Dallimi kryesor midis NAAT dhe PCR është se NAAT është një që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur disa mënyra, duke përfshirë reaksionin zinxhir polimerazë, zhvendosjen e vargut ose amplifikimin e ndërmjetësuar nga transkriptimi, ndërsa PCR është një metodë që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur vetëm çiklizëm termik.
Patogjenët identifikohen kryesisht nga amplifikimi i materialit të tyre gjenetik. Shumica e teknikave në këtë fushë fokusohen në zbulimin e materialit gjenetik të patogjenit duke amplifikuar sekuenca specifike në kohë reale. Prandaj, rezultatet prodhohen shumë shpejt në kontekstin diagnostik. NAAT, PCR, biosensori dhe LCR janë disa teknika të përdorura në laboratorë për të amplifikuar materialin gjenetik të patogjenit.
Çfarë është NAAT?
Testi i amplifikimit të acidit nukleik (NAAT) është një metodë në biologjinë molekulare që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur disa mënyra si reaksioni zinxhir i polimerazës, amplifikimi i zhvendosjes së vargut ose amplifikimi i ndërmjetësuar nga transkriptimi. Përforcimi i materialit gjenetik mund të bëhet gjithashtu përmes teknikave si një reaksion zinxhir lidhës dhe reaksion i ADN-së së degëzuar (ADN quantiplex b) në procedurën NAAT. NAAT përdor specifikën e çiftimit të bazës Watson-Crick. Në procedurën NAAT, një sondë me një zinxhir ose molekulë abetare hibridizohet me molekulën e synuar të ADN-së ose ARN-së. Prandaj, dizajni i fillesës së sondës është shumë domethënës për të rritur ndjeshmërinë dhe specifikën e zbulimit. Pastaj, hapi tjetër i NAAT amplifikon materialin gjenetik duke bërë shumë kopje të tij për zbulim.
Figura 01: NAAT
NAAT aktualisht aplikohet për zbulimin e disa patogjenëve si Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis dhe SARS-COV2. Për më tepër, testi NAAT është zhvilluar për të shkurtuar periudhën e dritares. Periudha e dritares është periudha kohore nga momenti kur një pacient është infektuar dhe kur ai shfaqet pozitiv nga testet e antitrupave. Për më tepër, metoda e shqyrtimit NAAT u miratua për herë të parë në 1999 nga FDA. NAAT ka shumë përparësi, duke përfshirë zbulimin e niveleve të ulëta të ADN-së ose ARN-së, ndjeshmërinë e lartë dhe specifikën e lartë.
Çfarë është PCR?
PCR është një metodë në biologjinë molekulare që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur vetëm ciklin termik. PCR është reaksioni zinxhir i polimerazës. Është një test për të zbuluar materialin gjenetik nga një organizëm specifik si bakteret, kërpudhat dhe viruset. Në diagnostikimin e sëmundjes, PCR zbulon praninë e një patogjeni nëse personi ka një patogjen në kohën e testit. Në diagnostikimin e sëmundjes, protokolli PCR ka disa hapa, duke përfshirë mbledhjen e mostrës, nxjerrjen e ADN-së, PCR dhe sekuencën. Në testimin e patogjenëve, mostra e mbledhur përdoret për nxjerrjen e materialit gjenetik (ADN ose ARN). Procedura PCR kërkon kimikate të veçanta, primerë dhe enzima në mënyrë që të prodhojë miliona kopje të materialit gjenetik brenda makinës PCR të quajtur ciklues termik. Pasi të përforcohet nga produkti PCR, patogjeni mund të zbulohet. Shkencëtarët përdorin softuer special për të interpretuar rezultatet.
Figura 02: PCR
Për më tepër, ekzistojnë lloje të ndryshme të PCR që përdoren aktualisht në hulumtim. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD dhe Nested PCR janë disa prej tyre. PCR është i dobishëm veçanërisht në zbulimin e faringitit (faringit streptokok), pneumonisë atipike (Chlymydia pneumoniae), fruthit (Morbillivirus), hepatitit (HBV) dhe infeksionit urogjenital ulceroz (Haemophilus ducreyi).
Cilat janë ngjashmëritë midis NAAT dhe PCR?
- NAAT dhe PCR janë dy metoda të rëndësishme biologjike molekulare që përdoren për të amplifikuar materialin gjenetik.
- Acidet nukleike (ADN ose ARN) përforcohen nga të dyja teknikat.
- Janë teknika të shpejta dhe të shpejta.
- Të dyja teknikat përdoren aktualisht për diagnostikimin e sëmundjes.
- Ato janë të shtrenjta se metodat konvencionale.
Cili është ndryshimi midis NAAT dhe PCR?
NAAT është një metodë në biologjinë molekulare që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur disa metoda, ndërsa PCR është një metodë në biologjinë molekulare që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur vetëm ciklin termik. NAAT përdor teknika të ndryshme të amplifikimit të materialit gjenetik si reaksioni zinxhir i polimerazës, amplifikimi i zhvendosjes së vargut, amplifikimi i ndërmjetësuar nga transkriptimi, reaksioni i zinxhirit të lidhjes dhe reaksioni i degëzuar i ADN-së (ADN quantiplex b). Nga ana tjetër, PCR përdor teknika të ndryshme të amplifikimit të materialit gjenetik si RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, Nested PCR. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis NAAT dhe PCR.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis NAAT dhe PCR në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – NAAT vs PCR
Ka mjete të ndryshme biologjike molekulare që përdoren në laboratorë për të amplifikuar materialet gjenetike. NAAT, PCR, biosensori dhe LCR janë disa teknika të tilla. NAAT është një teknikë biologjike molekulare që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur disa mënyra si reaksioni zinxhir i polimerazës, zhvendosja e vargut ose amplifikimi i ndërmjetësuar nga transkriptimi. PCR është një metodë në biologjinë molekulare që amplifikon materialin gjenetik duke përdorur ciklin termik. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis NAAT dhe PCR.
