë për të studiuar shkallën e përkthimit në qeliza. Më konkretisht, është një mjet për të dhënë informacion të saktë mbi studimin e proteinave individuale dhe mARN-ve të tyre specifike. Në kontekstin e studimit të shkallës së përkthimit të një mARN të veçantë, teknika e profilizimit të polisomeve është jetike. Këtu, sekuencat 3' dhe 5' të një mRNA mund të hetohen duke iu referuar efekteve të tyre në sasinë e mRNA të prodhuar dhe nivelin e përkthimit.
Çfarë është Profilizimi i Ribozomit?
Profilizimi i ribozomit është një teknikë që analizon sjelljen e ribozomit në lidhje me mARN-në e tij gjatë përkthimit. Kjo teknikë u gjet dhe u zhvillua nga Joan Steitz dhe Marilyn Kozak. Më vonë kjo teknologji u zhvillua më tej nga dy shkencëtarë, Nicholas dhe Jonathan, në kombinim me sekuencën e gjeneratës së ardhshme, gjë që çoi në zhvillimin e teknikave të ndryshme të ndërlidhura, siç është metodologjia e Përkthimit të Pastrimit të Afinitetit të Ribozomit (TRAP).
Figura 02: Sekuenca e Ribozomit
Procedura e profilizimit të ribozomeve përfshin izolimin e mARN-së, heqjen e ARN-së që nuk është e lidhur me ribozomet dhe ndarjen e mARN-së së lidhur me ribozomet. Pas kësaj procedure, izolimi i mRNA transkriptohet në të kundërt dhe ndodh sinteza e cDNA. Së fundi, të dhënat e sekuencës mund të përputhen me profilin e përkthimit për të deduktuar karakteristikat e sjelljes së ribozomit në lidhje me mARN.
Profilizimi i ribozomit ndihmon shumë studiues të identifikojnë dhe të konkludojnë vendndodhjen e vendeve të fillimit të përkthimit, plotësimin e kornizave të hapura të përkthyera të leximit (ORF) në një qelizë ose ind, shpërndarjen e ribozomeve në mARN dhe shkallën e duke përkthyer ribozomet. Profilizimi i ribozomit njihet gjithashtu si gjurmë ribozomi ose Ribo Seq.
Cilat janë ngjashmëritë midis Profilizimit të Polizomit dhe Profilizimit të Ribozomit?
- Profilizimi i polizomit dhe ribozomit janë teknika biologjike molekulare të rëndësishme në kërkime.
- Ata ofrojnë informacion mbi procesin e përkthimit.
- Të dy proceset e profilizimit ofrojnë të dhëna nëpërmjet analizës së përkthimit.
- Duhen ekspertë profesionistë për të kryer të dyja teknikat për rezultate të sakta.
- Mjetet e bioinformatikës luajnë një rol të rëndësishëm në të dyja teknikat.
Cili është ndryshimi midis Profilizimit të polizomit dhe Profilizimit të Ribozomit?
Profilizimi i polizomit analizon sjelljen e ribozomeve duke përdorur si ribozomin ashtu edhe mARN (polizomin) gjatë përkthimit, ndërsa profilizimi i ribozomeve analizon sjelljen e ribozomeve vetëm duke përdorur sekuencën e mRNA gjatë përkthimit. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis profilizimit të polisomeve dhe profilizimit të ribozomit. Për më tepër, profilizimi i polisomeve përfshin teknika si centrifugimi i gradientit të densitetit dhe matjet e densitetit optik, ndërsa profilizimi i ribozomeve përfshin teknikat e nxjerrjes dhe renditjes së mRNA. Gjithashtu, profilizimi i ribozomit është më i saktë se profili i polisomeve.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis profilizimit të polizomit dhe ribozomit në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Profilizimi i polizomit vs Profilizimi i ribozomeve
Përkthimi është faza e dytë e sintezës së proteinave që përfshin konvertimin e informacionit në sekuencën e mRNA në një sekuencë aminoacide. Ky proces kërkon një shabllon mRNA, ribozome, aminoacide, tRNA dhe faktorë të tjerë. Profilizimi i polizomit dhe ribozomit janë dy teknika molekulare. Profilizimi i polizomit analizon sjelljen e ribozomeve duke përdorur si ribozomin ashtu edhe mRNA (polizom) gjatë përkthimit, ndërsa profilizimi i ribozomeve analizon sjelljen e ribozomit vetëm duke përdorur sekuencën e mRNA gjatë përkthimit. Profilizimi i polizomit përfshin teknika si centrifugimi i gradientit të densitetit dhe matjet e densitetit optik. Profilizimi i ribozomit përfshin teknika si nxjerrja e mRNA, sinteza e cDNA dhe sekuenca. Pra, kjo përmbledh ndryshimin midis profilizimit të polisomeve dhe profilizimit të ribozomit.
