Dallimi kryesor midis nënnjësisë së proteinave dhe domenit është se një nënnjësi proteinike është një zinxhir i veçantë polipeptid i një proteine që mblidhet me zinxhirë të tjerë polipeptidikë për të formuar një kompleks proteinash ndërsa, një domen proteine është një rajon i afërt i zinxhirit polipeptid. e një proteine që shpesh paloset në mënyrë të pavarur në një njësi kompakte, lokale dhe gjysmë të pavarur.
Nënnjësia dhe domeni i proteinave janë pjesë shumë e rëndësishme e një proteine multimerike. Proteinat janë polimere të bëra nga polipeptide. Çdo zinxhir polipeptid ndërtohet nga një monomer i njohur si një aminoacid. Një proteinë komplekse përmban njësi strukturore të dallueshme siç janë nënnjësitë, domenet, motivi dhe palosja. Këto njësi strukturore të një proteine komplekse janë jashtëzakonisht të rëndësishme për strukturën e saj dhe në fund të fundit për funksionin e saj.
Çfarë është një nënnjësi proteinike?
Një nënnjësi proteine është një zinxhir i veçantë polipeptid i një proteine që bashkohet me zinxhirë të tjerë polipeptidikë për të formuar një kompleks proteinash. Në biologjinë strukturore, një nënnjësi proteine është një molekulë e vetme proteine që bashkohet me molekula të tjera proteinike për të formuar një kompleks proteinash. Proteinat natyrale kanë një numër relativisht të vogël nënnjësish, si hemoglobina dhe ADN polimeraza. Prandaj, ato quhen oligomerike. Proteinat e tjera përbëhen nga një numër i madh nënnjësish, kështu që ato përshkruhen si multimerike. Për shembull, mikrotubulat dhe proteinat e tjera të citoskeletit janë multimerike. Nënnjësitë e proteinës multimerike mund të jenë identike (homologe) ose krejtësisht të ndryshme (heterologjike).
Figura 01: Nën-njësia e proteinave
Në disa proteina multimerike, një nënnjësi mund të jetë një nënnjësi katalitike. Nga ana tjetër, tjetra është një nënnjësi rregullatore. Funksioni i nën-njësisë katalitike është katalizimi i reaksionit enzimatik ndërsa, funksioni i nën-njësisë rregullatore është duke lehtësuar ose frenuar aktivitetin e tij. Një enzimë që përbëhet nga njësi katalitike dhe rregullatore kur montohet zakonisht quhet holoenzimë. Për shembull, enzima e klasës I të fosfoinositidit 3-kinaza ka një nënnjësi katalitike p110 dhe një nënnjësi rregulluese p85. Për më tepër, një proteinë duhet të ketë një gjen për çdo nënnjësi. Kjo ndodh sepse një nënnjësi përbëhet nga një zinxhir polipeptid i veçantë që ka një gjen kodues.
Çfarë është një domen proteinash?
Një domen proteine është një rajon i ngjitur i zinxhirit polipeptid të një proteine që shpesh paloset në mënyrë të pavarur në një njësi kompakte, lokale dhe gjysmë të pavarura. Domeni i një proteine njihet gjithashtu si një rajon i zinxhirit polipeptid të proteinës që vetë-stabilizohet dhe paloset në mënyrë të pavarur nga pjesa tjetër. Ato janë një njësi e veçantë strukturore dhe funksionale në një proteinë. Normalisht, domenet janë përgjegjëse për një funksion specifik ose një ndërveprim që kontribuon në rolin e përgjithshëm të proteinës. Për shembull, domeni SH3 është rreth 50 mbetje aminoacide. Ato ndodhin në një gamë të ndryshme proteinash, duke përfshirë proteinat përshtatëse, fofatidilinositol3-kinazat, fosfolipazat dhe miozinat. Këto domene SH3 janë të përfshira në ndërveprimet protein-proteinë.
Figura 02: Domenet e proteinave
Domenet ndryshojnë në gjatësi nga 50 aminoacide në 250 aminoacide. Domenet më të shkurtra, si gishti i zinkut, stabilizohen nga jonet metalike dhe ura disulfide. Një domen shpesh prodhon njësi funksionale të tilla si domeni EF-dorës që lidh kalciumin i kalmodulinës. Për më tepër, domenet mund të ndërrohen përmes inxhinierisë gjenetike midis një proteine në tjetrën për të krijuar proteina kimerike.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet nën-njësisë së proteinave dhe domenit?
- Nënnjësia dhe domeni i proteinave janë njësi strukturore të një proteine multimerike.
- Të dyja përbëhen nga aminoacide.
- Ato janë të lidhura me termin "zinxhir polipeptid".
- Për më tepër, të dyja janë jashtëzakonisht të rëndësishme për funksionin e përgjithshëm të proteinës.
Cili është ndryshimi midis nën-njësisë së proteinave dhe domenit?
Një nënnjësi proteine është një zinxhir i veçantë polipeptid i një proteine që bashkohet me zinxhirë të tjerë polipeptidikë për të formuar një kompleks proteinash. Nga ana tjetër, një domen proteinash është një rajon i ngjitur i zinxhirit polipeptid të një proteine që shpesh paloset në mënyrë të pavarur në një njësi kompakte, lokale dhe gjysmë të pavarura. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis njësisë së proteinave dhe domenit. Për më tepër, një nënnjësi proteine është më e madhe në madhësi se një domen proteinash.
Tabela e mëposhtme përmbledh ndryshimin midis nënnjësisë së proteinave dhe domenit në formë tabelare.
Përmbledhje – Nën-njësia e proteinave kundrejt domenit
Blloqet ndërtuese të proteinave janë aminoacidet. Proteinat formohen nga kondensimi i aminoacideve. Strukturat e proteinave variojnë në madhësi nga dhjetëra në disa mijëra aminoacide. Struktura e proteinave stabilizohet nga ndërveprimet jokovalente si lidhjet hidrogjenore, lidhjet jonike, forcat Van der Waals, lidhjet hidrofobike dhe ndërveprimet kovalente të tilla si lidhjet disulfide. Një proteinë komplekse përmban njësi strukturore të dallueshme siç janë nënnjësitë, domenet, motivi dhe palosja. Një nënnjësi proteine është një zinxhir i veçantë polipeptid i një proteine që bashkohet me zinxhirë të tjerë polipeptidikë për të formuar një kompleks proteinash. Nga ana tjetër, domeni i proteinave është një rajon i zinxhirit polipeptid të proteinës që vetë-stabilizohet dhe paloset në mënyrë të pavarur nga pjesa tjetër. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis nënnjësisë së proteinave dhe domenit.
