Dallimi kryesor midis përfundimit të varur nga Rho dhe përfundimit të pavarur Rho është se në përfundimin e varur nga Rho, faktori Rho lidhet me transkriptin dhe përfundon transkriptimin duke thyer lidhjet hidrogjenore midis shabllonit dhe transkriptit, ndërsa përfundimi i pavarur Rho përfundon transkriptimin me duke prodhuar një strukturë të lakut të fijeve dhe më pas një rajon të pasur me U në transkript.
Transkriptimi është një nga dy fazat e shprehjes së gjeneve. Është procesi që prodhon një sekuencë mRNA nga informacioni gjenetik i fshehur në sekuencën e ADN-së së gjenit. Transkriptimi bëhet përmes tre hapave: fillimi, zgjatja dhe përfundimi. Enzima e ARN polimerazës lidhet me sekuencën promotore të gjenit dhe fillon të katalizojë sintezën e vargut të ARN-së. Derisa të gjendet sekuenca e terminatorit, ARN polimeraza shton nukleotide dhe ndërton vargun e ARN-së. Në prokariotët, përfundimi ndodh përmes dy strategjive kryesore të përfundimit: përfundimi i varur nga Rho dhe përfundimi i pavarur Rho. Faktori Rho është një proteinë që ka aktivitet helikazë.
Çfarë është përfundimi i varur nga Rho?
Përfundimi i varur nga Rho është një nga dy llojet e strategjisë së përfundimit të transkriptimit që ndodh te prokariotët. Faktori Rho është një proteinë që ka aktivitet helikazë.
Figura 01: Përfundimi i varur nga Rho
Proteina Rho lidhet me transkriptin e ARN-së dhe lëviz përgjatë polimerazës ARN në drejtimin 5'-3', duke inkurajuar ndarjen e lidhjeve hidrogjenore midis shabllonit të ADN-së dhe transkriptit të ARN-së. Kur faktori Rho arrin në flluskën e transkriptimit, ai e shkëput hibridin e ADN/ARN-së dhe e lëshon transkriptin nga flluska e transkriptimit. Kur kjo ndodh, ai përfundon transkriptimin.
Çfarë është përfundimi i pavarur i Rho?
Përfundimi i pavarur Rho është strategjia e dytë që përfundon transkriptimin prokariotik. Zakonisht, një rajon terminator ka një sekuencë përsëritjeje të përmbysur. Menjëherë pas sekuencës së përsëritur të përmbysur, ekziston një rajon i pasur me Adeninë (AAAA). Kur ARN polimeraza lëviz përpara, ajo prodhon një sekuencë mRNA. Meqenëse të dy rajonet janë plotësuese në rajonin e sekuencës së përsëritjes së përmbysur, ajo formon një strukturë lakore për flokë për shkak të lidhjes hidrogjenore. Rajoni i ardhshëm do të jetë rajoni i pasur me U. Struktura e fijeve ndalon aktivitetin e ARN polimerazës.
Figura 02: Përfundimi i pavarur i Rho
Për më tepër, në rajonet e pasura me U, ka ndërveprime të dobëta midis bazave U të transkriptit dhe bazave A të shabllonit. Këto lidhje të dobëta Adenine-Uracil destabilizojnë shabllonin e ADN-së dhe transkriptin e ARN-së dhe ndajnë njëri-tjetrin. Në fund, transkripti çlirohet nga faqja e transkriptimit.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet përfundimit të Rho Dependent dhe Rho Independent?
- Ndërprerja e varur nga Rho dhe përfundimi i pavarur Rho janë dy strategji kryesore të përfundimit që gjenden te prokariotët.
- Të dyja format lëshojnë transkriptin nga shablloni i ADN-së për të përfunduar transkriptimin.
Cili është ndryshimi midis përfundimit të Rho Dependent dhe Rho Independent?
Përfundimi i varur nga Rho ndërmjetësohet nga një proteinë Rho ndërsa përfundimi i pavarur Rho ndodh nëpërmjet formimit të një strukture të unazës së flokëve. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis përfundimit të varur nga Rho dhe përfundimit të pavarur Rho. Për më tepër, proteina Rho përdor energjinë ATP ndërsa përfundimi i pavarur Rho nuk përfshin proteinën Rho dhe nuk përdor energjinë ATP. Prandaj, ky është gjithashtu një ndryshim domethënës midis përfundimit të varur nga Rho dhe përfundimit të pavarur Rho.
Infografia e mëposhtme tregon më shumë krahasime në lidhje me ndryshimin midis përfundimit të varur nga Rho dhe përfundimit të pavarur Rho.
Përmbledhje – Rho Dependent vs Rho Independent Përfundimi
Përfundimi i varur nga Rho dhe përfundimi i pavarur Rho janë dy mekanizmat kryesorë të përfundimit të transkriptimit që ndodhin te prokariotët. Një proteinë Rho është përgjegjëse për përfundimin e transkriptimit në përfundimin e varur nga Rho. Në të kundërt, përfundimi i pavarur Rho ndodh nëpërmjet një formimi të strukturës së lakut të fijeve. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis përfundimit të varur nga Rho dhe përfundimit të pavarur Rho.
