Dallimi kryesor midis fragmentit Klenow dhe ADN polimerazës 1 është se fragmenti Klenow është një pjesë e madhe e polimerazës së ADN-së 1, së cilës i mungon aktiviteti 5' deri në 3' ekzonukleaza ndërsa ADN polimeraza është një enzimë e E. coli e cila i ka të treja. domenet duke përfshirë aktivitetin e ekzonukleazës 5' deri në 3'.
DNA polimeraza është një nga enzimat kryesore të përfshira në replikimin e ADN-së në organizmat e gjallë. Ekzistojnë forma të ndryshme të enzimës së polimerazës së ADN-së që gjenden te eukariotët dhe prokariotët bazuar në madhësinë dhe formën. ADN polimeraza 1, 2 dhe 3 gjenden vetëm në organizmat prokariote, dhe ato luajnë role të ndryshme në replikimin e ADN-së. ADN polimeraza 1 ka tre domene me aktivitet 5' deri në 3' polimerazë, 3' deri në 5' aktivitet ekzonukleazë dhe 5' deri në 3' aktivitet ekzonukleazë. Fragmenti Klenow është një produkt proteolitik i ADN polimerazës 1. Ai zotëron aktivitete 5 deri në 3' polimerazë dhe 3' deri në 5' ekzonukleaza të ADN polimerazës 1 të paprekur, por i mungon aktiviteti i ekzonukleazës 5' deri në 3'.
Çfarë është Fragmenti Klenow?
Fragmenti Klenow është një pjesë e madhe e ADN polimerazës 1. Ndryshe nga ADN polimeraza 1, aktiviteti i ekzonukleazës 5' deri në 3' nuk shihet në fragmentin Klenow pasi i mungon domeni i ekzonukleazës 5' deri në 3'. Fragmentet e Klenow-it prodhohen duke tretur polimerazën e ADN-së 1 me një proteazë të quajtur subtilisin, e cila është një enzimë për tretjen e proteinave. Në disa aplikime, aktiviteti i ekzonukleazës 3' deri në 5' të fragmentit Klenow bëhet i padëshirueshëm. Mund të hiqet duke futur një mutacion në gjenin që kodon fragmentin Klenow. Enzima që rezulton e cila ka vetëm aktivitetin e polimerazës 5' deri në 3' njihet si fragmenti ekzo-Klenow. Morfologjikisht, fragmenti Klenow i ngjan dorës së djathtë të njeriut. Ajo ka domenin N-terminal 3'-5' ekzonukleazë dhe domenin C-terminal të polimerazës të ndarë me rreth 30 A.
Figura 01: Fragmenti Klenow dhe ADN Polimeraza 1
Fragmenti Klenow është një mjet i rëndësishëm në teknikat biologjike molekulare. Fragmentet Klenow kanë përdorime të shumta. Ato janë jashtëzakonisht të rëndësishme në klonimin me fund të hapur, në mënyrë që të prodhohen fragmente të hapura. Fragmentet e Klenow-it mund të heqin mbingarkesat 3′ ose të mbushin mbingesat 5′ për të formuar skajet e hapura. Për më tepër, fragmentet Klenow përdoren për të sintetizuar ADN-në me dy fije nga fijet e vetme. Për më tepër, ato përdoren për të përgatitur sonda të etiketuara në mënyrë radioaktive duke përdorur aktivitetin e polimerazës së ADN-së të varur nga 5' deri në 3'.
Çfarë është ADN Polimeraza 1?
ADN polimeraza 1 (Pol 1) është një enzimë e gjetur në prokariote e cila është e nevojshme për replikimin e ADN-së bakteriale. Është lloji i parë i polimerazës së ADN-së i zbuluar nga Arthur Kornberg në vitin 1956. Pol 1 është polimeraza më e përhapur në E. coli. Ai është i koduar nga gjeni polA dhe përbëhet nga 928 aminoacide. Ai përbëhet nga tre domene. Të tre domenet përmbushin funksione të veçanta. Dy domene kryejnë aktivitet 5' deri në 3' ekzonukleazë dhe 3' deri në 5' aktivitet ekzonukleazë. Për shkak të këtij aktiviteti të zotëruar nga Pol 1, ai është i njohur si një enzimë riparuese e ADN-së dhe jo si një enzimë riprodhuese e ADN-së. Domeni i tretë ka aftësinë të katalizojë polimerizime të shumta (5' deri në 3') përpara lëshimit të ADN-së së shabllonit dhe lidhjes së fragmenteve Okazaki së bashku duke mbushur ADN-në e re dhe duke hequr abetaret e ARN-së.
Figura 02: ADN Polimeraza
Pol 1 i izoluar nga E Coli u përdor gjerësisht në aplikime molekulare. Megjithatë, sapo u zbulua Taq Polymerase, ajo zëvendësoi E Coli Pol 1 në teknologjinë PCR. Taq polimeraza është një lloj polimeraze e ADN-së e qëndrueshme që i përket Pol 1.
Cilat janë ngjashmëritë midis Fragmentit Klenow dhe ADN Polimerazës 1?
- Fragmenti Klenow është një pjesë e madhe e ADN polimerazës 1.
- Ata kanë aktivitet të polimerazës së ADN-së të varur nga 5' deri në 3' dhe aktivitet ekzonukleazë 3' deri në 5' që ndërmjetësojnë korrigjimin.
- Ato përdoren për qëllime të shumta.
Cili është ndryshimi midis Fragmentit Klenow dhe ADN Polimerazës 1?
Dallimi kryesor midis fragmentit Klenow dhe polimerazës 1 të ADN-së është se fragmentit të Klenow i mungon aktiviteti i ekzonukleazës 5' deri në 3' ndërsa polimeraza e ADN-së 1 ka aktivitet ekzonukleazë 5' deri në 3'. Prandaj, fragmenti Klenow ka dy domene, ndërsa ADN polimeraza 1 ka të tre domenet.
Më poshtë infografika tregon më shumë detaje të ndryshimit midis fragmentit Klenow dhe ADN polimerazës 1.
Përmbledhje – Fragmenti Klenow kundrejt ADN Polimerazës 1
DNA polimeraza 1 është një enzimë e E. coli e cila ka tre domene si domen polimerizimi 5' deri në 3', domen 3' deri në 5' ekzonukleazë dhe 5' deri në 3' domen ekzonukleazë. Fragmenti Klenow është një pjesë e madhe e polimerazës së ADN-së. I mungon një domen i ADN polimerazës 1, që është domeni i ekzonukleazës 5' deri në 3'. Dallimi kryesor midis fragmentit Klenow dhe polimerazës 1 të ADN-së është se fragmentet e Klenow nuk kanë domen 5' deri në 3' ekzonukleazë ndërsa ADN polimeraza 1 ka domenin 5' deri në 3' ekzonukleazë.
