Dallimi kryesor midis PCR me konsensus dhe PCR pan është se konsensus PCR gjithmonë synon rajonet e konservuara ndërsa Pan PCR synon rajone të ndryshueshme për të identifikuar shtame të ndryshme të një grupi
Reaksioni zinxhir i polimerazës (PCR) është një teknikë e amplifikimit të gjenit që përbëhet nga tre hapa kryesorë si denatyrimi, pjekja dhe shtrirja. Kjo përdoret gjerësisht në diagnostikimin dhe identifikimin molekular. Teknikat konsensus PCR dhe Pan PCR bazohen në objektivat primer që përdor çdo lloj PCR.
Çfarë është Consensus PCR?
Consensus PCR është një teknikë PCR që synon një rajon të konservuar për një specie ose gjini të veçantë. Prandaj, rajonet shumë të ruajtura janë zgjedhur për përforcim. Nëpërmjet kësaj metode, organizmat mund të identifikohen dhe dallohen në bazë të konsensusit të tyre. Kjo metodë identifikon një rajon të ruajtur për një specie të veçantë. Për shembull, rajoni 16s rRNA i baktereve mbetet një rajon i konservuar midis baktereve. Prandaj, kërkohet vetëm një grup primer për përforcim. Në shumicën e rasteve, një abetare universale specifike mund të përdoret për rajonin e konservuar.
Figura 01: Teknika PCR
Duke ndjekur një metodë konsensusi PCR, karakterizimi i specieve dhe marrëdhëniet evolucionare mund të nxirren. Bazuar në efikasitetin e amplifikimit të organizmit të caktuar të mostrës, mund të konkludohet edhe konsensusi i organizmit ndaj grupit. Më tej, kryerja e një PCR konsensusi është jetike në studimet filogjenetike. Ai lejon identifikimin e një specieje dhe interpreton devijimin e organizmit të caktuar në termat e paraardhësit të përbashkët.
Çfarë është Pan PCR?
Një Pan PCR është një mënyrë multipleksimi e PCR. Në këtë teknikë, shtame të ndryshme amplifikohen duke përdorur objektiva të ndryshëm primer. Objektivat, megjithatë, mund të jenë objektiva të zakonshëm për grupet e shtameve. Kështu, në Pan PCR, mund të përdoren më shumë se dy grupe primerësh në të njëjtën kohë. Mund të zhvillohet në një metodë reagimi me një tub ose si një metodë reagimi me shumë tuba. Pan PCR kërkon më shumë kohë dhe më komplekse në krahasim me një PCR me konsensus. Për këtë arsye, interpretimi i rezultateve të PCR mund të jetë gjithashtu më kompleks në Pan PCR.
Zbatimi kryesor i Pan PCR është në diagnostikimin molekular. Ai mundëson dallimin midis shtameve të ndryshme të një specieje nga amplifikimi i synuar. Pan PCR është një teknikë ideale për të identifikuar shtame të ndryshme të një specie të vetme që shkaktojnë një sëmundje. Në shumicën e rasteve, automatizimi i teknikave Pan PCR për kushte të ndryshme shëndetësore është shumë i rëndësishëm dhe është një teknikë e besueshme dhe shumë efikase.
Cilat janë ngjashmëritë ndërmjet Consensus PCR dhe Pan PCR?
- Consensus PCR dhe Pan PCR janë dy lloje teknikash PCR.
- Të dyja procedurat ndjekin procedurën e përgjithshme me tre hapa - denatyrimi, pjekja dhe zgjatja.
- Ata përdorin abetare që janë specifike për objektivin.
- Të dy reaksionet zhvillohen në një ciklues termik.
- Këto reagime mund të automatizohen.
- Të dyja mund të përdoren në diagnostikimin dhe identifikimin molekular; megjithatë, saktësia ndryshon.
- Këto procedura kërkojnë vërtetim.
Cili është ndryshimi midis Consensus PCR dhe Pan PCR?
Si Consensus dhe Pan PCR ndjekin të njëjtën procedurë rutinë. Sidoqoftë, ndryshimi kryesor midis PCR me konsensus dhe Pan PCR bazohet në objektivat e primerit që përdor çdo procedurë. Ndërsa PCR konsensusi synon gjithmonë rajone të konservuara, një Pan PCR synon rajone të ndryshueshme për të identifikuar shtame të ndryshme të një grupi. Për shkak të këtij ndryshimi, protokollet e projektimit të primerit, numri i grupeve të primerëve të përdorur dhe aplikimet specifike ndryshojnë.
Infografia e mëposhtme përmbledh ndryshimin midis Consensus PCR dhe Pan PCR.
Përmbledhje – Konsensus PCR vs Pan PCR
PCR, i prezantuar nga Mulli, luan një rol të rëndësishëm revolucionar në aplikimet e biologjisë molekulare. Consensus dhe Pan PCR janë dy lloje të PCR bazuar në rajonet e tyre të synuara të primerit. Ndërsa PCR me konsensus synon rajonet e konservuara, Pan PCR synon rajone të ndryshueshme dhe luan një rol të rëndësishëm në identifikimin e shtamit. Për shkak të këtij ndryshimi themelor midis PCR me konsensus dhe Pan PCR, funksionet specifike të secilit lloj të PCR ndryshojnë gjithashtu nga analiza filogjenetike në karakterizimin molekular në diagnostikimin molekular.
