Dallimi kryesor – YAC vs vektorët BAC
Vektorët përdoren në klonimin molekular. Një vektor mund të përkufizohet si një molekulë e ADN-së e cila sillet si një mjet për të bartur material gjenetik të huaj në një qelizë tjetër. Një vektor që përmban ADN të huaj njihet si ADN rekombinante dhe duhet të ketë aftësinë për ta riprodhuar dhe shprehur atë brenda organizmit pritës. Kromozomi artificial i majave (YAC) dhe kromozomi artificial bakterial (BAC) janë dy lloje vektorësh të përfshirë në klonim. Dallimi kryesor midis YAC dhe BAC është se YAC është një sistem vektori i ndërtuar artificialisht duke përdorur një rajon specifik të kromozomit të majave për të futur segmente të mëdha të materialeve gjenetike në qelizat e majave ndërsa BAC është një sistem vektori i ndërtuar artificialisht duke përdorur një rajon specifik të E.kromozomi coli për të futur segmente të mëdha të ADN-së në qelizat E. coli.
Çfarë janë vektorët YAC?
YAC (kromozom artificial i majave) është një kromozom i ndërtuar artificialisht i cili ka aftësinë të mbajë një segment të madh të ADN-së së huaj dhe të replikohet brenda qelizave të majave. Ai ka një centromere, telomere si dhe sekuenca që përsëriten në mënyrë autonome që janë thelbësore për replikimin dhe stabilitetin. YAC duhet të ketë gjithashtu një shënues selektiv ose shënues dhe vende kufizuese për ta bërë atë një vektor efektiv klonimi. Një sekuencë e madhe që varion nga 1000 kb deri në 2000 kb mund të futet në YAC dhe të transferohet në maja. Efikasiteti i transformimit të YAC është shumë i ulët.
Figura 01: Vektori YAC
Çfarë janë vektorët BAC?
Kromozomi artificial bakterial (BAC) është një kromozom i ndërtuar artificialisht për klonimin molekular. Ka zona specifike të plazmidit F E. coli dhe është rrethor dhe super i mbështjellë. BAC është zhvilluar për të klonuar fragmentet e ADN-së në baktere, veçanërisht në E. coli. Mund të mbajë fragmente të ADN-së me madhësi deri në 300 kb. Krahasuar me YAC, futjet e klonimit BAC janë më të vogla në madhësi. BAC-të u zhvilluan në vitin 1992 dhe janë ende të njohura për shkak të qëndrueshmërisë dhe lehtësisë së ndërtimit. BAC janë gjithashtu të dobishme në zhvillimin e vaksinave.
Figura 02: Vektori BAC në klonimin molekular
Cili është ndryshimi midis vektorëve YAC dhe BAC?
YAC vs vektorët BAC |
|
| YAC është një kromozom i modifikuar gjenetikisht me përdorimin e ADN-së së majave për qëllime klonimi. | BAC është një molekulë e ADN-së e modifikuar gjenetikisht duke përdorur ADN-në e E. coli për qëllime klonimi. |
| Gjinia | |
| YAC u projektuan për të klonuar fragmente të mëdha të ADN-së gjenomike në maja. | BAC u zhvilluan për klonimin e fragmenteve të mëdha gjenomike në Escherichia coli. |
| Insert Length | |
| YAC mund të përmbajnë inserte gjenomike me madhësi megabaze.(1000 kb – 2000 kb). | BAC mund të mbajnë inserte prej 200–300 kb ose më pak. |
| Ndërtimi | |
| YAC ADN-ja është e vështirë për t'u pastruar e paprekur dhe kërkon përqendrim të lartë për gjenerimin e sistemit vektorial YAC. | BAC është e lehtë për t'u pastruar e paprekur dhe mund të ndërtohet lehtësisht. |
| Kimerizëm | |
| YAC janë shpesh kimerikë. | BAC janë rrallë kimerikë. |
| Stabilitet | |
| YAC është i paqëndrueshëm. | BAC është i qëndrueshëm. |
| Modifikime | |
| Rikombinimi i majave është shumë i realizueshëm dhe mbetet gjithmonë aktiv. Prandaj mund të gjenerojë fshirje dhe rirregullime të tjera në një YAC. | E. rikombinimi coli parandalohet dhe ndizet kur kërkohet. Prandaj, redukton rirregullimet e padëshiruara në BAC. |
| Mirëmbajtja | |
| Manipulimi i YAC-ve rekombinante zakonisht kërkon që YAC të transferohet në E. coli për manipulime të mëvonshme. Prandaj, është një proces i mundimshëm. | Modifikimi i BAC ndodh drejtpërdrejt në E. coli. Pra, nuk ka nevojë për transferim të ADN-së. Prandaj, procesi nuk është i mundimshëm. |
Përmbledhje – YAC vs Vektorët BAC
YAC është bërë një mjet thelbësor kërkimor në proceset e klonimit për shkak të aftësisë së tij për të klonuar fragmente të mëdha të ADN-së në organizmin pritës. Megjithatë, YAC-të kanë disa disavantazhe si vektorë si vështirësitë e ndërtimit, kimerizmi, paqëndrueshmëria, etj. Prandaj, për të kapërcyer këto probleme, shkencëtarët kanë zhvilluar vektorët BAC. BAC është ndërtuar duke përdorur rajone specifike të kromozomit E. coli. Është një vektor i qëndrueshëm dhe mund të ndërtohet lehtësisht. Megjithatë, gjatësia e ADN-së që BAC mund të trajtojë është deri në 20 herë më pak se ajo e YAC. Ky është ndryshimi midis sistemeve vektoriale YAC dhe BAC. Në ditët e sotme, BAC preferohet më shumë se YAC në laboratorë.
