Dallimi kryesor midis ligazës së ADN-së T4 dhe ligazës së ADN-së së E. coli është se ligaza e ADN-së T4 është një enzimë që është e izoluar nga bakteriofagu T4 ndërsa ligaza e ADN-së E. coli është një enzimë që është e izoluar nga bakteri E. coli.
Ligaza e ADN-së është një lloj specifik enzime që lehtëson bashkimin e vargjeve të ADN-së së bashku përmes formimit të një lidhje fosfodiesteri. Ai luan një rol të rëndësishëm duke riparuar këputjet me një fije dhe thyerje me dy fije në ADN-në e organizmave të gjallë. Për më tepër, ligaza e ADN-së përdoret si në riparimin e ADN-së ashtu edhe në replikimin e ADN-së. Përveç përdorimeve të mësipërme, ligaza e ADN-së ka gjithashtu përdorim të gjerë në eksperimentet e biologjisë molekulare, siç është teknologjia e ADN-së rekombinante. T4 ADN-ligaza dhe E. coli ADN-ligaza janë dy lloje të enzimave të ADN-ligazës.
Çfarë është T4 ADN Ligaza?
Ligaza T4 është një enzimë e bashkimit të ADN-së që është e izoluar nga bakteriofagu T4. Bakteriofagu T4 është një virus që infekton Escherichia coli. Enzima e ligazës T4 është ligaza e ADN-së më e përdorur në kërkimet laboratorike biologjike molekulare. Normalisht, ligaza T4 katalizon bashkimin e dy vargjeve kohezive ose me fund të hapur të ADN-së me dy fije midis grupeve 5'fosfate dhe 3' hidroksil të nukleotideve ngjitur. Ai gjithashtu mund të katalizojë bashkimin e ARN-së me një varg ADN ose ARN në një molekulë të dyfishtë. Megjithatë, kjo enzimë nuk do të bashkohet me acidet nukleike me një fije floku. Për më tepër, ajo gjithashtu mund të lidhë ADN me fund të hapur me efikasitet shumë më të madh se ligaza e ADN-së E. coli.
Figura 01: T4 ADN Ligaza
Kjo enzimë kërkon ATP si kofaktor. Disa eksperimente kërkimore të inxhinierisë gjenetike kanë prodhuar tashmë më shumë enzima aktive të ligazës së ADN-së sesa ligaza e ADN-së T4 e tipit të egër. Në një nga qasjet, ata krijuan një molekulë enzime të shkrirë duke krehur ligazën e ADN-së T4 në molekulën p50 ose NF-kB. Kjo enzimë e re e ligazës T4 ishte 160% më aktive në lidhjet me fund të hapur për qëllime klonimi sesa ligaza e ADN T4 e tipit të egër. Për më tepër, temperatura optimale për ligazën T4 ADN për të katalizuar më saktë reaksionin e lidhjes është 16 °C.
Çfarë është E Coli ADN Ligaza?
E. coli ADN-ligaza është një enzimë që është e izoluar nga bakteret E. coli. Gjeni përgjegjës për krijimin e ligazës së ADN-së E. coli është gjeni lig. ADN-ja e E. coli, ligaza, si dhe shumica e ligazave të ADN-së së prokariotëve, përdorin energjinë që fitohet nga NAD (dinukleotidi i adeninës nikotinamide) për të krijuar lidhjen fosfodiesterike.
Figura 02: E. Coli ADN Ligaza
E. coli ADN-ligaza është një enzimë lidhëse që mund të bashkojë fragmentet e ADN-së duke katalizuar formimin e lidhjeve fosfodiesterike midis fragmenteve të ADN-së me dy vargje që përmbajnë 5' skajet fosfate dhe 3' skajet hidroksil. Për më tepër, ai nuk lidh ADN-në me fund të hapur, përveç në kushte të veçanta, si p.sh. grumbullimi molekular me glikol polietileni. Ai gjithashtu nuk mund të bashkojë ARN-në me ADN-në në mënyrë efikase. Për më tepër, aktiviteti i ligazës së ADN-së E. coli mund të rritet nga prania e ADN polimerazës 1 në përqendrimin e duhur. Megjithatë, kur përqendrimi i enzimës së ADN polimerazës 1 është më i lartë, ajo ka efekte negative në aktivitetin e ligazës së ADN-së të E. coli.
Cilat janë ngjashmëritë midis T4 ADN Ligazës dhe E Coli ADN Ligazës?
- T4 ADN-ligaza dhe E-coli ADN-ligaza janë dy lloje të enzimave të ADN-ligazës.
- Të dyja janë proteina të përbëra nga aminoacide.
- Këto enzima katalizojnë formimin e një lidhjeje fosfodiesterike midis fundeve 5' fosfat dhe 3' hidroksil në ADN-në dupleks.
- Ata kanë përdorime të gjera në eksperimentet e biologjisë molekulare si teknologjia rekombinante e ADN-së.
Cili është ndryshimi midis T4 ADN Ligazës dhe E Coli ADN Ligazës?
T4 ADN-ligaza është një enzimë që është e izoluar nga bakteriofagu T4 ndërsa E. coli ADN-ligaza është një enzimë që është e izoluar nga bakteret E. coli. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis ligazës së ADN-së T4 dhe ligazës së ADN-së E. coli. Për më tepër, burimi i energjisë për ligazën e ADN-së T4 është ATP. Nga ana tjetër, burimi i energjisë për ligazën e ADN-së E. coli është NAD.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis T4 ADN-ligazës dhe ADN-ligazës E coli në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – T4 ADN Ligaza vs E Coli ADN Ligaza
Ligaza e ADN-së T4 dhe ligaza e ADN-së E. coli janë dy enzima që katalizojnë formimin e një lidhjeje fosfodiesterike ndërmjet skajeve 5' fosfat dhe 3' hidroksil në ADN-në dyfishe. Ligaza T4 është një enzimë që është e izoluar nga bakteriofagu T4 ndërsa ligaza e ADN-së E. coli është një enzimë që është e izoluar nga bakteret E. coli. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis ligazës së ADN-së T4 dhe ligazës së ADN-së E coli.
