Dallimi kryesor midis elektroforezës së xhelit 1D dhe 2D është vetitë e përdorura për ndarjen e proteinave në elektroforezën e xhelit. Elektroforeza me xhel 1D ndan vetëm proteinat në bazë të peshës molekulare ndërsa elektroforeza 2D e xhelit ndan proteinat bazuar në pikën e saj iso-elektrike dhe peshën molekulare.
Ndarja e proteinave me elektroforezë me xhel është një teknikë e rëndësishme për të karakterizuar proteinat. Proteinat kanë veti të ndryshme; prandaj, ndarja është më komplekse në krahasim me ndarjen e ADN-së me elektroforezë me xhel Agarose.
Çfarë është Elektroforeza me Xhel 1D?
Elektroforeza me xhel 1D, e njohur gjithashtu si elektroforeza xhel me një dimension, është një metodë e ndarjes së proteinave bazuar në peshën molekulare. Ndarja e proteinave bëhet kryesisht duke përdorur elektroforezë me xhel poliakrilamid. Bazuar në konceptin e elektroforezës së xhelit, molekulat ndahen sipas vetive të tyre të peshës dhe ngarkesës molekulare.
Prandaj, për t'i dhënë një ngarkesë uniforme proteinave, trajtimi me dodecil sulfat natriumi (SDS) bëhet përpara elektroforezës me xhel. SDS denatyron proteinat dhe siguron një ngarkesë negative uniforme në proteinë; kur bëhet aplikimi i fushës elektrike, proteinat migrojnë në terminalin pozitiv bazuar në peshën e tyre molekulare. Kështu, në ndarje, merret parasysh vetëm një pronë. Kjo është arsyeja pse kjo metodë quhet elektroforezë xhel 1D.
Figura 01: Elektroforeza xhel 1D
Gjatë elektroforezës me xhel 1D, proteinat ndahen në bazë të peshës së tyre molekulare. Në këtë drejtim, molekulat me peshë më të ulët migrojnë më shpejt në xhel në krahasim me proteinat me peshë të lartë molekulare. Kështu, proteinat me peshë të lartë mbeten afër puseve.
Çfarë është elektroforeza me xhel 2D?
Elektroforeza me xhel 2D ose elektroforeza dydimensionale e xhelit ndan proteinat bazuar në dy veti. Dy vetitë janë pika izo-elektrike e proteinës dhe pesha molekulare. Kjo metodë e ndarjes së proteinave rrit rezolucionin e ndarjes së proteinave. Pika izo-elektrike e proteinës varet nga pH në të cilin proteina është neutrale.
Figura 02: Elektroforeza xhel 2D
Kështu, në elektroforezën me xhel 2D, proteina lejohet të funksionojë në një gradient të pH fiks në dimensionin e parë. Në dimensionin e dytë, proteinat ndahen duke përdorur elektroforezë me xhel poliakrilamid vertikal ose horizontal. Kështu, proteinat ndahen sipas peshës së tyre molekulare në dimensionin e dytë.
Përveç kësaj, kjo metodë e elektroforezës me xhel rrit rezolucionin e ndarjes së proteinave. Prandaj, proteinat e ndara janë më të pastra. Megjithatë, kostoja e teknikës është shumë më e lartë se elektroforeza me xhel me një dimension.
Cilat janë ngjashmëritë midis elektroforezës xhel 1D dhe 2D?
- Të dyja teknikat ndajnë proteinat.
- Prandaj, ato janë të rëndësishme në karakterizimin e proteinave.
Cili është ndryshimi midis elektroforezës xhel 1D dhe 2D?
Dallimi kryesor midis elektroforezës së xhelit 1D dhe 2D është se elektroforeza me xhel 1D ndan proteinat bazuar vetëm në peshën molekulare ndërsa elektroforeza e xhelit 2D ndan proteinat bazuar në pikën iso-elektrike dhe në peshën molekulare. Për shkak të këtij ndryshimi themelor midis elektroforezës së xhelit 1D dhe 2D, zgjidhja e ndarjes së proteinave dhe kostoja e dy teknikave gjithashtu ndryshojnë. Elektroforeza me xhel 2D tregon rezolucion të lartë sesa elektroforeza me xhel 1D. Megjithatë, elektroforeza me xhel 2D është më e kushtueshme se elektroforeza me xhel 1D.
Infografia e mëposhtme përmbledh ndryshimin midis elektroforezës së xhelit 1D dhe 2D.
Përmbledhje – Elektroforezë xhel 1D vs 2D
Ndarja e proteinave varet nga shumë faktorë. Elektroforeza me xhel 1D ndan proteinat bazuar vetëm në peshën molekulare. Megjithatë, elektroforeza me xhel dydimensionale ose 2D rrit rezolucionin e ndarjes së proteinave. Më tej, elektroforeza me xhel 2D ndan proteinat bazuar në pikën izo-elektrike dhe peshën molekulare. Prandaj, këto të dhëna janë të rëndësishme për përpunimin në rrjedhën e poshtme të proteinave dhe në fushën e proteomikës. Kështu, kjo është përmbledhja e ndryshimit midis elektroforezës së xhelit 1D dhe 2D.
