Dallimi kryesor midis proteomikës së synuar dhe të pashënjestruar është se proteomika e synuar synon matjen e bollëkut të një proteine specifike ndërsa proteomika e pacaktuar nuk synon një proteinë specifike.
Proteomics është studimi në shkallë të gjerë i proteinave, strukturave dhe funksioneve të tyre. Ai studion të gjithë komplementin proteinik në një qelizë, ind ose organizëm në kushte specifike. Ekzistojnë dy lloje të proteomikës si proteomikë të synuar dhe proteomikë të pacaktuar.
Çfarë është Proteomika e synuar?
Siç tregon emri i saj, proteomika e synuar synon një proteinë specifike ose një peptid në një përzierje komplekse proteinash për analizë. Pastaj analizon praninë dhe sasinë e asaj proteine specifike të parazgjedhur. Kjo metodë është e mundur vetëm për një mostër ose për disa mostra. Kjo metodë është e përshtatshme edhe për një grup të caktuar proteinash. Rezulton në të dhëna më të sakta, sasiore dhe sensitive. Për më tepër, spektrometria e masës e shoqëruar me proteomikë të synuar prodhon matje më të sakta të besueshme. Kjo metodë përdor spektrometër masiv të trefishtë katërpolësh (QQQ) për analizën e saj.
Figura 01: Proteomics
Proteomika e synuar është një metodë e përshtatshme nëse dëshironi të verifikoni nëse objektivi i goditjes është rrëzuar në të vërtetë ose kur dëshironi të përcaktoni sasinë e një proteine/peptide të veçantë në serumin e gjakut, lëngun cerebral ose në lizatin e qelizave etj. përdorni atë nëse dëshironi të kontrolloni nëse një proteinë e caktuar shprehet në mënyrë të ndryshme nëpër mostra ose gjatë një eksperimenti të kursit kohor.
Çfarë është Proteomika e Pashënjestruar?
Proteomika e pacaktuar, siç përmend edhe emri, nuk synon një proteinë ose peptid specifik për analizën e saj. Proteomika e zbulimit është një emër tjetër për proteomikën e pacaktuar. Në fakt, është një analizë më ‘globale’. Në përgjithësi, kryerja e proteomikës së pacaktuar është për t'iu përgjigjur pyetjes "çfarë proteine ose proteinash janë në këtë kampion apo mostra të shumta?". Kjo metodë nuk është e ndjeshme si proteomikë e synuar. Por mund të identifikojë dhe masë shumë proteina, duke përfshirë proteinat e reja. Proteomika e pacaktuar mund të prodhojë matje sasiore dhe cilësore.
Cilat janë ngjashmëritë midis Proteomikëve të synuar dhe të pashënjestruar?
- Të dy proteomika e synuar dhe e pacaktuar matin proteinat në mostra.
- Ato janë të rëndësishme në analizën e proteomeve.
- Këto metoda përdorin spektrometrinë e masës.
Cili është ndryshimi midis Proteomikës së shënjestruar dhe të pacaktuar?
Së pari, proteomika e synuar është përcaktimi i pranisë dhe sasisë së një proteine ose peptidi të caktuar në përzierje komplekse proteinash. Në të kundërt, proteomika e pacaktuar është studimi sasior dhe cilësor i proteinave të pranishme në një mostër ose mostra pa synuar një proteinë të veçantë. Proteomika e synuar kryhet me proteina të parazgjedhura ose të synuara ndërsa proteomika e pacaktuar kryhet për të zbuluar llojet e proteinave në këtë mostër. Për më tepër, proteomika e synuar është më e ndjeshme sesa proteomika e pacaktuar.
Përmbledhje – Proteomika e shënjestruar kundër pa synuar
Për të përmbledhur, proteomika e synuar dhe e pacaktuar janë dy lloje të studimeve të proteinave. Siç sugjerojnë emrat e tyre, proteomika e synuar synon një proteinë specifike ndërsa proteomika e pacaktuar nuk synon një proteinë specifike. Ky është ndryshimi midis proteomikës së synuar dhe të pacaktuar.
