Dallimi kryesor midis enzimave kufizuese EcoRI dhe HindIII është se EcoRI është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga E. coli, ndërsa HindIII është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga Haemophilus influenza.
Enzima kufizuese ose endonukleaza kufizuese është një enzimë që copëton ADN-në në fragmente në vende specifike njohjeje (vendet e kufizimit) brenda molekulës së ADN-së. Këto enzima kufizuese gjenden në baktere dhe arkea. Ato ofrojnë një mekanizëm mbrojtës kundër viruseve pushtuese. Enzimat kufizuese përgjithësisht klasifikohen në pesë lloje të ndryshme: tipi I, tipi II, tipi III, IV dhe tipi V. EcoRI dhe HindIII janë dy enzima kufizuese që i përkasin grupit të enzimave kufizuese të tipit II.
Çfarë janë enzimat kufizuese EcoRI?
EcoRI është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga speciet E.coli. Është një enzimë kufizuese që copëton spirale të dyfishta të ADN-së në fragmente në vende specifike. EcoRI është gjithashtu pjesë e sistemit të modifikimit të kufizimeve. EcoRI ishte enzima e parë që u izolua fillimisht nga soji RY13 i species E. coli. Përdoret si një enzimë kufizuese në biologjinë molekulare. EcoRI krijon 4 skaje ngjitëse nukleotide me mbingarkesa fundore 5' të AATT. EcoRI shkurton ADN-në në sekuencën specifike të njohjes G↓AATTC. Ka sekuencën plotësuese palindromike të CTTAA↓G. Për më tepër, kjo enzimë kufizuese i përket nënklasës së tipit II P (specifiteti palindromik). Në strukturën e tij parësore, EcoRI përmban motivin PD. D/EXK brenda zonës së tij aktive, si shumë enzima të tjera kufizuese.
Figura 01: EcoRI
Enzima kufizuese EcoRI është një homodimer i një 31 kDa. Ai përmban një domen globular të arkitekturës α/β. Çdo nënnjësi përmban një lak që del nga domeni globular dhe mbështillet rreth ADN-së kur lidhet. Kjo enzimë mund të kristalizohet me sekuencën që normalisht e pret. Për më tepër, enzima kufizuese EcoRI përdoret në një shumëllojshmëri të gjerë teknikash gjenetike molekulare, duke përfshirë klonimin, shqyrtimin e ADN-së dhe seksionet e fshirjes së kushteve in-vitro të ADN-së.
Cilat janë enzimat kufizuese HindIII?
HindIII është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga speciet Haemophilus influenza. Ai copëton sekuencën palindromike të ADN-së AACCTT në prani të kofaktorit Mg2+ nëpërmjet hidrolizës. Ndarja e kësaj sekuence të veçantë midis AA'S (5'A↓ACCTT3' dhe 3'TTCGA↓A5') rezulton në mbivarje 5' në molekulën e ADN-së të quajtur skajet ngjitëse. Kjo enzimë gjendet në organizmat prokariotikë si bakteret. Bakteret e përdorin këtë enzimë si një mekanizëm mbrojtës kundër viruseve si bakterofagët.
Figura 02: HindIII
Strukturisht, HindIII është një homodimer. Ai përmban një bërthamë të përbashkët strukturore që përfshin katër fletë β dhe një spirale α të vetme, si llojet e tjera të enzimave kufizuese II. Masa molekulare e kësaj enzime është 34,9 kDa. Për më tepër, HindIII është shumë i dobishëm në eksperimentet moderne të shkencës biologjike molekulare, të tilla si renditja e ADN-së dhe hartëzimi.
Cilat janë ngjashmëritë midis enzimave kufizuese EcoRI dhe HindIII?
- EcoRI dhe HindIII janë dy enzima kufizuese që i përkasin grupit të enzimave kufizuese të tipit II.
- EcoRI dhe HindIII u gjetën në fillim të viteve 1970.
- EcoRI dhe HindIII përmbajnë të dyja motivin e sekuencës së aminoacideve PD.. D/EXK.
- Të dyja enzimat kufizuese kryejnë ndarje shumë specifike të ADN-së.
- Këto enzima kufizuese kanë nevojë për Mg2+ si një kofaktor për aktivitetin e tyre specifik.
- Ato prodhojnë skaje ngjitëse pas prerjes së ADN-së.
- Ato janë komponentë shumë të dobishëm në kërkimet moderne biologjike molekulare.
Cili është ndryshimi midis enzimave kufizuese EcoRI dhe HindIII?
EcoRI është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga speciet E.coli, ndërsa HindIII është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga speciet Haemophilus influenza. Kështu, ky është ndryshimi kryesor midis EcoRI dhe HindIII. Për më tepër, EcoRI shkurton ADN-në në sekuencën specifike të njohjes G↓AATTC, ndërsa HindIII shkurton ADN-në në sekuencën specifike të njohjes A↓ACCTT.
Infografia e mëposhtme paraqet ndryshimet midis EcoRI dhe HindIII në formë tabelare për krahasim krah për krah.
Përmbledhje – Enzimat kufizuese EcoRI vs HindIII
EcoRI dhe HindIII janë dy enzima kufizuese që i përkasin nënklasës p të tipit II. Ata kryejnë ndarje shumë specifike të ADN-së. EcoRI është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga speciet E.coli, ndërsa HindIII është një enzimë kufizuese e tipit II që është e izoluar nga speciet Haemophilus influenza. Pra, kjo përmbledh ndryshimin midis EcoRI dhe HindIII.
