Dallimi kryesor midis serinës dhe tirozinës rekombinazës është se në serinë rekombinazën, serina është aminoacidi nukleofilik i përdorur nga enzima për të sulmuar ADN-në gjatë rikombinimit specifik të zonës, ndërsa në rekombinazën e tirozinës, tirozina është aminoacidi nukleofilik i përdorur. nga enzima për të sulmuar ADN-në gjatë rikombinimit specifik të vendit.
Rikombinimi specifik i vendit (rikombinimi konservativ i vendndodhjes specifike) është një lloj teknikë e rikombinimit gjenetik ku shkëmbimi i vargut të ADN-së ndodh ndërmjet segmenteve që kanë një shkallë të caktuar të homologjisë së sekuencës. Rekombinazat specifike të vendit rregullojnë procesin e rikombinimit specifik të vendit. Këto enzima grupohen në dy familje si familja e rekombinazës serine dhe familja e rekombinazës së tirozinës. Emrat vijnë nga mbetja e ruajtur e aminoacideve nukleofilike e pranishme në dy klasat e mësipërme të rekombinazave, e cila përdoret për të sulmuar ADN-në dhe që lidhet në mënyrë kovalente me të gjatë shkëmbimit të vargut në rikombinimin specifik të vendit.
Çfarë është Serine Rekombinaza?
Në metodën e rikombinimit specifik të vendit, dy sekuenca të shkurtra të ADN-së ('vendet e synuara') priten në pika specifike në të dy vargjet dhe skajet e prera ribashkohen me partnerë të rinj. Teknologjitë e rikombinimit specifik të vendit janë mjete gjenomike në inxhinierinë gjenetike që varen nga enzimat e rekombinazës për të zëvendësuar seksionin e synuar të ADN-së. Shumë sisteme rikombinimi specifike të vendit janë gjetur për të kryer këto rirregullime të ADN-së për qëllime të ndryshme. Por të gjitha këto enzima të rekombinazës i përkasin dy familjeve. Serine rekombinaza është një prej tyre. Ato mund të ndërmjetësojnë deri në tre lloje të rirregullimeve të ADN-së: integrimin, heqjen dhe përmbysjen.
Figura 01: Serine Rekombinaza
Rekombinazat specifike të vendit si rekombinaza e serinës kryejnë rirregullimin e ADN-së duke njohur dhe lidhur me një sekuencë të shkurtër të ADN-së (vendin e synuar), në të cilën ato çajnë shtyllën kurrizore të ADN-së. Më vonë, ndodh shkëmbimi i dy helikave të ADN-së dhe bëhet ribashkimi i vargjeve të ADN-së. Në serinë rekombinazën, serina është aminoacidi që përdoret nga enzima për të sulmuar ADN-në gjatë rikombinimit specifik të vendit. Gjatë ndarjes së ADN-së, lidhja protein-ADN formohet nëpërmjet një reaksioni transesterifikimi. Lidhja fosfodiesterike zëvendësohet nga lidhja fosfoserine midis grupit 5'fosfat në vendin e ndarjes dhe grupit hidroksil të një mbetje serine të konservuar. Lidhja e re ruan energjinë që shpenzohet në ndarjen e ADN-së në vendin e synuar. Kjo energji përdoret më vonë për ribashkimin e ADN-së me grupin korrespondues hidroksil të deoksiribozës në vendin tjetër. Shembuj të rekombinazave të serinës janë resolvazat/invertazat e serinës dhe integrazat e serinës.
Çfarë është Tirozin Rekombinaza?
Tyrosine rekombinaza është klasa tjetër e enzimës që rregullon rikombinimin konservativ të zonës specifike. Siç u përshkrua më parë, tirozina rekombinaza kryen gjithashtu rirregullimin e ADN-së në të njëjtën mënyrë duke njohur dhe lidhur me një sekuencë të shkurtër të ADN-së (vendin e synuar), në të cilën ata çajnë shtyllën kurrizore të ADN-së. Më vonë, bëhet shkëmbimi i dy spiraleve të ADN-së dhe ribashkimi i vargjeve të ADN-së.
Figura 02: Tirozin Rekombinaza
Por në rekombinazën e tirozinës, tirozina është aminoacidi që përdoret nga enzima për të sulmuar ADN-në gjatë rikombinimit specifik të vendit. Tipari i përbashkët i kësaj klase është një mbetje e konservuar e tirozinës nukleofile që sulmon ADN-fosfatin e prerë për të formuar një lidhje 3'-fosfotirozine. Rekombinazat e tirozinës (A1) dhe integrazat e tirozinës (A2) janë grupet e njohura të enzimave në familjen e enzimave të tirozinës rekombinazës.
Cilat janë ngjashmëritë midis serinës dhe tirozinës rekombinazës?
- Ato janë një klasë e enzimave të rekombinazës.
- Të dyja rregullojnë rikombinimin specifik të faqes.
- Ato janë proteina.
- Reaksioni kimik bazë është i njëjtë për të dyja.
- Të dyja katalizojnë reaksionet e transesterifikimit.
Cili është ndryshimi midis serinës dhe tirozinës rekombinazës?
Në serinë rekombinazën, serina është aminoacidi nukleofilik që përdoret nga enzima për të sulmuar ADN-në gjatë rikombinimit specifik të vendit. Nga ana tjetër, në rekombinazën e tirozinës, tirozina është aminoacidi nukleofilik që përdoret nga enzima për të sulmuar ADN-në gjatë rikombinimit specifik të vendit. Pra, ky është ndryshimi kryesor midis serinës dhe tirozinës rekombinazës. Karakteristika e përbashkët e serine rekombinazës është se ajo formon një lidhje fosfoserine me ADN-në, ndërsa tirozina rekombinaza formon një lidhje fosfotirozine me ADN-në gjatë procesit të rikombinimit të vendit specifik.
Infografia e mëposhtme liston ndryshimet midis serinës dhe tirozinës rekombinazës në formë tabelare.
-
Dallimi midis serinës dhe tirozinës rekombinazës në formë tabelare
Përmbledhje – Serina vs Tirosine Rekombinaza
Rikombinimi mund të ndodhë ndërmjet molekulave të ngjashme të ADN-së si në rikombinimin e homologëve ose molekulave të ndryshme si në rikombinimin johomolog. Rikombinimi specifik i vendit është një lloj rikombinimi gjenetik në të cilin shkëmbimi i vargut të ADN-së ndodh midis segmenteve që kanë të paktën një shkallë të caktuar të homoologjisë së sekuencës. Katalizohet nga rekombinazat. Shumica e rekombinazave grupohen në dy familje: serine rekombinaza dhe tirozina rekombinaza. Rekombinaza e serinës përdor serinë si aminoacidin nukleofilik për të sulmuar ADN-në gjatë procesit të rikombinimit specifik të vendit. Rekombinaza e tirozinës përdor tirozinën si aminoacid nukleofilik për të sulmuar ADN-në gjatë procesit të rikombinimit specifik të vendit. Prandaj, ky është ndryshimi kryesor midis serinës dhe tirozinës rekombinazës.
