Dallimi kryesor midis primerit dhe promotorit është se primeri është një sekuencë e shkurtër e ADN-së e sintetizuar në mënyrë komerciale e cila përdoret në PCR për amplifikimin e një sekuence të ADN-së së synuar ndërsa promotori është një sekuencë specifike e ADN-së që siguron një vend të sigurt lidhjeje fillestare për ARN-në. polimeraza dhe faktorët e transkriptimit për të filluar transkriptimin.
Abetarja dhe promotori janë dy lloje të sekuencave të ADN-së. Primeri është një fragment i vogël i ADN-së i nevojshëm për reaksionin zinxhir polimerazë (PCR). Ka sekuenca të shkurtra nukleotide plotësuese me skajin anësor të vargut të ADN-së. Ekzistojnë dy lloje abetaresh dhe ato funksionojnë si pika fillestare për sintezën e vargjeve të reja të ADN-së. Në të kundërt, një promotor është një sekuencë specifike e ADN-së e vendosur në rrjedhën e sipërme në vendin e fillimit të transkriptimit të një gjeni. Ai ndërvepron drejtpërdrejt me komponentët e mekanizmit të transkriptimit si ARN polimeraza dhe faktorët e transkriptimit për të kontrolluar transkriptimin e ADN-së. Prandaj, ARN polimeraza dhe faktorë të tjerë të transkriptimit lidhen me sekuencën e promotorit dhe nisin transkriptimin.
Çfarë është një Primer?
Primerët janë sekuenca të shkurtra të ADN-së të krijuara për amplifikimin e sekuencave të ADN-së të synuar. Strukturisht, ata posedojnë sekuenca të shkurtra nukleotide plotësuese me skajet anësore të vargjeve të dyfishta të ADN-së. Zakonisht janë rreth 20 nukleotide të gjata. Gjatë PCR, Taq polimeraza katalizon shtimin e nukleotideve në sekuencën nukleotide ekzistuese. Prandaj, primerët shërbejnë si pikënisje për sintezën e fijeve të reja. Taq polimeraza funksionon vetëm në drejtimin 5' deri në 3'. Prandaj, sinteza e ADN-së gjithashtu zhvillohet në të njëjtin drejtim 5' deri në 3'. Meqenëse ADN-ja është me dy zinxhirë, në PCR nevojiten dy lloje primerësh. Ato njihen si primer përpara dhe primer i kundërt, bazuar në drejtimin e zgjatjes së primerit gjatë sintezës së ADN-së.
Figura 01: Abetare
Abetarja përpara pjekjes me vargun antisens të ADN-së dhe fillon sintezën e + vargut të gjenit në drejtimin 5' deri në 3'. Ajo ka një sekuencë të shkurtër nukleotide që është plotësuese me skajin 3' anësor të vargut antisens. Abetarja e kundërt pjek me fillesën sensuale dhe fillon sintezën e një vargu plotësues të vargut kodues, i cili është - një varg i gjenit në drejtimin 5' deri në 3'. Kështu, abetarja e kundërt është projektuar si plotësuese me skajin 3' të vargut kodues. Si primerët e kundërt ashtu edhe ato të përparme janë të rëndësishme për prodhimin e miliona deri në miliarda kopjeve të rajoneve të veçanta të ADN-së që synohet ose interesohet.
Çfarë është një promovues?
Promotori është një sekuencë ADN-je e vendosur në rrjedhën e sipërme ose në fundin 5' të vendit të fillimit të transkriptimit të një gjeni. Ai siguron një vend lidhës për ARN polimerazën dhe disa elementë rregullatorë për të filluar transkriptimin e gjenit. Është një sekuencë rregullatore e nevojshme për ndezjen ose fikjen e një gjeni. Ekziston një sekuencë specifike nukleotide në promotor. Mund të ketë 100-1000 çifte bazash. Promotori tregon drejtimin e transkriptimit. Për më tepër, ai tregon vargun kuptimor që duhet të transkriptohet.
Figura 02: Promovuesi i një Gjeni
Ekzistojnë tre lloje të elementeve promotor si promotori kryesor, promotori proksimal dhe promotori distal. Promotori kryesor është pjesa minimale e promotorit që kërkohet për të filluar transkriptimin. Ndodhet më afër kodonit fillestar. Kutia TATA është një rajon i konservuar që gjendet në shumë promotorë bërthamorë eukariote. Gjendet 25 deri në 35 çifte bazash në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Promotori proksimal gjendet më në rrjedhën e sipërme të promotorit bërthamë. Në përgjithësi, ai ndodhet 250 çifte bazash në rrjedhën e sipërme të kodonit fillestar dhe përmban elemente rregullatore parësore. Promotori distal gjendet në rrjedhën e sipërme të promotorit proksimal dhe përmban elementë rregullues shtesë. Promotorët bakterial kanë dy elementë të sekuencës së shkurtër në promotorët e tyre. TATAAT është sekuenca konsensus e vendosur në -10 të promotorit bakterial ndërsa TTGACA është sekuenca konsensus në -35. Ato njihen si element -10 dhe element -35.
Cilat janë ngjashmëritë midis Primer dhe Promoter?
- Abetarja dhe promotori janë dy lloje të sekuencave të ADN-së.
- Ato përbëhen nga sekuenca nukleotide.
- Si primeri dhe promotori janë të rëndësishëm për shprehjen e gjeneve.
Cili është ndryshimi midis Primer dhe Promoter?
Primer është një sekuencë e shkurtër nukleotide e krijuar për amplifikimin e ADN-së së synuar. Në të kundërt, promotori është një sekuencë specifike rregullatore e ADN-së e gjetur në rrjedhën e sipërme në vendin e fillimit të transkriptimit të një gjeni. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis abetares dhe promotorit. Primerat janë rreth 20 çifte bazash të gjata ndërsa promotori mund të ketë 100 -1000 çifte bazash. Funksionalisht, primerët shërbehen si sekuenca fillestare për sintezën e vargut të ri ndërsa promotorët kontrollojnë transkriptimin e gjeneve duke siguruar vende lidhëse për ARN polimerazën dhe faktorë të tjerë transkriptimi.
Për më tepër, një promotor përkufizohet si drejtimi i transkriptimit dhe tregon vargun shqisor të një gjeni. Strukturisht, primeri është një sekuencë e shkurtër e ADN-së me një zinxhir, ndërsa promotori është një sekuencë e gjatë e ADN-së me dy zinxhirë.
Info-grafika e mëposhtme tabelon më shumë krahasime në lidhje me ndryshimin midis primerit dhe promotorit.
Përmbledhje – Primer vs Promoter
Primerët janë sekuenca të shkurtra nukleotide që plotësojnë skajet anësorë të ADN-së së synuar me dy fije floku. Në PCR përdoren dy lloje primerësh. Ato shërbejnë si sekuenca fillestare për sintezën e fijeve të reja. Primerët janë dizajnuar komercialisht dhe janë sekuenca të qëndrueshme ndaj temperaturës. Nga ana tjetër, promotori është një sekuencë rregullatore e një gjeni që ndodhet në rrjedhën e sipërme të vendit të fillimit të transkriptimit. Promovuesit kontrollojnë transkriptimin e gjeneve. Ato ofrojnë vende lidhëse për ARN polimerazën dhe faktorët e transkriptimit për të filluar transkriptimin. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis primerit dhe promotorit.
