Proteinat integrale kundrejt proteinave periferike
Proteinat konsiderohen si makro molekula, të cilat përbëhen nga një ose më shumë zinxhirë polipeptidikë. Zinxhirët polipeptid përbëhen nga aminoacide të lidhura së bashku nga lidhjet peptide. Struktura primare e një proteine mund të përcaktohet nga sekuenca e aminoacideve. Disa gjene kodojnë për shumë proteina. Këto gjene përcaktojnë sekuencën e aminoacideve, duke përcaktuar kështu strukturën e tyre parësore. Proteinat integrale dhe periferike konsiderohen si 'proteina të membranës plazmatike' për shkak të shfaqjes së tyre. Këto proteina janë përgjithësisht përgjegjëse për aftësinë e një qelize për të bashkëvepruar me mjedisin e jashtëm.
Proteina integrale
Proteinat integrale gjenden kryesisht të zhytura plotësisht ose pjesërisht në shtresën e dyfishtë të fosfolipideve të membranës plazmatike. Këto proteina kanë rajone polare dhe jopolare mbi to. Kokat polare dalin nga sipërfaqja e shtresës së dyfishtë ndërsa rajonet jopolare janë të ngulitura në të. Zakonisht vetëm rajonet jopolare ndërveprojnë me bërthamën hidrofobike të membranës plazmatike duke krijuar lidhje hidrofobike me bishtat e acideve yndyrore të fosfolipideve.
Proteinat integrale që shtrijnë të gjithë membranën nga sipërfaqja e brendshme në sipërfaqen e jashtme quhen proteina transmembranore. Në proteinat transmembranore, të dy skajet që dalin jashtë shtresës lipidike janë rajone polare ose hidrofile. Rajonet e mesme janë jopolare dhe kanë aminoacide hidrofobike në sipërfaqen e tyre. Tre lloje ndërveprimesh ndihmojnë për të futur këto proteina në shtresën e dyfishtë lipidike, përkatësisht, ndërveprimet jonike me kokat polare të molekulave fosfolipide, ndërveprimet hidrofobike me bishtat hidrofobe të molekulave të fosfolipideve dhe ndërveprimet specifike me rajone të caktuara lipidesh, glioligolipidesh ose glikolipidesh.
Proteina periferike
Proteinat periferike (proteinat e jashtme) janë të pranishme në shtresën e dyfishtë më të brendshme dhe të jashtme të fosfolipideve. Këto proteina lidhen lirshëm me membranën plazmatike ose drejtpërdrejt nga ndërveprimet me kokat polare të shtresave të dyfishta të fosfolipideve ose indirekt nga ndërveprimet me proteinat integrale. Këto proteina përbëjnë rreth 20-30 % të proteinave totale të membranës.
Shumica e proteinave periferike gjenden në sipërfaqen më të brendshme ose në sipërfaqen citoplazmike të membranës. Këto proteina mbeten të kufizuara ose nëpërmjet lidhjeve kovalente me zinxhirë yndyrorë ose nëpërmjet një oligosakaridi me fosfolipidet.
Cili është ndryshimi midis proteinave integrale dhe periferike?
• Proteinat periferike ndodhin në sipërfaqen e membranës plazmatike ndërsa proteinat integrale ndodhin plotësisht ose pjesërisht të zhytura në shtresën lipidike të membranës plazmatike.
• Proteinat periferike janë të lidhura lirshëm me shtresën e dyfishtë lipidike dhe nuk ndërveprojnë me bërthamën hidrofobike ndërmjet dy shtresave të fosfolipideve. Në të kundërt, proteinat integrale janë të lidhura fort dhe ndërveprojnë drejtpërdrejt me bërthamën hidrofobike të membranës plazmatike. Për shkak të këtyre arsyeve, shpërbërja integrale e proteinave është më e vështirë se proteinat periferike.
• Trajtimet e lehta mund të përdoren për të izoluar proteinat periferike nga membrana plazmatike, por për izolimin e proteinave integrale, trajtimet e buta nuk mjaftojnë. Për të thyer lidhjet hidrofobike, nevojiten detergjentë. Kështu, proteinat integrale mund të izolohen nga membrana plazmatike.
• Pas izolimit të këtyre dy proteinave nga membrana plazmatike, proteinat periferike mund të treten në tamponët ujorë neutralë, ndërsa proteinat integrale nuk mund të treten në tamponat ose agregatet ujore neutrale.
• Ndryshe nga proteinat periferike, proteinat integrale shoqërohen me lipide kur treten.
• Shembuj të proteinave periferike janë spektrina e eritrociteve, citokromi C dhe ATP-aza e mitokondrive dhe acetilkolinesteraza në membranat e elektroplaksit. Shembuj të proteinave integrale janë enzimat e kufizuara në membranë, receptorët e ilaçeve dhe hormoneve, antigjeni dhe rodopsina.
• Proteinat integrale përfaqësojnë rreth 70% ndërsa proteinat periferike përfaqësojnë pjesën e mbetur të proteinave të membranës plazmatike.
